GMFB在氧化應(yīng)激誘導(dǎo)的ARPE19細(xì)胞中的表達(dá)及意義
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【摘要】:目的探討膠質(zhì)細(xì)胞成熟因子beta(GMFB)在氧化應(yīng)激誘導(dǎo)的ARPE19細(xì)胞中的表達(dá)及意義。方法用0、0.25、0.5、1、2 mmol乙二醛處理ARPE19細(xì)胞24 h,其中對(duì)照組用0 mmol/L乙二醛處理,實(shí)驗(yàn)組以0.25~2 mmol/L乙二醛處理,用Western印跡法檢測(cè)GMFB的表達(dá);實(shí)驗(yàn)組用1μg/ml GMFB處理ARPE19細(xì)胞24 h,對(duì)照組不做處理,進(jìn)行RNAseq,比較實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組基因表達(dá)的差異,選取其中表達(dá)差異大于1.5倍且P0.05的基因作為差異表達(dá)的基因,對(duì)其進(jìn)行GO及KEGG富集分析。結(jié)果經(jīng)乙二醛處理的各組ARPE19細(xì)胞GMFB表達(dá)上調(diào),以0.5 mmol/L處理組的GMFB上調(diào)最為顯著。對(duì)GMFB處理的ARPE19細(xì)胞進(jìn)行全基因表達(dá)譜檢測(cè),結(jié)果顯示,在被檢測(cè)的19 966個(gè)基因中,實(shí)驗(yàn)組和正常組間有顯著差異表達(dá)(改變1.5倍)的基因有583個(gè)。與對(duì)照組相比,實(shí)驗(yàn)組基因表達(dá)顯著上調(diào)的有265個(gè),下調(diào)的有318個(gè)。GO分析表明,GMFB與細(xì)胞代謝、細(xì)胞催化等生物過程相關(guān)。KEGG分析顯示,GMFB與細(xì)胞代謝通路、癌癥通路、Wnt信號(hào)通路、趨化因子信號(hào)通路等多條信號(hào)通路密切相關(guān)。炎癥基因CCL26、CXCL8和NF-κB1表達(dá)升高,提示GMFB與炎癥相關(guān)。結(jié)論 GMFB在氧化應(yīng)激誘導(dǎo)的ARPE19細(xì)胞中表達(dá)明顯上調(diào),GMFB可能影響細(xì)胞間連接,參與Wnt信號(hào)通路、腫瘤相關(guān)信號(hào)通路和趨化因子信號(hào)通路等。
【作者單位】: 同濟(jì)大學(xué)醫(yī)學(xué)院再生醫(yī)學(xué)系;同濟(jì)大學(xué)醫(yī)學(xué)院干細(xì)胞研究中心;
【關(guān)鍵詞】: 氧化應(yīng)激 膠質(zhì)細(xì)胞成熟因子beta 視網(wǎng)膜色素上皮細(xì)胞
【基金】:上海市衛(wèi)生和計(jì)劃生育委員會(huì)項(xiàng)目(201640229)
【分類號(hào)】:R774.5
【正文快照】: groups,the genes with expression difference fold1.5 times and P0.05 were selected as candidate genesfor GO enrichment analysis and KEGG analysis.Results In the ARPE19 cells under the treatments ofdifferent concentrations of glyoxal,GMFB expression leve
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本文編號(hào):973915
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