瘢痕疙瘩中TGF-β1/smad通路與Egr1相關性的研究
發(fā)布時間:2021-10-13 22:47
背景:瘢痕疙瘩是真皮中成纖維細胞過度增殖和細胞外基質過量沉積引起的皮膚纖維性良性腫瘤,也是一種由皮膚損傷和刺激引起的異常傷口愈合反應。由于瘢痕疙瘩的具體發(fā)病機制尚不明確,限制了臨床治療�,F(xiàn)由于其高復發(fā)率對外科醫(yī)生仍然是一個巨大的挑戰(zhàn)。早期生長反應因子1(Egr1)作為一種重要的轉錄因子,已被證實在多種生理病理途徑中發(fā)揮重要作用,其異常表達與多種人類疾病進程相關,包括癌癥、炎癥、動脈粥樣硬化和一些纖維化疾病等。異常表達的Egr1可能通過調(diào)控下游與炎癥、免疫反應類型、細胞增殖和凋亡和EMT等相關的靶基因,從而影響瘢痕疙瘩的發(fā)病�,F(xiàn)已有大量研究證實了瘢痕疙瘩的中TGF-β1/smad信號傳導通路的異常高活化。并且也有研究證實了在硬皮病、肺纖維化和結腸炎的動物模型中,TGF-β1可以通過TGF-β1/smad信號通路的上調(diào)Egr1的表達,但在瘢痕疙瘩中,TGF-β1/smad信號通路的與Egr1的關系尚未明確。目的:旨在探究人瘢痕疙瘩中TGF-β1/smad信號通路與Egr1的表達變化的相關性,為闡明TGF-β1/smad信號通路與Egr1相互作用的分子機制奠定基礎,從而為瘢痕疙瘩治療提供新理...
【文章來源】:吉林大學吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:54 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2.3:分組圖示
第3章實驗結果18第3章實驗結果3.1人瘢痕疙瘩mRNA表達譜3.1.1人瘢痕疙瘩差異基因表達變化利用基因芯片技術檢測人瘢痕疙瘩及正常皮膚中的基因表達譜,從而篩選出差異基因。結果顯示:三組樣本中,有眾多表達差異明顯的基因(見圖3.1),其中與正常皮膚相比,瘢痕疙瘩中央?yún)^(qū)域皮膚中有777個基因上調(diào),568個基因下調(diào);與距瘢痕疙瘩邊緣大于3mm區(qū)域皮膚相比,瘢痕疙瘩中央?yún)^(qū)域皮膚有962個基因上調(diào),464個基因下調(diào);與正常皮膚相比,距瘢痕疙瘩邊緣大于3mm區(qū)域皮膚有37個基因上調(diào),173個基因下調(diào)(見圖3.2)。圖3.1人瘢痕疙瘩差異基因層次聚類熱圖(mRNA)(橫坐標為樣本,縱坐標為差異基因,左側根據(jù)表達相似程度對基因進行聚類,上方根據(jù)表達譜的相似程度對每個樣本進行聚類,由藍至紅表達量逐漸上調(diào)。K:瘢痕疙瘩中央?yún)^(qū)域皮膚,S:距瘢痕疙瘩邊緣大于3mm的皮膚,N:非瘢痕疙瘩體質人的正常皮膚。)
第3章實驗結果19圖3.2人瘢痕疙瘩差異基因火山圖(mRNA)(橫坐標表示基因在不同樣本或比較組合間的表達倍數(shù)變化(log2FoldChange),橫坐標的絕對值越大表明兩個比較組合之間的表達變化倍數(shù)越大;縱坐標表示表達差異的顯著性水平。表達上調(diào)基因用紅色點表示,下調(diào)基因用綠色點表示,藍色點為未發(fā)生顯著變化的基因。Keloid:瘢痕疙瘩中央?yún)^(qū)域皮膚,sNskin:距瘢痕疙瘩邊緣大于3mm皮膚,Nskin:非瘢痕疙瘩體質人的正常皮膚。)3.1.2人瘢痕疙瘩差異基因富集區(qū)域相關生物學功能根據(jù)綜合數(shù)據(jù)庫,分析差異基因富集區(qū)域相關生物學功能(見圖3.3)。將所有差異基因分成生物過程、細胞組分及分子功能三大類,結果顯示:①生物過程:與正常皮膚相比,瘢痕疙瘩中央?yún)^(qū)域皮膚差異基因富集的生物過程包括細胞外基質形成、骨骼系統(tǒng)形成、細胞外基質降解、膠原代謝過程等。與距瘢痕疙瘩邊緣大于3mm區(qū)域皮膚相比,瘢痕疙瘩中央?yún)^(qū)域皮膚差異基因富集的生物過程包括細胞外基質形成、細胞外基質降解、多細胞生物大分子等。②細胞組分:與正常皮膚相比,瘢痕疙瘩中央?yún)^(qū)域皮膚差異基因富集的細胞組分包括細胞外基質、蛋白細胞外基質、肌原纖維、膠原收縮等。與距瘢痕疙瘩邊緣大于3mm區(qū)域皮膚相比,瘢痕疙瘩中央?yún)^(qū)域皮膚差異基因富集的細胞組分包括細胞外基質、蛋白細胞外基質、細胞外基質分子、內(nèi)質網(wǎng)腔等。③分子功能:與正常皮膚相比,瘢痕疙瘩中央?yún)^(qū)域皮膚差異基因富集的分子功能包括細胞外基質結構組成、膠原結合、肌肉結構組成、糖胺聚糖結合等。與距瘢痕疙瘩邊緣大于3mm區(qū)域皮膚相比,瘢痕疙瘩中央?yún)^(qū)域皮膚差異基因富集的分子功能包括細胞外基質結構組成、膠原結合、糖胺聚糖結合、生長因子結合等。3.1.3人瘢痕疙瘩差異基因富集區(qū)域相關信號傳導通路(TGF-β信號?
本文編號:3435547
【文章來源】:吉林大學吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:54 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2.3:分組圖示
第3章實驗結果18第3章實驗結果3.1人瘢痕疙瘩mRNA表達譜3.1.1人瘢痕疙瘩差異基因表達變化利用基因芯片技術檢測人瘢痕疙瘩及正常皮膚中的基因表達譜,從而篩選出差異基因。結果顯示:三組樣本中,有眾多表達差異明顯的基因(見圖3.1),其中與正常皮膚相比,瘢痕疙瘩中央?yún)^(qū)域皮膚中有777個基因上調(diào),568個基因下調(diào);與距瘢痕疙瘩邊緣大于3mm區(qū)域皮膚相比,瘢痕疙瘩中央?yún)^(qū)域皮膚有962個基因上調(diào),464個基因下調(diào);與正常皮膚相比,距瘢痕疙瘩邊緣大于3mm區(qū)域皮膚有37個基因上調(diào),173個基因下調(diào)(見圖3.2)。圖3.1人瘢痕疙瘩差異基因層次聚類熱圖(mRNA)(橫坐標為樣本,縱坐標為差異基因,左側根據(jù)表達相似程度對基因進行聚類,上方根據(jù)表達譜的相似程度對每個樣本進行聚類,由藍至紅表達量逐漸上調(diào)。K:瘢痕疙瘩中央?yún)^(qū)域皮膚,S:距瘢痕疙瘩邊緣大于3mm的皮膚,N:非瘢痕疙瘩體質人的正常皮膚。)
第3章實驗結果19圖3.2人瘢痕疙瘩差異基因火山圖(mRNA)(橫坐標表示基因在不同樣本或比較組合間的表達倍數(shù)變化(log2FoldChange),橫坐標的絕對值越大表明兩個比較組合之間的表達變化倍數(shù)越大;縱坐標表示表達差異的顯著性水平。表達上調(diào)基因用紅色點表示,下調(diào)基因用綠色點表示,藍色點為未發(fā)生顯著變化的基因。Keloid:瘢痕疙瘩中央?yún)^(qū)域皮膚,sNskin:距瘢痕疙瘩邊緣大于3mm皮膚,Nskin:非瘢痕疙瘩體質人的正常皮膚。)3.1.2人瘢痕疙瘩差異基因富集區(qū)域相關生物學功能根據(jù)綜合數(shù)據(jù)庫,分析差異基因富集區(qū)域相關生物學功能(見圖3.3)。將所有差異基因分成生物過程、細胞組分及分子功能三大類,結果顯示:①生物過程:與正常皮膚相比,瘢痕疙瘩中央?yún)^(qū)域皮膚差異基因富集的生物過程包括細胞外基質形成、骨骼系統(tǒng)形成、細胞外基質降解、膠原代謝過程等。與距瘢痕疙瘩邊緣大于3mm區(qū)域皮膚相比,瘢痕疙瘩中央?yún)^(qū)域皮膚差異基因富集的生物過程包括細胞外基質形成、細胞外基質降解、多細胞生物大分子等。②細胞組分:與正常皮膚相比,瘢痕疙瘩中央?yún)^(qū)域皮膚差異基因富集的細胞組分包括細胞外基質、蛋白細胞外基質、肌原纖維、膠原收縮等。與距瘢痕疙瘩邊緣大于3mm區(qū)域皮膚相比,瘢痕疙瘩中央?yún)^(qū)域皮膚差異基因富集的細胞組分包括細胞外基質、蛋白細胞外基質、細胞外基質分子、內(nèi)質網(wǎng)腔等。③分子功能:與正常皮膚相比,瘢痕疙瘩中央?yún)^(qū)域皮膚差異基因富集的分子功能包括細胞外基質結構組成、膠原結合、肌肉結構組成、糖胺聚糖結合等。與距瘢痕疙瘩邊緣大于3mm區(qū)域皮膚相比,瘢痕疙瘩中央?yún)^(qū)域皮膚差異基因富集的分子功能包括細胞外基質結構組成、膠原結合、糖胺聚糖結合、生長因子結合等。3.1.3人瘢痕疙瘩差異基因富集區(qū)域相關信號傳導通路(TGF-β信號?
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