本文選題：先天性小耳畸形 + miRNA　； 參考：《復(fù)旦大學(xué)》2012年碩士論文

【摘要】：目的：通過檢測畸形小耳組織和正常耳組織中miRNA表達情況,預(yù)測差異性miRNA的候選靶基因并進行驗證,研究miRNA及其靶基因在先天性小耳畸形發(fā)生過程中的分子作用機制。 方法：選取畸形小耳組織9例和正常耳組織3例,通過北京博奧公司Affymetrix GeneChip~(?)iRNA2.0Array對miRNA表達譜進行檢測。對芯片結(jié)果采用poly(A)RT-PCR技術(shù)于58例畸形小耳組織和18例正常耳組織中進行擴大樣本驗證。預(yù)測差異性miRNA的候選靶基因并于組織mRNA水平進行驗證。 結(jié)果：(1)通過芯片技術(shù)明確了畸形小耳組織的miRNA表達譜,發(fā)現(xiàn)11個miRNA在畸形小耳組織中具有差異性表達。表達上調(diào)的有6個,分別是miR-16, miR-140-3p, miR-126, miR-185, miR-451和miR-486-5p,表達下調(diào)的有5個,分別是miR-203, miR-205, miR-200c, miR-708和miR-1308。擴大樣本后行poly(A)RT-PCR驗證并發(fā)現(xiàn)miR-486-5p和miR-451在畸形小耳組織中表達上調(diào),miR-200c表達下調(diào)(p0.05)。(2)通過生物信息學(xué)平臺預(yù)測出一批差異性miRNA的候選靶基因并于組織mRNA水平進行驗證,發(fā)現(xiàn)miR-451和miR-200c共同預(yù)測的靶基因OSR1在畸形小耳組織中表達上調(diào)(p0.01), miR-200c預(yù)測的靶基因TRPS1表達下調(diào)(p0.0001)。 結(jié)論：miR-486-5p, miR-451和miR-200c在畸形小耳組織中的差異性表達可能是小耳畸形發(fā)生的原因之一。OSR1和TRPS1基因作為差異性miRNA的候選靶基因在本病的發(fā)生過程中發(fā)揮了一定的作用。
[Abstract]:Aim: to study the molecular mechanism of miRNA and its target genes in the development of congenital microtia by detecting the expression of miRNA in deformed small ear tissue and normal ear tissue, predicting and verifying the candidate target genes of differential miRNA. Methods: miRNA expression profiles were detected in 9 cases of deformed small ear tissue and 3 cases of normal ear tissue by Affymetrix Gene Chip- iRNA 2.0Array of Beijing Boao Company. The microarray results were verified by poly (A) RT-PCR in 58 cases of malformed small ear tissue and 18 cases of normal ear tissue. Candidate target genes for differential miRNA were predicted and verified at tissue mRNA level. Results: (1) the microarray technique was used to identify the miRNA expression profile of the deformed small ear tissue, and 11 miRNAs were found to be differentially expressed in the deformed small ear tissue. The expression of miR-16, miR-140-3p, miR-126, miR-1855, miR-451 and miR-486-5pwere up-regulated, and the down-regulated ones were miR-203, miR-205, miR-200c, miR-708 and miR-1308. Poly (A) RT-PCR was performed to verify the expression of miR-486-5p and miR-451 in deformed small ear tissue. The down-regulated expression of miR-200c (p0.05). (2) was predicted by bioinformatics platform and verified at the tissue level. It was found that the target gene OSR1 of miR-451 and miR-200c was up-regulated (p0.01) and the target gene TRPS1 of miR-200c was down-regulated (p0.0001). Conclusion the differential expression of miR-486-5p, miR-451 and miR-200c may be one of the reasons for the development of microauricular malformation. OSR1 and TRPS1 genes may play a role in the pathogenesis of the disease as candidate genes for differential miRNA.
【學(xué)位授予單位】：復(fù)旦大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2012
【分類號】：R764

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本文編號：2101851