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瘢痕疙瘩中TGF-β1/smad通路與Egr1相關(guān)性的研究

發(fā)布時(shí)間:2021-10-13 22:47
  背景:瘢痕疙瘩是真皮中成纖維細(xì)胞過度增殖和細(xì)胞外基質(zhì)過量沉積引起的皮膚纖維性良性腫瘤,也是一種由皮膚損傷和刺激引起的異常傷口愈合反應(yīng)。由于瘢痕疙瘩的具體發(fā)病機(jī)制尚不明確,限制了臨床治療,F(xiàn)由于其高復(fù)發(fā)率對外科醫(yī)生仍然是一個(gè)巨大的挑戰(zhàn)。早期生長反應(yīng)因子1(Egr1)作為一種重要的轉(zhuǎn)錄因子,已被證實(shí)在多種生理病理途徑中發(fā)揮重要作用,其異常表達(dá)與多種人類疾病進(jìn)程相關(guān),包括癌癥、炎癥、動脈粥樣硬化和一些纖維化疾病等。異常表達(dá)的Egr1可能通過調(diào)控下游與炎癥、免疫反應(yīng)類型、細(xì)胞增殖和凋亡和EMT等相關(guān)的靶基因,從而影響瘢痕疙瘩的發(fā)病。現(xiàn)已有大量研究證實(shí)了瘢痕疙瘩的中TGF-β1/smad信號傳導(dǎo)通路的異常高活化。并且也有研究證實(shí)了在硬皮病、肺纖維化和結(jié)腸炎的動物模型中,TGF-β1可以通過TGF-β1/smad信號通路的上調(diào)Egr1的表達(dá),但在瘢痕疙瘩中,TGF-β1/smad信號通路的與Egr1的關(guān)系尚未明確。目的:旨在探究人瘢痕疙瘩中TGF-β1/smad信號通路與Egr1的表達(dá)變化的相關(guān)性,為闡明TGF-β1/smad信號通路與Egr1相互作用的分子機(jī)制奠定基礎(chǔ),從而為瘢痕疙瘩治療提供新理... 

【文章來源】:吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:54 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

瘢痕疙瘩中TGF-β1/smad通路與Egr1相關(guān)性的研究


圖2.3:分組圖示

瘢痕疙瘩,基因,聚類,層次


第3章實(shí)驗(yàn)結(jié)果18第3章實(shí)驗(yàn)結(jié)果3.1人瘢痕疙瘩mRNA表達(dá)譜3.1.1人瘢痕疙瘩差異基因表達(dá)變化利用基因芯片技術(shù)檢測人瘢痕疙瘩及正常皮膚中的基因表達(dá)譜,從而篩選出差異基因。結(jié)果顯示:三組樣本中,有眾多表達(dá)差異明顯的基因(見圖3.1),其中與正常皮膚相比,瘢痕疙瘩中央?yún)^(qū)域皮膚中有777個(gè)基因上調(diào),568個(gè)基因下調(diào);與距瘢痕疙瘩邊緣大于3mm區(qū)域皮膚相比,瘢痕疙瘩中央?yún)^(qū)域皮膚有962個(gè)基因上調(diào),464個(gè)基因下調(diào);與正常皮膚相比,距瘢痕疙瘩邊緣大于3mm區(qū)域皮膚有37個(gè)基因上調(diào),173個(gè)基因下調(diào)(見圖3.2)。圖3.1人瘢痕疙瘩差異基因?qū)哟尉垲悷釄D(mRNA)(橫坐標(biāo)為樣本,縱坐標(biāo)為差異基因,左側(cè)根據(jù)表達(dá)相似程度對基因進(jìn)行聚類,上方根據(jù)表達(dá)譜的相似程度對每個(gè)樣本進(jìn)行聚類,由藍(lán)至紅表達(dá)量逐漸上調(diào)。K:瘢痕疙瘩中央?yún)^(qū)域皮膚,S:距瘢痕疙瘩邊緣大于3mm的皮膚,N:非瘢痕疙瘩體質(zhì)人的正常皮膚。)

瘢痕疙瘩,火山,基因,細(xì)胞外基質(zhì)


第3章實(shí)驗(yàn)結(jié)果19圖3.2人瘢痕疙瘩差異基因火山圖(mRNA)(橫坐標(biāo)表示基因在不同樣本或比較組合間的表達(dá)倍數(shù)變化(log2FoldChange),橫坐標(biāo)的絕對值越大表明兩個(gè)比較組合之間的表達(dá)變化倍數(shù)越大;縱坐標(biāo)表示表達(dá)差異的顯著性水平。表達(dá)上調(diào)基因用紅色點(diǎn)表示,下調(diào)基因用綠色點(diǎn)表示,藍(lán)色點(diǎn)為未發(fā)生顯著變化的基因。Keloid:瘢痕疙瘩中央?yún)^(qū)域皮膚,sNskin:距瘢痕疙瘩邊緣大于3mm皮膚,Nskin:非瘢痕疙瘩體質(zhì)人的正常皮膚。)3.1.2人瘢痕疙瘩差異基因富集區(qū)域相關(guān)生物學(xué)功能根據(jù)綜合數(shù)據(jù)庫,分析差異基因富集區(qū)域相關(guān)生物學(xué)功能(見圖3.3)。將所有差異基因分成生物過程、細(xì)胞組分及分子功能三大類,結(jié)果顯示:①生物過程:與正常皮膚相比,瘢痕疙瘩中央?yún)^(qū)域皮膚差異基因富集的生物過程包括細(xì)胞外基質(zhì)形成、骨骼系統(tǒng)形成、細(xì)胞外基質(zhì)降解、膠原代謝過程等。與距瘢痕疙瘩邊緣大于3mm區(qū)域皮膚相比,瘢痕疙瘩中央?yún)^(qū)域皮膚差異基因富集的生物過程包括細(xì)胞外基質(zhì)形成、細(xì)胞外基質(zhì)降解、多細(xì)胞生物大分子等。②細(xì)胞組分:與正常皮膚相比,瘢痕疙瘩中央?yún)^(qū)域皮膚差異基因富集的細(xì)胞組分包括細(xì)胞外基質(zhì)、蛋白細(xì)胞外基質(zhì)、肌原纖維、膠原收縮等。與距瘢痕疙瘩邊緣大于3mm區(qū)域皮膚相比,瘢痕疙瘩中央?yún)^(qū)域皮膚差異基因富集的細(xì)胞組分包括細(xì)胞外基質(zhì)、蛋白細(xì)胞外基質(zhì)、細(xì)胞外基質(zhì)分子、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔等。③分子功能:與正常皮膚相比,瘢痕疙瘩中央?yún)^(qū)域皮膚差異基因富集的分子功能包括細(xì)胞外基質(zhì)結(jié)構(gòu)組成、膠原結(jié)合、肌肉結(jié)構(gòu)組成、糖胺聚糖結(jié)合等。與距瘢痕疙瘩邊緣大于3mm區(qū)域皮膚相比,瘢痕疙瘩中央?yún)^(qū)域皮膚差異基因富集的分子功能包括細(xì)胞外基質(zhì)結(jié)構(gòu)組成、膠原結(jié)合、糖胺聚糖結(jié)合、生長因子結(jié)合等。3.1.3人瘢痕疙瘩差異基因富集區(qū)域相關(guān)信號傳導(dǎo)通路(TGF-β信號?


本文編號:3435547

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