Annexin A1相互作用蛋白的篩
發(fā)布時(shí)間:2017-05-11 19:00
本文關(guān)鍵詞:Annexin A1相互作用蛋白的篩選、鑒定及蛋白分子網(wǎng)絡(luò)圖譜的繪制,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:[目的]篩選與鑒定鼻咽癌細(xì)胞中Annexin A1的相互作用蛋白,繪制其在鼻咽癌侵襲轉(zhuǎn)移中的調(diào)控蛋白質(zhì)分子網(wǎng)絡(luò)圖譜,初步了解Annexin A1在鼻咽癌侵襲轉(zhuǎn)移中的作用與機(jī)制。[方法]收集Annexin A1高表達(dá)的低轉(zhuǎn)移鼻咽癌6-10B細(xì)胞總蛋白,采用免疫共沉淀結(jié)合凝膠電泳分離Annexin A1相互作用蛋白,二維液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜鑒定相互作用蛋白,并進(jìn)行基因本體論、功能聚類(lèi)、信號(hào)通路、蛋白-蛋白相互作用等生物信息學(xué)分析,繪制Annexin A1在鼻咽癌侵襲轉(zhuǎn)移中的調(diào)控蛋白質(zhì)分子網(wǎng)絡(luò)圖譜。運(yùn)用免疫共沉淀結(jié)合蛋白質(zhì)印跡法對(duì)Annexin A1關(guān)鍵相互作用組蛋白S100A9、Vimentin進(jìn)行驗(yàn)證。[結(jié)果]1、采用免疫共沉淀結(jié)合質(zhì)譜分析,在鼻咽癌6-10B細(xì)胞中共鑒定了436個(gè)Annexin A1相互作用蛋白。2、通過(guò)GOTERM_BP分析顯示:Annexin A1相互作用蛋白的生物學(xué)過(guò)程主要涉及到刺激反應(yīng)、蛋白定位、細(xì)胞代謝過(guò)程等;GOTERM_MF分析顯示:Annexin A1相互作用蛋白的分子功能主要涉及到催化作用、陽(yáng)離子結(jié)合功能、蛋白結(jié)合功能、核苷酸結(jié)合、細(xì)胞骨架及ATP結(jié)合功能等;GOTERM_CC分析顯示:Annexin A1相互作用蛋白的定位涉及到細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞器、細(xì)胞膜及細(xì)胞骨架等多個(gè)部位。3、通過(guò)功能聚類(lèi)分析顯示:Annexin A1相互作用蛋白可聚類(lèi)成21個(gè)功能相關(guān)簇,其功能主要涉及到鈣依賴(lài)性磷脂結(jié)合、信號(hào)肽、膜的組分、跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)、蛋白激酶活性、胞質(zhì)囊泡的組分、細(xì)胞骨架組織。4、通過(guò)KEGG和Biocarta信號(hào)通路分析顯示:Annexin A1相互作用蛋白涉及35條KEGG信號(hào)通路和7條Biocarta信號(hào)通路,其中有4個(gè)蛋白涉及到細(xì)胞骨架信號(hào)通路,9個(gè)蛋白涉及到粘附連接信號(hào)通路,12個(gè)蛋白涉及到跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)信號(hào)通路。5、通過(guò)蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)分析顯示:S100A9、Vimentin蛋白與Annexin A1形成相互作用組。6、應(yīng)用免疫共沉淀結(jié)合蛋白質(zhì)印跡法證實(shí)S100A9、Vimentin與Annexin A1三者能形成復(fù)合物,與質(zhì)譜結(jié)果一致。[結(jié)論]Annexin A1與S100A9和Vimentin存在相互作用,并且可能通過(guò)Annexin A1/S100A9/Vimentin相關(guān)信號(hào)通路影響鼻咽癌的侵襲和轉(zhuǎn)移。
【關(guān)鍵詞】:Annexin A1 鼻咽癌 蛋白-蛋白相互作用
【學(xué)位授予單位】:南華大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類(lèi)號(hào)】:R739.63
【目錄】:
- 摘要4-6
- Abstract6-9
- 縮略語(yǔ)表9-10
- 第1章 緒論10-12
- 第2章 實(shí)驗(yàn)材料與實(shí)驗(yàn)方法12-28
- 2.1 實(shí)驗(yàn)材料12-17
- 2.2 實(shí)驗(yàn)方法17-28
- 第3章 實(shí)驗(yàn)結(jié)果28-100
- 3.1 Annexin A1 相互作用蛋白的分離28-29
- 3.2 二維液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜結(jié)合ProteinPilot~(TM)4.5軟件進(jìn)行29-50
- 3.3 Annexin A1相互作用蛋白的生物信息學(xué)分析50-97
- 3.4 免疫共沉淀結(jié)合免疫印跡驗(yàn)證 Annexin A1 相互作用蛋白97-100
- 第4章 討論100-104
- 第5章 結(jié)論104-106
- 參考文獻(xiàn)106-112
- 文獻(xiàn)綜述112-120
- 參考文獻(xiàn)117-120
- 攻讀碩士學(xué)位期間科研成果120-122
- 資助科研的基金項(xiàng)目122-124
- 致謝124-125
【參考文獻(xiàn)】
中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條
1 梁博偉;趙勁民;殷國(guó)前;胡峰;;膜聯(lián)蛋白A1生理功能的研究進(jìn)展[J];蛇志;2012年02期
本文關(guān)鍵詞:Annexin A1相互作用蛋白的篩選、鑒定及蛋白分子網(wǎng)絡(luò)圖譜的繪制,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
本文編號(hào):357834
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