三陰性與三陽性乳腺癌定量蛋白質(zhì)組學(xué)和生物信息學(xué)比較研究
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【摘要】:目的雌/孕激素受體(estrogen receptor/progesterone receptor,ER/PR)和癌基因人表皮生長因子受體2(human epidermal growth factorreceptor2,HER2)與乳腺癌的發(fā)生和發(fā)展密切相關(guān),其表達(dá)狀態(tài)是乳腺癌分子分型、治療方案選擇和預(yù)后預(yù)測的重要依據(jù)。為了深入探討ER/PR/HER2在乳腺癌發(fā)生和惡性演進(jìn)中的意義及相關(guān)機(jī)制,擬建立ER/PR/HER-2陰性和陽性乳腺癌的蛋白質(zhì)表達(dá)譜,尋找ER/PR/HER-2陰性和陽性乳腺癌中差異表達(dá)蛋白,為乳腺癌患者提供新的預(yù)后預(yù)測指標(biāo)和治療新靶點(diǎn)。方法應(yīng)用蛋白質(zhì)組學(xué)同位素相對標(biāo)記與絕對定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ)技術(shù)建立ER/PR/HER-2陽性和陰性乳腺癌的蛋白質(zhì)差異表達(dá)譜,鑒定2組乳腺癌的差異表達(dá)蛋白,對部分差異表達(dá)蛋白進(jìn)行生物信息學(xué)分析,包括蛋白功能注釋、基因本體論分類分析(gene ontology classification analysis,GO分析)和京都基因與基因組百科全書(Kyoto encyclopedia of gene and genome,KEGG)通路分析。結(jié)果應(yīng)用iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)對乳腺癌組織進(jìn)行了蛋白組學(xué)分析,鑒定出ER/PR/HER-2陽性和陰性組間有差異表達(dá)的蛋白4 999種,以ER/PR/HER-2陽性∶ER/PR/HER-2陰性≥3為上調(diào)標(biāo)準(zhǔn),確定ER/PR陽性組上調(diào)蛋白73種。以ER/PR/HER-2陽性∶ER/PR/HER-2陰性≤0.5為下調(diào)標(biāo)準(zhǔn),ER/PR/HER-2陽性組下調(diào)蛋白58種。GO分析結(jié)果顯示,ER/PR/HER-2陰性和陽性乳腺癌差異表達(dá)蛋白的分子功能、生物過程和細(xì)胞定位較為復(fù)雜,并且在上調(diào)蛋白和下調(diào)蛋白上存在分布差異。KEGG通路分析發(fā)現(xiàn),部分差異表達(dá)蛋白涉及200條信號通路。結(jié)論 ER/PR/HER-2陽性和陰性乳腺癌間存在差異表達(dá)蛋白,這些蛋白涉及復(fù)雜的分子功能、生物過程和信號通路,可能與ER/PR/HER-2的表達(dá)狀態(tài)有關(guān)。
【作者單位】: 湖南省腫瘤醫(yī)院·中南大學(xué)湘雅醫(yī)學(xué)院附屬腫瘤醫(yī)院乳腺內(nèi)科;湖南省腫瘤醫(yī)院·中南大學(xué)湘雅醫(yī)學(xué)院附屬腫瘤醫(yī)院病理科;
【關(guān)鍵詞】: 雌激素受體 孕激素受體 人類表皮生長因子受體 HER 定量蛋白質(zhì)組學(xué) 乳腺癌
【基金】:湖南省科學(xué)技術(shù)廳科技計劃專項項目(2014FJ6090)
【分類號】:R737.9
【正文快照】: 中華腫瘤防治雜志,2016,23(16):1053-1059Chin J Cancer Prev Treat,2016,23(16):1053-1059乳腺癌是女性最常見的惡性腫瘤,其發(fā)病率和死亡率均呈上升及年輕化趨勢[1]。雌激素/孕激素/人類表皮生長因子受體2(estrogen receptor/progesteronereceptor/human epidermal growth fa
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本文編號:484079
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