Smad3基因和ACE基因與2型糖尿病患者糖尿病視網(wǎng)膜病變的關系的初步探討
本文關鍵詞: 糖尿病性視網(wǎng)膜病變 單核苷酸多態(tài)性 Smad3基因 ACE基因 基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜 出處:《天津醫(yī)科大學》2012年碩士論文 論文類型:學位論文
【摘要】:目的:糖尿病視網(wǎng)膜病變(DR)的發(fā)病受多種基因的影響,對DR易感基因的多態(tài)性的研究,有助于我們深入了解其發(fā)病機制;候選基因研究在DR的易感基因的研究中占有重要地位。 TGF-β/Smad信號轉導通路在DR的發(fā)生發(fā)展中起著重要作用,Smad3是該信號轉導通路中的最重要的介質(zhì),既往的TGF-β/Smad信號轉導通路與DR的相關性研究多集中于細胞因子信號轉導通路的層面上,我們以Smad3基因作為DR的候選基因之一在基因層面進行研究;血管緊張素轉換酶(ACE)在腎素-血管緊張素系統(tǒng)(RAS)中起著樞紐作用,RAS也通過各種途徑參與了DR的發(fā)生發(fā)展,在基因層面上,既往對其16內(nèi)含子內(nèi)插入/缺失(I/D)多態(tài)性與DR的相關性已有大量研究,但對其SNP位點還鮮有報道,我們也將ACE基因作為DR的候選基因之一,對其SNP位點與DR的相關性進行研究。 因此,本研究將Smad3基因與ACE基因作為DR的候選基因,初步探討Smad3基因rs1498506、rs12102171位點與ACE基因rs4353位點基因多態(tài)性與中國漢族人2型糖尿病患者DR的相關性。 方法:本研究選取久居天津、彼此之間無血緣關系的漢族2型糖尿病患者共412名,其中DR患者258名(NPDR患者158名,PDR患者100名),對照組154名(均為病程長于10年的未罹患DR和DN的患者)。取空腹外周血標本,血清用于生物化學指標檢測,檢測空腹血糖(FPG)、糖化血紅蛋白(HbA1c)、總膽固醇(TC)、甘油三酯(TG)、尿素氮(BUN)、肌酐(SCR)、尿酸(UA);全血用于提取基因組DNA。提取并純化的基因組DNA應用基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜技術(MALDI-TOF-MS),對Smad3基因rs1498506、rs12102171位點與ACE基因rs4353位點進行基因分型,利用SPSS和PLINK軟件對各SNP位點與一般臨床生物化學指標的關聯(lián)性,及進一步的與DR及PDR之間的關聯(lián)性進行分析。 結果:(1)各SNP位點與DR及PDR的二分變量關聯(lián)分析。Smad3基因rs1498506和ACE基因rs4353位點與DR均無相關性(P=0.69及P=0.96),Smad3基因rs12102171位點與DR具有相關性(P=0.03);Smad3基因rs1498506和ACE基因rs4353位點與PDR亦均無相關性(P=0.64及P=0.79),Smad3基因rs12102171位點與PDR具有相關性(P=0.02)。 (2)各SNP位點與臨床生物化學指標的數(shù)量性狀關聯(lián)分析。Smad3基因rs1498506、rs12102171與ACE基因rs4353三個位點在以性別分組并分別經(jīng)過年齡調(diào)整、體質(zhì)指數(shù)(BMI)調(diào)整、病程調(diào)整之后,均與FPG、HbA1c、TC、TG、 BUN、SCR、UA等臨床生物化學指標沒有相關性(P0.05);在去除極端值數(shù)據(jù)后,三個SNP位點與FPG、HbA1c、TC、TG、BUN、SCR、UA等臨床生物化學指標均沒有相關性(P0.05)。 結論:在中國漢族人群中,Smad3基因rs1498506、ACE基因rs4353位點與DR及PDR均無相關性;Smad3基因rs12102171位點與DR及PDR均具有相關性,且T等位基因是DR和PDR的危險因子。
[Abstract]:Objective: the pathogenesis of diabetic retinopathy (Dr) is affected by many genes. The study on the polymorphism of Dr susceptibility gene is helpful for us to understand the pathogenesis of Dr. Candidate genes play an important role in the study of Dr susceptibility genes. TGF- 尾 / Smad signal transduction pathway plays an important role in the development of Dr. Smad3 is the most important medium in the signal transduction pathway. Previous studies on the correlation between TGF- 尾 / Smad signal transduction pathway and Dr were focused on cytokine signal transduction pathway. We used Smad3 gene as one of the candidate genes for Dr. Angiotensin converting enzyme (ACE) plays a pivotal role in the renin-angiotensin system (Ras). Ras is also involved in the development of Dr through various ways. The association of intron 16 insertion / deletion I / D polymorphism with Dr has been extensively studied, but the SNP locus has not been reported. We also used ACE gene as one of the candidate genes for Dr, and studied the correlation between Dr and SNP locus. Therefore, in this study, Smad3 gene and ACE gene were considered as candidate genes for Dr, and Smad3 gene rs1498506 was preliminarily discussed. The relationship between the polymorphism of rs12102171 locus and rs4353 locus of ACE gene and Dr of type 2 diabetes in Chinese Han nationality. Methods: a total of 412 Han patients with type 2 diabetes mellitus (T2DM) living in Tianjin for a long time were enrolled in this study, including 258 patients with Dr and 158 patients with NPDR. The fasting peripheral blood samples were collected from 100 patients with PDR and 154 patients from the control group (all patients with longer course than 10 years). The serum was used to detect biochemical indexes. Fasting blood glucose (FPG), glycosylated hemoglobin (HbA1cN), total cholesterol (TC), triglyceride (TGN), bun (bun), creatinine (SCR) and uric acid (UAA) were detected. Whole blood was used to extract genomic DNA. The extracted and purified genomic DNA was extracted and purified by MALDI-TOF-MSusing matrix assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF-MS). The loci of Smad3 gene rs1498506 rs12102171 and ACE gene rs4353 were genotyped. SPSS and PLINK software were used to analyze the relationship between SNP loci and general clinical biochemical indexes, as well as with Dr and PDR. Results there was no correlation between Smad3 gene rs1498506 and ACE gene rs4353 locus and Dr (P < 0.05). P0. 69 and P0. 96). The rs12102171 locus of Smad3 gene was correlated with Dr. There was no correlation between the rs4353 locus of Smad3 gene rs1498506 and ACE gene and PDR. The rs12102171 locus of Smad3 gene was correlated with PDR. (2) correlation analysis of quantitative traits between each SNP locus and clinical biochemical indexes. The rs1498506 of Smad3 gene was analyzed. The three rs4353 loci of rs12102171 and ACE gene were grouped by sex and adjusted by age and body mass index (BMI) respectively. After the course of disease was adjusted, they were all associated with FPG. There was no correlation between the clinical biochemical indexes such as HBA _ 1C _ (TCN) TG, BUNA SCRU UA and so on (P 0.05). After the extreme value data were removed, there was no correlation between the three SNP loci and the clinical biochemical indexes such as TGN, TGN, TGN, SCRU, etc. Conclusion: there is no correlation between the rs4353 locus of Smad3 gene rs1498506ACE and Dr and PDR in Chinese Han population. The rs12102171 locus of Smad3 gene was correlated with Dr and PDR, and T allele was the risk factor of Dr and PDR.
【學位授予單位】:天津醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2012
【分類號】:R774.1;R587.2
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,本文編號:1448735
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