【摘要】：屈光不正是導(dǎo)致全球低視力的首位原因,也是云南省導(dǎo)致低視力的第二位原因,造成嚴(yán)重的社會影響和經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān),是重要的公共衛(wèi)生問題。學(xué)齡期是屈光不正尤其是近視的發(fā)生和發(fā)展期,隨著時間的推移近視患病率呈現(xiàn)不斷上升的趨勢。近視的確切病因尚不清楚,造成其構(gòu)成和患病率差異的原因可能是遺傳和環(huán)境因素共同造成的,但學(xué)齡期近視哪種因素起主導(dǎo)作用尚無定論。云南省墨江縣位于云南南部地區(qū),人口以少數(shù)民族(尤其是哈尼族)為主,目前尚未見到有關(guān)該地區(qū)青少年近視現(xiàn)狀調(diào)查和近視相關(guān)遺傳學(xué)研究。本研究旨在初步探求哈尼族少年患近視的遺傳相關(guān)因素,并為將來探索哈尼族近視的分子遺傳機(jī)制提供線索。[目的]本研究基于以前的遺傳學(xué)研究和動物實驗?zāi)Ｐ?選擇層粘連蛋白(lamininα chain,LAMA1)、縫隙連接蛋白(gap junction protein delta 2,GJD2)、微管蛋白家族(tubulinfamily,TUBA)、蛋白特異性鳥苷酸釋放因子(Ras protein-specific guaninenucleotide-releasing factor1,RASGRF1)、連環(huán)蛋白2(catenin delta 2,CTNND2)、轉(zhuǎn)化生長因子(Transforming growth factor-beta,TGF-β)、骨形態(tài)發(fā)生蛋白(bonemorphogenic protein,BMP)基因作為候選基因,旨在初步探求哈尼族少年患近視的遺傳相關(guān)因素,并為將來探索哈尼族近視的分子遺傳機(jī)制提供理論線索。[方法]選取 TGF-β、BMP、LAMA1、GJD2、CTNND2、RASGRF1、TUBA作為候選基因,打開 NCBI-SNP(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/)網(wǎng)站,初步篩選功能性位點,要求次等位基因頻率(Minor allele frequency,MAF)0.2,查閱相關(guān)文獻(xiàn),將具有疾病易感性的結(jié)果進(jìn)行標(biāo)注且對初選的位點做功能預(yù)測,最終確定所選候選基因的 30 個 SNP 位點:TGF-β1(rs1800469、rs1800472、rs2241716、rs4803455)、TGF-β2(rs1473527、rs6604604、rs6691070、rs7550232、rs900)、BMP-2(rs173107、rs235768、rs4813802、rs961253、rs235770)、BMP-3(rs13138361、rs1390319、rs1960445、rs3733549、rs4458448、rs5022942)、BMP-4(rs17563、rs2761887、rs4901474、rs66913363)、LAMA1(rs12205363)、GJD2(rs524952)、CTNND2(rs6885224 和 rs1 2716080)、RASGRF1(rs4778879)、TUBA(rs10034228)。以云南省墨江縣城區(qū)12歲-18歲中學(xué)生為研究基礎(chǔ),篩查患近視的學(xué)生,選取近視的哈尼族學(xué)生67名,向監(jiān)護(hù)人充分解釋調(diào)查的目的及具體過程,獲得監(jiān)護(hù)人同意后,簽署《知情同意書》,抽取研究對象肘靜脈5ml,提取DNA,通過Sequenom實驗對候選基因的30個位點進(jìn)行單核苷酸多態(tài)性分析。登1OOOGenomes數(shù)據(jù)庫,尋找中國漢族人群正常候選基因位點的基因表達(dá),共103組作為對照。利用IBM SPSS 20.0對數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計分析,通過Pearson卡方檢驗或Fisher精確檢驗,分析正常組和疾病組在每個位點上基因型和等位基因頻率的差異。Haploview4.2軟件對7個SNPs進(jìn)行連鎖不平衡和基于連鎖不平衡的單體型區(qū)塊分析。[結(jié)果]1、30個位點,BMP-2(rs235768)未檢測出,其余29個位點檢出率都90%。2、基因型分布的統(tǒng)計分析中3個多態(tài)性位點TGF-11(rs2241716)、BMP4(rs66913363)、CTNND2(rs6885224)在顯性遺傳模式下和對照組的基因型分布比較,具有統(tǒng)計學(xué)差異(P值分別為0.000、0.007、0.023);而在隱性遺傳模式下只有兩個多態(tài)性位點BMP4(rs4901474、rs66913363)和對照組的基因型分布比較有統(tǒng)計學(xué)差異(O值分別為0.030、0.000);其余各位點兩組間無統(tǒng)計學(xué)差異。在基因頻率的統(tǒng)計分析中2個多態(tài)性位點TGF-11(rs2241716)、BMP4(rs66913363)和對照組的等位基因頻率比較,具有統(tǒng)計學(xué)差異(P值0.05),其余各位點統(tǒng)計學(xué)無差異。3、TBG-11基因的三個位點定義了一個區(qū)塊,rs1800469和rs2441716較弱連鎖不平衡(D,=0.97,r2=0.33),BMP4的四個位點定義了一個區(qū)塊,rs66913363和rs17563較弱連鎖不平衡(D=0.97,r2=0.52)。BMP4單體型CG、TG兩個型在近視組和對照之間差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P值分別為3.74E-05、1.00E-09);TBG-11單體型CG、GG兩個型在近視組和對照之間差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P值分別為5.16E-13、4.12E-15)。[結(jié)論]CTNND2(rs6885224)、TGF-β1(rs2241716)、BMP4(rs66913363、rs4901474)這四個位點與墨江哈尼族少年近視的發(fā)生、發(fā)展有相關(guān)性,其中BMP4基因的(rs66913363)位點未檢索到有相似結(jié)果的研究。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】：昆明醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號】：R778

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號：2470503