目的對1例Waardenburg綜合征2型先證者及其家系成員進行基因測序分析,探討其可能的分子生物學病因,進一步探討Waardenburg綜合征2型的分子遺傳學特征。方法對所收集家系進行臨床診斷,提取家系成員的外周血DNA,目標基因進行區(qū)域捕獲測序,擴增的PCR產(chǎn)物酶切后進行測序分析,利用軟件及遺傳學網(wǎng)站的信息分析數(shù)據(jù)。結(jié)果先證者存在SOX10基因雜合突變c.346C>T（p.Q116X）,該突變?yōu)闊o義突變,可能造成蛋白截短體,經(jīng)家系驗證分析,先證者父母該位點均無變異,此變異為新發(fā)突變,保守性分析提示具有高度保守性,多個物種氨基酸序列一致。結(jié)論 SOX10基因c.346C>T（p.Q116X）在此Waardenburg綜合征2型一家系為一新發(fā)突變位點,該突變可能造成蛋白截短,進而影響SOX10基因功能,該結(jié)果為進一步深入研究Waardenburg綜合征,了解SOX10基因功能提供了線索。 

【文章來源】：中華耳科學雜志. 2020,18(05)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：4 頁

【部分圖文】：

家系圖譜

高通量測序結(jié)果顯示先證者位于SOX10基因的2號外顯子發(fā)生一處雜合突變，c.346C>T(p.Q116X），即編碼區(qū)第346號核苷酸由胞嘧啶變異為胸腺嘧啶，造成氨基酸改變p.Q116X，即116位的谷氨酰胺轉(zhuǎn)變?yōu)榻K止密碼子，導致基因編碼蛋白截斷，從而喪失功能。HGMD數(shù)據(jù)庫未有該位點的相關(guān)性報道，Clin Var數(shù)據(jù)庫無該位點致病性分析結(jié)果；c.346C>T的CADD預測Raw Score為6.787656,PHRED分值為36，預測結(jié)果為“致病性”變異（圖2）。生物信息學蛋白功能預測軟件SIFT、Poly‐Phen＿2、Mutation Taster、GERP++、REVEL分別預測分別為未知、未知、有害、有害和未知(具體見表1)。根據(jù)ACMG指南[5,6]，該變異初步判定為致病性變異（Pathogenic），判定證據(jù)級別為PVS1+PS2+PM2。經(jīng)家系驗證分析，先證者父母該位點均無變異，此變異為新發(fā)突變（圖3）。保守性分析提示具有高度保守性，多個物種氨基酸序列一致（圖4）。

生物信息學蛋白功能預測軟件SIFT、Poly‐Phen＿2、Mutation Taster、GERP++、REVEL分別預測分別為未知、未知、有害、有害和未知(具體見表1)。根據(jù)ACMG指南[5,6]，該變異初步判定為致病性變異（Pathogenic），判定證據(jù)級別為PVS1+PS2+PM2。經(jīng)家系驗證分析，先證者父母該位點均無變異，此變異為新發(fā)突變（圖3）。保守性分析提示具有高度保守性，多個物種氨基酸序列一致（圖4）。圖4 p.Q116X在多個物種中具有高度的序列保守性

【參考文獻】：
期刊論文
[1]SOX10基因在內(nèi)耳發(fā)育中的作用[J]. 郝青青,侯琨,鐘玲玲,任巍,郭維維,楊仕明.  中華耳科學雜志. 2017(02)
[2]SOX10基因在Waardenburg綜合征發(fā)病中的作用研究進展[J]. 張華,馮永.  中華耳鼻咽喉頭頸外科雜志. 2013 (12)



本文編號：3272322