老年性聾小鼠內(nèi)耳突觸調(diào)控鉀通道基因的篩選與鑒定
發(fā)布時(shí)間:2022-02-19 12:46
目的通過(guò)篩選內(nèi)耳突觸調(diào)控基因,探索老年性聾發(fā)生過(guò)程中突觸損傷特點(diǎn)。方法利用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)檢測(cè)成年組(4周)和老年組(40周)C57BL/6J小鼠內(nèi)耳基底膜,篩選差異表達(dá)基因(differentially expression genes, DEGs)。分析DEGs基因本體(GO)功能富集,京都基因和基因組百科全書(shū)(KEGG)通路富集情況,并篩選突觸調(diào)控差異基因,最后利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR及免疫熒光染色驗(yàn)證結(jié)果。結(jié)果共篩選出3 267個(gè)DEGs,其中下調(diào)1 521個(gè),上調(diào)1 746個(gè)(FC≥1.5,P<0.05)。功能富集顯示,下調(diào)基因主要參與電壓門(mén)控離子通道活性調(diào)控和突觸調(diào)控,上調(diào)基因主要參與免疫調(diào)控。篩選出突觸調(diào)控基因64個(gè),其中6個(gè)鉀通道基因Kcnq2,Kcnk3,Kcnmb4,Kcnk9,Kcnh5,Kcnc2富集度最高。qRT-PCR驗(yàn)證了6個(gè)調(diào)控突觸的鉀通道基因在不同年齡組內(nèi)耳的差異表達(dá);免疫熒光顯示KCNQ2、KCNMB4在老年鼠內(nèi)耳表達(dá)明顯下降。結(jié)論篩選了老年性聾突觸調(diào)控基因,其中6個(gè)鉀通道基因表達(dá)明顯下降,可能是導(dǎo)致老年性聾突觸改變的重要因素。
【文章來(lái)源】:第三軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào). 2020,42(08)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
1.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
1.2.1 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
1.2.2 GO數(shù)據(jù)庫(kù)和KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)分析
1.2.3 實(shí)時(shí)熒光定量PCR
1.2.4 免疫熒光染色
1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
2 結(jié)果
2.1 內(nèi)耳基底膜DEGs分析
2.2 GO,KEGG分析揭示DEGs功能及通路
2.3 突觸調(diào)控基因
2.4 qRT-PCR
2.5 免疫熒光
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]老年性聾小鼠耳蝸帶狀突觸損傷特點(diǎn)及機(jī)制研究[J]. 魏薇,楊麗輝,熊偉,柳柯,馬秀嵐,龔樹(shù)生,杜政德. 中華耳科學(xué)雜志. 2019(02)
[2]年齡相關(guān)聽(tīng)力損失DBA/2J小鼠耳蝸毛細(xì)胞馬達(dá)蛋白-prestin表達(dá)下調(diào)與耳聾的關(guān)系[J]. 李勝利,武坤毅,任曉勇. 中華耳科學(xué)雜志. 2018(04)
[3]C57BL/6J小鼠隨年齡增長(zhǎng)耳蝸內(nèi)毛細(xì)胞帶狀突觸數(shù)量變化的觀察[J]. 李曉瑞,蔣興旺,張延平. 聽(tīng)力學(xué)及言語(yǔ)疾病雜志. 2015(02)
本文編號(hào):3632924
【文章來(lái)源】:第三軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào). 2020,42(08)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
1.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
1.2.1 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
1.2.2 GO數(shù)據(jù)庫(kù)和KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)分析
1.2.3 實(shí)時(shí)熒光定量PCR
1.2.4 免疫熒光染色
1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
2 結(jié)果
2.1 內(nèi)耳基底膜DEGs分析
2.2 GO,KEGG分析揭示DEGs功能及通路
2.3 突觸調(diào)控基因
2.4 qRT-PCR
2.5 免疫熒光
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]老年性聾小鼠耳蝸帶狀突觸損傷特點(diǎn)及機(jī)制研究[J]. 魏薇,楊麗輝,熊偉,柳柯,馬秀嵐,龔樹(shù)生,杜政德. 中華耳科學(xué)雜志. 2019(02)
[2]年齡相關(guān)聽(tīng)力損失DBA/2J小鼠耳蝸毛細(xì)胞馬達(dá)蛋白-prestin表達(dá)下調(diào)與耳聾的關(guān)系[J]. 李勝利,武坤毅,任曉勇. 中華耳科學(xué)雜志. 2018(04)
[3]C57BL/6J小鼠隨年齡增長(zhǎng)耳蝸內(nèi)毛細(xì)胞帶狀突觸數(shù)量變化的觀察[J]. 李曉瑞,蔣興旺,張延平. 聽(tīng)力學(xué)及言語(yǔ)疾病雜志. 2015(02)
本文編號(hào):3632924
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