本文關(guān)鍵詞：下咽癌中差異表達(dá)的蛋白激酶及其抑制劑的生物信息學(xué)篩選

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【摘要】：目的篩選下咽癌中差異表達(dá)的激酶基因及其選擇性抑制劑,為下咽癌的分子靶向治療提供新的參考。方法利用GEO數(shù)據(jù)庫和SAM軟件篩選下咽癌中差異表達(dá)的激酶基因,體外培養(yǎng)人下咽癌Fa Du細(xì)胞系。為驗(yàn)證GEO數(shù)據(jù)庫中芯片結(jié)果的準(zhǔn)確性,利用實(shí)時(shí)定量聚合酶鏈反應(yīng)(Real-time PCR)檢測差異表達(dá)激酶在Fa Du細(xì)胞中的表達(dá)量,通過KEGG數(shù)據(jù)庫獲得激酶調(diào)控的通路,利用激酶抑制劑數(shù)據(jù)庫和文獻(xiàn)挖掘篩選獲得在下咽癌Fa Du細(xì)胞系中差異表達(dá)激酶的選擇性抑制劑。結(jié)果 1在GEO數(shù)據(jù)庫的下咽癌基因組表達(dá)譜中,共篩選出3個(gè)高表達(dá)的激酶基因,分別為PKC-β、CDK6和CDC42(差異倍數(shù)≥2.0且P0.05);2Real-time PCR結(jié)果顯示在人下咽癌Fa Du細(xì)胞中這3個(gè)上調(diào)激酶基因也出現(xiàn)高表達(dá)(P0.05),證明全基因組的結(jié)果準(zhǔn)確;3KEGG通路分析的結(jié)果顯示3個(gè)高表達(dá)激酶調(diào)控復(fù)雜的通路網(wǎng)絡(luò);4激酶抑制劑的篩選結(jié)果顯示共有5個(gè)激酶抑制劑調(diào)控PKC-β,4個(gè)激酶抑制劑調(diào)控CDK6,3個(gè)激酶抑制劑調(diào)控CDC42。文獻(xiàn)挖掘的結(jié)果顯示在這12個(gè)激酶抑制劑中,有4個(gè)在癌癥方面的研究較少,文獻(xiàn)10篇。結(jié)論下咽癌中共有3個(gè)激酶PKC-β、CDK6和CDC42發(fā)生高表達(dá),并發(fā)揮促癌作用。它們的激酶抑制劑可能有潛在的抗癌作用,為下咽癌的分子治療提供新的切入點(diǎn)。
【作者單位】： 內(nèi)蒙古醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院耳鼻咽喉科;
【關(guān)鍵詞】： 下咽癌 蛋白激酶 激酶抑制劑 生物信息學(xué)
【基金】：內(nèi)蒙古自治區(qū)自然科學(xué)基金(2014MS0856) 內(nèi)蒙古醫(yī)科大學(xué)科技百萬工程項(xiàng)目(KJbw2013014)
【分類號】：R739.63
【正文快照】： 網(wǎng)絡(luò)出版地址:http://www.cnki.net/kcms/detail/37.1437.R.20160331.0923.008.html下咽癌占下咽原發(fā)惡性腫瘤的95%,其主要治療手段為手術(shù)和放療,但因其發(fā)生部位隱蔽,惡性程度高,約50%的患者在確診時(shí)已存在淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移,預(yù)后較差[1-3]。手術(shù)治療也很大程度會(huì)影響患者發(fā)聲功能給

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本文編號：1045381