本文關(guān)鍵詞： 視網(wǎng)膜色素變性 RP1基因 突變　出處：《寧夏醫(yī)科大學(xué)》2012年碩士論文　論文類型：學(xué)位論文

【摘要】：目的視網(wǎng)膜色素變性（retinitis pigmentosa,RP）是一組常見的單基因遺傳性、致盲性眼病，目前尚無有效的治療方法。目前，通過連鎖分析和候選基因篩查，已發(fā)現(xiàn)63個(gè)基因與RP有關(guān)。RP1基因突變占ADRP致病突變的2%～7%，僅次于RHO和RDS。本研究的目的是研究RP1基因在寧夏地區(qū)RP患者中的突變頻率及特征，進(jìn)一步探討其在RP發(fā)病機(jī)制中的潛在作用。 方法按國際通用的RP診斷標(biāo)準(zhǔn)收集寧夏回族自治區(qū)110例RP患者，其中包含35例常染色體顯性遺傳性RP（ADRP）患者和75例散發(fā)患者（SRP）為RP患者組，同時(shí)收集100例正常對照者為正常對照組，抽取外周靜脈血3～5ml，EDTA抗凝，采用DNA提取試劑盒（北京天根生化科技有限公司）提取全基因組DNA。按基因庫的RP1基因序列資料（GeneBank登錄號(hào)：NG_009840），參照Payne等報(bào)道的方法對RP1基因進(jìn)行PCR引物設(shè)計(jì)，在設(shè)計(jì)引物時(shí)使其擴(kuò)增區(qū)域覆蓋RP1基因的4個(gè)外顯子及其附近拼接位點(diǎn)中的內(nèi)含子，共設(shè)計(jì)、合成21對引物。應(yīng)用聚合酶鏈反應(yīng)（polymerase chainreaction, PCR）和直接測序法進(jìn)行RP1基因全編碼區(qū)和鄰近剪切位點(diǎn)的內(nèi)含子區(qū)域序列突變的檢測。運(yùn)用多因素分析和基于網(wǎng)絡(luò)的評分軟件PolyPhen、Sorting Intolerant FromTolerant（SIFT）對研究結(jié)果進(jìn)行分析。 結(jié)果RP患者組和正常對照組RP1基因共檢測出11個(gè)變異位點(diǎn)，其中錯(cuò)義突變6個(gè)：p.Gly706Arg、p.Arg872His、p.Asn985Tyr、p.Ala1670Thr、p.Ser1691Pro、p.Cys2033Tyr，同義突變3個(gè)：p.Gln1008Gln、p.Lys1152Lys、p.Gln1725Gln，非編碼區(qū)域突變2個(gè)：c.788-92TC、c.*247AC。p.Lys1152Lys和c.*247AC為新發(fā)現(xiàn)的突變位點(diǎn)。RP患者組第3內(nèi)含子c.788-92TC的突變頻率與正常對照組相比差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（χ~2=9.12,P0.01）；3’-側(cè)翼序列區(qū)c.*247AC的突變頻率高于正常對照組，差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（χ~2=12.77, P0.01），且與RP發(fā)生呈顯著正相關(guān)（r=1.11, P0.05）。在110例RP患者中，發(fā)現(xiàn)83例患者均同時(shí)攜帶p.Arg872His、p.Ala1670Thr和p.Ser1691Pro三個(gè)錯(cuò)義突變。在正常對照組中有22例出現(xiàn)p.Arg872His的突變，另有36例同時(shí)出現(xiàn)p.Ala1670Thr和p.Ser1691Pro突變。三個(gè)錯(cuò)義突變在RP患者中的發(fā)生率均顯著高于正常對照組（χ~2=59.87, χ~2=33.21; P0.01）。PolyPhen分析顯示，p.Arg872His、p.Ala1670Thr、p.Ser1691Pro均為保護(hù)性突變。SIFT分析顯示，這3個(gè)突變對RP均表現(xiàn)為保護(hù)作用。對患者的臨床表現(xiàn)進(jìn)行分析，發(fā)現(xiàn)攜帶上述3個(gè)突變的PR患者平均年齡為43.54±12.32歲，夜盲出現(xiàn)的平均年齡為30.54±13.68歲，，最佳矯正視力平均為0.50±0.38；未攜帶上述3個(gè)突變的PR患者平均年齡為34.87±17.60歲，夜盲出現(xiàn)的平均年齡為21.06±16.24歲，最佳矯正視力平均為0.40±0.33；2組患者夜盲出現(xiàn)的平均年齡、最佳矯正視力比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（t=2.01, t=2.11; P0.05）。 結(jié)論在寧夏回族自治區(qū)RP患者中，RP1基因的致病突變率低于中國其他地區(qū)的人群。研究發(fā)現(xiàn)非編碼區(qū)域堿基改變c.*247AC的突變與RP發(fā)生呈顯著正相關(guān)。p.Arg872His、p.Ala1670Thr和p.Ser1691Pro突變均系單核苷酸多態(tài)現(xiàn)象，三者的協(xié)同出現(xiàn)可能對RP起到一定的保護(hù)作用，同時(shí)也可能降低了RP1基因致病突變的發(fā)生率。
[Abstract]:Objective To study the mutation frequency and characteristics in RP patients in Ningxia region by linkage analysis and candidate gene screening . The aim of this study is to study the mutation frequency and characteristics of the RHO and RDS in RP patients in Ningxia region . Methods A total of 110 RP patients were collected from Ningxia Hui Autonomous Region by RP - PCR , including 35 patients with autosomal dominant hereditary RP ( ADRP ) and 75 sporadic patients ( SRP ) as RP patients . Results The mutation frequency of the 3rd intron c . 788 - 92TC in RP patient group was higher than that of the normal control group ( 蠂 ~ 2 = 9.12 , P0.01 ) . The mutation frequency of the third intron c . 788 - 92TC in RP patients was higher than that of the normal control group ( 蠂 ~ 2 = 12.77 , P0.01 ) . Among 110 RP patients , 83 patients were found to carry three missense mutations of p . Arg872His , p . Ala1670Thr and p . Ser1691Pro . In the normal control group , there were 22 cases with p . Arg872His mutation and 36 cases with p . Ala1670Thr and p . Ser1691Pro mutation . The incidence of three missense mutations in RP patients was significantly higher than that in the normal control group ( 蠂 ~ 2 = 59.87 , 蠂 ~ 2 = 33.21 ; P0.01 ) . The average age of patients with PR was 43.54 鹵 12.32 years old , the average age of night blindness was 30.54 鹵 12.32 years old , the average age of night blindness was 30.54 鹵 13.68 years old , the average age of night blindness was 34.87 鹵 17.60 years old , the average age of night blindness was 34.87 鹵 17.60 years old , the average age of night blindness was 21.06 鹵 16.24 years old , the average age of night blindness was 34.87 鹵 17.60 years old . Conclusion : In the RP patients of Ningxia Hui Autonomous Region , the mutation rate is lower than that in other regions of China . It is found that the mutation of the non - coding region is positively correlated with the occurrence of RP . p . Arg872His , p . Ala1670Thr and p . Ser1691Pro mutation are single nucleotide polymorphism .

【學(xué)位授予單位】：寧夏醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2012
【分類號(hào)】：R774.1

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：1530952