目的:研究長鏈非編碼RNA（Long non-coding RNA,lncRNA）A2M-AS1在乳腺癌（Breast cancer,BC）中差異表達的臨床意義,分析其對乳腺癌細(xì)胞增殖、侵襲和遷移的影響,并初步探討其潛在的分子機制。方法:1、從GEO（Gene expression omnibus）數(shù)據(jù)庫中下載乳腺癌基因測序的原始數(shù)據(jù),利用R語言篩選出所有差異表達的mRNAs和lncRNAs,并分析A2M-AS1在乳腺癌中差異表達的臨床意義。2、在收集的96例人乳腺癌組織和64例癌旁組織中,采用實時熒光定量PCR（Real time fluorescence quantitative reverse transcription PCR,qRT-PCR）檢測A2M-AS1的表達水平。3、根據(jù)A2M-AS1表達的平均值,將A2M-AS1分為高表達組和低表達組,Kaplan-meier分析A2M-AS1高低表達與乳腺癌預(yù)后的相關(guān)性。4、CCK-8實驗檢測A2M-AS1對乳腺癌細(xì)胞增殖的影響。5、Transwell和劃痕實驗檢測A2M-AS1對乳腺癌細(xì)胞侵襲和遷移的影響。6、分別敲降和過表達A... 

【文章來源】：江南大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：48 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

GEO數(shù)據(jù)集中乳腺癌中的差異表達基因和lncRNAsFigure1.DifferentialexpressedgenesandlncRNAsinbreastcancerinGEOdataset注：A：GSE45827數(shù)據(jù)庫中通過層次聚類鑒定的399個差異表達的lncRNA和11070個差異表達的

圖 1. GEO 數(shù)據(jù)集中乳腺癌中的差異表達基因和 lncRNAsFigure 1. Differential expressed genes and lncRNAs in breast cancer in GEO dataset注：A：GSE45827 數(shù)據(jù)庫中通過層次聚類鑒定的 399 個差異表達的 lncRNA 和 11070 個差異表達的mRNA 的火山圖。B：GSE65216 數(shù)據(jù)庫中通過層次聚類鑒定的 383 個差異表達的 lncRNA 和 11164個差異表達的 mRNA 的火山圖。2.2.2 A2M-AS1 在乳腺癌中的差異表達在篩選實驗中，我們下載了 GSE45827 和 GSE65194 數(shù)據(jù)集，其中 GSE45827 包括167 例腫瘤組織和 11 例癌旁組織。GSE65194 包括 306 例腫瘤組織和 22 例癌旁組織。經(jīng)分析發(fā)現(xiàn) lncRNAA2M-AS1 在乳腺癌組織中較相鄰非癌組織中表達上調(diào)（圖 2），且具有顯著差異。

江南大學(xué)碩士學(xué)位論文.3 A2M-AS1 表達與乳腺癌臨床病理特征的相關(guān)性進一步研究 A2M-AS1 與乳腺癌臨床病理參數(shù)之間的關(guān)系，發(fā)現(xiàn) A2M-AS1 在 E組織中較 ER 陽性組織中顯著高表達，差異具有統(tǒng)計學(xué)意義（P=0.0028）（圖 3A外，A2M-AS1 在基底樣（P=0.0081）和 HER-2 +（P =0.0209）組織中的表達高腔 B 乳腺癌組織（圖 3 B）, 而基底樣 (n=30)和 HER-2 +(n=41)乳腺癌組織之M-AS1 表達的差異無顯著性（P> 0.05）。


本文編號：3230212