鼻息肉的全基因表達(dá)譜
本文選題:鼻息肉 + 基因芯片; 參考:《中國(guó)醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào)》2017年10期
【摘要】:目的研究鼻息肉的全基因表達(dá)譜情況,探尋其與正常鼻腔黏膜的基因表達(dá)差異。方法提取鼻息肉中的RNA,將RNA合成雙鏈的c DNA,將標(biāo)記的c DNA在Roche Nimble Gen基因芯片上進(jìn)行雜交。應(yīng)用Axon Gene Pix 4000B scanner進(jìn)行掃描,應(yīng)用Nimble Scan軟件進(jìn)行圖像分析,探針及基因水平標(biāo)準(zhǔn)化后進(jìn)行計(jì)算。結(jié)果與正常鼻腔黏膜相比,鼻息肉中有1 000個(gè)基因表達(dá)上調(diào),占2.22%(1 000/45 033),有1 123個(gè)基因表達(dá)下調(diào),占2.49%(1 123/45 033)。經(jīng)過信號(hào)通路分析,發(fā)現(xiàn)在核糖體、蛋白酶體、檸檬酸循環(huán)、膀胱癌、非小細(xì)胞肺癌、神經(jīng)膠質(zhì)瘤、子宮內(nèi)膜癌、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)蛋白合成、慢性髓樣白血病、谷胱甘肽代謝等信號(hào)通路中相關(guān)基因表達(dá)上調(diào),在嗅覺傳導(dǎo)、自然殺傷細(xì)胞介導(dǎo)的細(xì)胞毒性、細(xì)胞色素P450的化合物代謝、細(xì)胞色素P450的藥物代謝、抗原加工和呈遞、瘧疾、移植物抗宿主疾病、視黃醇代謝、亞油酸代謝、戊糖和葡萄糖醛酸轉(zhuǎn)換等信號(hào)通路中相關(guān)基因表達(dá)下調(diào)。結(jié)論鼻息肉的發(fā)生、發(fā)展與多個(gè)基因及信號(hào)通路的表達(dá)升高或降低有關(guān),鼻息肉全基因表達(dá)譜的研究為探求鼻息肉的發(fā)生機(jī)制提供了有益的線索。
[Abstract]:Objective to study the gene expression profile of nasal polyp and to explore the difference between the gene expression of nasal polyp and that of normal nasal mucosa. Methods RNA was extracted from nasal polyps and synthesized into double-stranded cDNA. The labeled cDNA was hybridized on Roche Nimble Gen gene chip. Axon Gene Pix4000B scanner was used to scan, and Nimble scan software was used to analyze the image. The probe and gene level were standardized and calculated. Results compared with normal nasal mucosa, 1 000 genes were up-regulated in nasal polyps (2.22%) (1 000 / 45 033), and 1 123 genes were down-regulated (2 49%) (1 123 / 45 033). After signal pathway analysis, we found ribosome, proteasome, citric acid cycle, bladder cancer, non-small cell lung cancer, glioma, endometrial carcinoma, endoplasmic reticulum protein synthesis, chronic myeloid leukemia, Up-regulated gene expression in signaling pathways such as glutathione metabolism, transduction of olfactory cells, cytotoxicity mediated by natural killer cells, metabolism of cytochrome P450 compounds, drug metabolism of cytochrome P450, antigen processing and presentation, malaria, GVHD, retinol metabolism, linoleic acid metabolism, pentose and glucuronic acid conversion were down-regulated. Conclusion the development of nasal polyps is related to the increase or decrease of the expression of multiple genes and signal pathways. The study of the whole gene expression profile of nasal polyps provides a useful clue for exploring the pathogenesis of nasal polyps.
【作者單位】: 中國(guó)醫(yī)科大學(xué)附屬盛京醫(yī)院耳鼻咽喉科;
【基金】:遼寧省科學(xué)事業(yè)公益研究基金(2013001010) 沈陽市科學(xué)技術(shù)計(jì)劃(F11-264-1-07,F13-220-9-21)
【分類號(hào)】:R765.25
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本文編號(hào):2116913
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