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罕見類型成骨不全的基因鑒定與表型分析

發(fā)布時(shí)間:2021-07-08 14:57
  目的:成骨不全(Osteogenesis imperfecta,OI)是一種以骨脆性增加為主要特征的單基因遺傳骨病,致病基因多導(dǎo)致Ⅰ型膠原的加工合成、成骨細(xì)胞分化和骨礦化異常。大部分的OI病例是由COL1A1或COL1A2突變引起的,目前已發(fā)現(xiàn)21個(gè)與OI相關(guān)的基因,由于突變基因及位點(diǎn)的不同,OI的表型龐雜。近年來,非COL1A1和COL1A2基因突變引起的OI引起了學(xué)術(shù)界更多的關(guān)注,因?yàn)槠淇赡軐?duì)闡明骨質(zhì)疏松新的致病機(jī)制,開拓骨代謝研究的新領(lǐng)域有所貢獻(xiàn)。本研究對(duì)23例未查出COL1A1和COL1A2基因突變的患者進(jìn)行基因檢測,試圖明確病因,并進(jìn)一步探討基因型與表型間的關(guān)系。方法:收集經(jīng)臨床表現(xiàn)、血液檢測及影像學(xué)表現(xiàn)診斷為OI的23例患者的病例資料,并提取患者及其親屬的外周血DNA,對(duì)23例先證者首先進(jìn)行COL1A1和COL1A2的直接測序,未發(fā)現(xiàn)突變后,繼續(xù)用靶向二代測序法對(duì)其余罕見基因進(jìn)行外顯子測序,發(fā)現(xiàn)突變位點(diǎn)后,用Sanger測序法對(duì)患者及其親屬的DNA進(jìn)行突變位點(diǎn)驗(yàn)證,并在250例正常對(duì)照人群進(jìn)行對(duì)比,利用生物信息學(xué)技術(shù)、同源分析技術(shù)和突變蛋白空間結(jié)構(gòu)構(gòu)建對(duì)突變位點(diǎn)進(jìn)行功能預(yù)測... 

【文章來源】:上海交通大學(xué)上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:93 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

罕見類型成骨不全的基因鑒定與表型分析


患者3的臨床表現(xiàn)

骨骼,患者


上海交通大學(xué)碩士學(xué)位論文50圖2.患者3的骨骼X線平片。(A)雙下肢X線正位平片可見雙側(cè)股骨、腓骨和脛骨骨皮質(zhì)纖細(xì)、長骨彎曲畸形。(B)左側(cè)上肢正位X線平片可見纖細(xì)彎曲的肱骨、尺骨和橈骨。(C)頭顱側(cè)位圖顯示顱骨縫間骨、平坦寬闊的前額和平坦的鼻梁。(D)右側(cè)脛骨和腓骨x線平片示爆米花樣干骺端和纖細(xì)彎曲的長骨。(E-F)胸腰椎正位X線平片顯示嚴(yán)重脊柱側(cè)凸。家系4先證者4是一名11歲的男孩,來自中國浙江,足月剖宮產(chǎn)出生,出生時(shí)沒有先天畸形。4歲時(shí),他在一次摔倒時(shí)使左手腕骨折。不幸的是,在他的康復(fù)過程中,他的左手腕再次輕微骨折;之后,他的雙側(cè)手腕又發(fā)生了3次骨折。本研究開展之時(shí),他的身高和體重分別為144厘米和38公斤。體格檢查顯示他的雙側(cè)腕關(guān)節(jié)、肘關(guān)節(jié)與髖關(guān)節(jié)過度伸展,鞏膜正常,無聽力損傷和牙本質(zhì)發(fā)育不全。腰椎和股骨頸骨密度Z值分別為-1.8和-2.3。無其他家庭成員骨折,母親45歲,身高159.3cm,骨密度Z評(píng)分正常(腰椎1.2,股骨頸-0.8)3.2基因測序結(jié)果靶向的二代測序幫助我們識(shí)別了23個(gè)患者中8個(gè)患者攜帶有與OI相關(guān)的9個(gè)罕見致病基因的非同義突變,這些基因包括XYLT1、PLOD2、P3H1、SERPINH1、PLS3、CREB3L1、TMEM38B、WNT1和P4HB。另外,我們?cè)?3例患者中共發(fā)現(xiàn)164個(gè)SNP。隨后,利用生物信息學(xué)預(yù)測分析,我們篩選出了4個(gè)基因中的6個(gè)破壞性突變:WNT1、TMEM38B、PLS3和P4HB,同時(shí)將上述突變位點(diǎn)在OI數(shù)據(jù)庫和Pubmed網(wǎng)站上搜索,分析這些可疑致病變異是否為已報(bào)道的突變。我們認(rèn)為這6個(gè)突變是導(dǎo)致疾病發(fā)生的原因(如表6)。在其他19

家系圖,家系圖,測序


上海交通大學(xué)碩士學(xué)位論文52圖3.4個(gè)家系的家系圖及Sanger測序結(jié)果。先證者用箭頭表示,有OI表型的個(gè)體用黑色符號(hào)表示,攜帶者用陰影符號(hào)表示;突變位點(diǎn)用黑色下劃線或箭頭表示。(A)攜帶WNT1突變個(gè)體的譜系和Sanger測序圖。(B)攜帶TMEM38B突變個(gè)體的家系圖和Sanger測序圖。(C)攜帶P4HB突變個(gè)體的家系圖和Sanger測序圖。(D)攜帶PLS3突變個(gè)體的家系圖和Sanger測序圖在家系1中,患者1攜帶有WNT1基因的復(fù)合雜合突變,分別都在3號(hào)外


本文編號(hào):3271791

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