一先天性白內(nèi)障家系的疾病相關(guān)候選基因定位
本文關(guān)鍵詞: 先天性白內(nèi)障 基因突變 剪切位點突變 CRYBA3/A1基因 出處:《浙江大學》2017年碩士論文 論文類型:學位論文
【摘要】:目的:先天性白內(nèi)障是導致兒童視力損害甚至失明的主要眼病之一,其中常染色體顯性遺傳是遺傳性先天性白內(nèi)障的主要的遺傳方式。本病的遺傳學致病機制并非單一,迄今為止已發(fā)現(xiàn)超過40種不同的獨立致病位點。本實驗對一個中國先天性白內(nèi)障家系進行了致病基因篩查研究。方法:本實驗納入了 一個中國先天性白內(nèi)障家系,納入四代成員共12人,其中患者5人。所有家系成員均接受了相關(guān)病史調(diào)查和詳細的眼科檢查,包括視力檢查、散瞳后裂隙燈及直接檢眼鏡檢查等。采集每個家系成員的外周血并提取基因組DNA。應(yīng)用聚合酶鏈式反應(yīng)(PCR)擴增所有疾病相關(guān)候選基因的編碼區(qū)及內(nèi)含子、外顯子交界區(qū)。對擴增產(chǎn)物進行雙向測序,并分析基因序列。用限制性片段長度多態(tài)性分析(RFLP)驗證突變,并應(yīng)用多種生物信息學分析方法(Human Splicing Finder Matrices and MaxEnt tools,Annovar)預(yù)測突變對蛋白質(zhì)功能的影響。結(jié)果:通過家系圖繪制及分析,該家系的遺傳方式被確定為常染色體顯性遺傳。直接測序發(fā)現(xiàn)家系中所有患者的CRYBA3/A1基因編碼區(qū)一條等位基因的第2個外顯子前第2位堿基發(fā)生了由A到G的改變(c.30-2AG),而該突變在家系中未患病成員和100名無親緣關(guān)系的健康對照中均未發(fā)現(xiàn)。利用限制性片段長度多態(tài)性分析驗證了該突變的存在,并利用數(shù)種在線生物信息學分析工具預(yù)測出該突變?yōu)榭赡苤虏⊥蛔。結(jié)論:本實驗在一個中國先天性白內(nèi)障的家系中發(fā)現(xiàn)了 CRYBA3/A1基因c.30-2 AG剪切位點突變,該突變被驗證與先天性白內(nèi)障存在共分離。進一步支持了CRYBA3/A1基因突變對于先天性白內(nèi)障的致病性,并擴大了先天性白內(nèi)障相關(guān)的致病突變譜。
[Abstract]:Objective: congenital cataract is one of the major eye diseases that lead to visual impairment or even blindness in children. Autosomal dominant inheritance is the main genetic mode of hereditary congenital cataract. The genetic mechanism of this disease is not single. To date, more than 40 different independent pathogenetic loci have been identified. A genetic screening study was conducted in a Chinese family of congenital cataract. A Chinese family of congenital cataract. 12 members were included in the four generations, including 5 patients. All the family members underwent relevant medical history investigation and detailed ophthalmic examination, including visual examination. Slit-lamp and direct ophthalmoscope examination after pupil dilatation. The peripheral blood of each family member was collected and genomic DNA was extracted. Polymerase chain reaction (PCR) was used. The coding regions and introns of all disease-related candidate genes were amplified. The amplification products were sequenced in two directions and the gene sequence was analyzed. The mutation was verified by restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis. A variety of bioinformatics analysis methods were used to analyze human Splicing Finder Matrices and MaxEnt tools. Annovar. was used to predict the effect of mutation on protein function. Results: family map was used to draw and analyze the mutation. The genetic pattern of the family was determined to be autosomal dominant inheritance. Direct sequencing revealed that the second base of the second exon of an allele in the CRYBA3/A1 gene coding region of all patients in the family was found to be at the second base. Changes from A to G (. C.30-2AGs). The mutation was not found in none of the family members and 100 unrelated healthy controls. The existence of the mutation was verified by restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis. Several online bioinformatics tools were used to predict the mutation as a possible pathogenic mutation. Conclusion: this study was found in a Chinese pedigrees with congenital cataract. CRYBA3/A1 gene c. 30-2 AG splicing site mutation. This mutation has been proved to be coisolated from congenital cataract, which further supports the pathogenicity of CRYBA3/A1 gene mutation in congenital cataract and expands the spectrum of pathogenicity mutation associated with congenital cataract.
【學位授予單位】:浙江大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2017
【分類號】:R776.1
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