本文關(guān)鍵詞：應(yīng)用16S rDNA測序技術(shù)分析白內(nèi)障術(shù)前結(jié)膜囊菌群變化的研究　出處：《濟(jì)南大學(xué)》2016年碩士論文　論文類型：學(xué)位論文

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【摘要】：目的將16S rDNA測序技術(shù)用于結(jié)膜囊菌群的研究,揭示白內(nèi)障患者術(shù)前結(jié)膜囊菌群的分布和多樣性,觀察白內(nèi)障術(shù)前結(jié)膜囊菌群動態(tài)變化,以探討白內(nèi)障術(shù)前抗生素使用的必要性。方法選擇老年性白內(nèi)障患者31例(31眼),術(shù)前給予0.5%左氧氟沙星滴眼液點(diǎn)眼(q2h*1d)和0.5%聚維酮碘(PVP-I)消毒液洗眼。在不同時間點(diǎn)(點(diǎn)眼前、點(diǎn)眼后、PVP-I洗眼后)收集患者結(jié)膜囊樣本共93份,提取總的DNA,以Illumina Hiseque2000為測序平臺,采用新一代高通量16S rDNA宏基因組測序技術(shù)對V3-V4可變區(qū)測序,并進(jìn)行生物信息學(xué)分析(物種分類和豐度分析;多樣性分析)。根據(jù)物種分類(門類、科類、屬類)對三個樣本中的菌群的相對含量進(jìn)行比較分析。結(jié)果本研究中93例樣本共檢出2420515條優(yōu)化序列,聚類分析產(chǎn)生36555個OUT(operational taxonomy unit)。在門水平,三組樣本共檢測出28個門類,其中優(yōu)勢菌門為:變形菌門(Proteobacteria)、放線菌門(Actinobacteria)、厚壁菌門(Firmicutes)、擬桿菌門(Bacteroidetes)和異常球菌-棲熱菌門(Deinococcus-Thermus),對三組樣本優(yōu)勢菌門進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析,其中點(diǎn)眼前各菌門的相對含量(%)為:46.54±20.41)、34.11±19.11、34.11±19.11、2.10±2.10、0.67±0.86;點(diǎn)眼后各菌門的相對含量(%)為:68.28±15.06、19.37±15.90、6.55±4.77、2.38±2.65、1.61±2.46;PVI洗眼后各菌門的相對含量(%)為:87.29±10.77、7.37±10.90、1.84±1.48、1.36±1.28、1.28±1.52;其中變形菌門相對含量逐漸增高(P0.001),放線菌門、厚壁菌門、擬桿菌門相對含量逐漸下降(P0.001);恐球菌-棲熱菌門差異不明顯(P=0.874)。在科水平,三組共檢測出191個科,其中在各個樣本中相對豐度均較高的科有:假單胞菌科(Pseudomonadaceae)、莫拉菌科(Moraxellaceae)、棒狀桿菌科(Corynebacteriaceae),點(diǎn)眼前各科的相對含量(%)為:28.23±19.57、26.89±16.85、5.24±5.03,點(diǎn)眼后各科的相對含量(%)為:15.02±15.24、43.25±18.04、6.29±4.18,PVI洗眼后各科的相對含量(%)為:5.67±10.53、64.57±18.48、6.42±3.11,其中棒狀桿菌科、莫拉菌科相對含量逐漸下降(P0.001),假單胞菌科逐漸升高(P0.001)。在屬水平,三組共檢測出585個屬,其中未用藥組檢測出585個,抗生素組檢測出505個,抗生素聯(lián)合聚維酮碘組檢測出476個,其中在各組中相對含量較高的屬包括:假單胞菌屬、棒狀桿菌屬、不動桿菌屬、葡萄球菌屬、鏈球菌屬和無色桿菌屬,點(diǎn)眼前各屬的相對含量(%)為:26.75±17.20、28.22±19.88、4.74±2.77、5.28±5.70、2.85±4.73、0.88±1.15;點(diǎn)眼后各屬的相對含量(%)為:43.55±18.66、14.78±15.61、5.53±4.04、2.05±2.45、1.30±2.61、1.13±0.70;PVI洗眼后各屬的相對含量(%)為:63.56±18.89、5.74±10.75、5.47±2.77、0.43±0.43、0.13±0.21、2.03±1.19,點(diǎn)眼后和PVPI洗眼后假單胞菌屬的相對含量逐漸升高(P0.001),葡萄球菌屬和棒狀桿菌屬的相對含量逐漸降低(P值均0.05),不動桿菌屬的相對含量在點(diǎn)眼后和PVP-I洗眼后均無明顯變化(P值均0.05),無色桿菌屬的相對含量在點(diǎn)眼后無明顯變化(P=0.180),在PVP-I洗眼后相對含量反而升高(P值均0.05)。結(jié)論本研究的研究結(jié)果說明16S rDNA高通量測序技術(shù)能夠發(fā)現(xiàn)結(jié)膜囊菌群多樣性和各種菌在結(jié)膜囊中的相對含量,較傳統(tǒng)依賴培養(yǎng)的方法具有明顯的優(yōu)勢,顯示白內(nèi)障患者術(shù)前結(jié)膜囊菌群中發(fā)現(xiàn)27個門類,191個科,585個屬,細(xì)菌物種豐度及分類個體差異較大。用藥前后菌群的分布發(fā)生了明顯的變化,0.5%的左氧氟沙星滴眼液和有效碘濃度為0.5%的聚維酮碘消毒液均能有效的改變結(jié)膜菌群的分布。
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【學(xué)位授予單位】：濟(jì)南大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：R779.6

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號：1350589