[目的]通過高通量測序技術分析成人退變性脊柱側(cè)凸（Adult degenerative scoliosis,ADS）患者外周血中轉(zhuǎn)錄組circRNA基因表達譜,篩選出差異表達的circRNA,對差異性表達的circRNA進行生物學信息分析。構(gòu)建circRNA-miRNA相互調(diào)控作用網(wǎng)絡圖,尋找差異性表達的circRNA與miRNA結(jié)合位點,探討差異性表達的circRNA在ADS患者中的生物學功能,并發(fā)現(xiàn)靈敏度及特異度高的潛在診斷標志物,為深入認識ADS在轉(zhuǎn)錄組學層面的發(fā)生發(fā)展機制及診治提供理論基礎。[方法]收集ADS患者、腰椎間盤突出癥患者（Lumbar disc herniation,LDH）、健康對照者外周血5ml,每組各3例。提取樣本總RNA,利用NanoDropND-1000超微量分光光度計檢測總RNA的濃度及純度,變性瓊脂糖凝膠電泳檢測總RNA的完整性。根據(jù)總RNA質(zhì)檢結(jié)果,符合高通量測序技術要求后,利用第二代高通量Illumina HiSeq測序技術平臺檢測外周血中轉(zhuǎn)錄組circRNA的表達譜,篩選出差異性表達的circRNA。對差異表達的circRNA進行火山圖分析、聚類分...

【文章頁數(shù)】：83 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖１所有樣本總ＲＮＡ瓊脂糖凝膠電泳??

■ＢｉＢｉＢ??■ＨＨｉ??注：Ｍａｒｋｅｒ為Ｔｒａｎｓ?２Ｋ?Ｐｌｕｓ，圖中對應上樣序列為１－９原液上樣ｌｕｌ??圖１所有樣本總ＲＮＡ瓊脂糖凝膠電泳??２ＡＤＳ、ＬＤＨ外周全血中ｃｉｒｃＲＮＡ的表達譜分析??２．１統(tǒng)計原始序列數(shù)據(jù)??高通量測序得到的原始測序結(jié)果，其序列中可能含....

圖２ＡＤＳ＿１原始測序序列類型??２７??

■ＢｉＢｉＢ??■ＨＨｉ??注：Ｍａｒｋｅｒ為Ｔｒａｎｓ?２Ｋ?Ｐｌｕｓ，圖中對應上樣序列為１－９原液上樣ｌｕｌ??圖１所有樣本總ＲＮＡ瓊脂糖凝膠電泳??２ＡＤＳ、ＬＤＨ外周全血中ｃｉｒｃＲＮＡ的表達譜分析??２．１統(tǒng)計原始序列數(shù)據(jù)??高通量測序得到的原始測序結(jié)果，其序列中可能含....

圖４ＡＤＳ—３原始測序序列類型??

Ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ｏｆ?Ｒａｗ?Ｒｅａｄｓ（ＡＤＳ＿２）??Ｃｌｅａｎ?Ｒｅａｄｓ?（４４２９５９２４，?９５．９３％）??Ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ?Ｎ?（７３１６２，?０．１６％）??Ｌｏｗ?Ｑｕａｌｉｔｙ?（３４９１０１，?０．７６％）??Ａｄａｐｔｅｒ?Ｒｅｌａｔｅ....

圖６?ＬＤＨ＿２原始測序序列類型??

Ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ｏｆ?Ｒａｗ?Ｒｅａｄｓ（ＬＤＨ＿ｌ）??，１?＿??Ｃｌｅａｎ?Ｒｅａｄｓ?（４６５９２５３７，?９５．８９％）??Ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ?Ｎ?（６２３１０１，?１．２８％）??Ｌｏｗ?Ｑｕａｌｉｔｙ?（３４９３８３，?０．７２％）??Ａｄａｐｔｅｒ....

本文編號：4038575