本文關(guān)鍵詞：基于蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)的鼻咽癌基因模塊化分析

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【摘要】：目的基于蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò),篩選調(diào)節(jié)鼻咽癌的基因模塊,為鼻咽癌的分子診斷和治療提供新的靶點(diǎn)。方法利用GEO數(shù)據(jù)庫(kù)中鼻咽癌的數(shù)據(jù)集(GSE12452)和SAM軟件,篩選鼻咽癌中差異表達(dá)基因。利用String數(shù)據(jù)庫(kù),建立鼻咽癌中差異表達(dá)基因的蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)�；跇�(gòu)建的網(wǎng)絡(luò),利用生物信息學(xué)模塊化分析方法篩選在鼻咽癌發(fā)生發(fā)展過(guò)程中起重要作用的基因模塊。根據(jù)DAVID數(shù)據(jù)庫(kù),對(duì)模塊進(jìn)行GO分析,挖掘模塊的調(diào)控功能。結(jié)果本次研究中共篩選出在鼻咽癌中差異表達(dá)的基因2 634個(gè)。根據(jù)String數(shù)據(jù)庫(kù),我們發(fā)現(xiàn)這些差異基因中共有4 729對(duì)蛋白質(zhì)互作對(duì),并據(jù)此建立鼻咽癌中的蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)。利用模塊化分析篩選出蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)中的7個(gè)基因模塊,GO分析顯示這些模塊的功能主要為調(diào)控細(xì)胞周期、糖代謝、細(xì)胞黏附、氧化還原反應(yīng)等。結(jié)論鼻咽癌的蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)中共有7個(gè)基因模塊,它們對(duì)鼻咽癌的發(fā)生發(fā)展具有重要的調(diào)控作用,這些功能模塊的發(fā)現(xiàn)能夠?yàn)楸茄拾┑姆肿影邢蛟\治提供新的切入點(diǎn)。
【作者單位】： 內(nèi)蒙古醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院耳鼻咽喉科;
【關(guān)鍵詞】： 鼻咽癌 蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò) 基因模塊化分析
【基金】：內(nèi)蒙古自治區(qū)自然科學(xué)基金(2014MS0856) 內(nèi)蒙古醫(yī)科大學(xué)科技百萬(wàn)工程項(xiàng)目(KJbw2013014)
【分類號(hào)】：R739.63
【正文快照】： 鼻咽癌是發(fā)生在鼻咽上皮或鼻咽隱窩上皮的惡性腫瘤。由于解剖位置深、結(jié)構(gòu)復(fù)雜、病理分化程度低、易轉(zhuǎn)移等因素,70%鼻咽癌患者在確診時(shí)已達(dá)Ⅲ、Ⅳ期。放射治療是鼻咽癌的主要治療手段,但是單一的放射治療只能使鼻咽癌患者的5年生存率達(dá)到50%左右,晚期鼻咽癌則更低[1-2]。研究

【相似文獻(xiàn)】

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