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全基因組外顯子測序篩查青少年特發(fā)性脊柱側(cè)凸可疑致病基因ADAMTS9

發(fā)布時間:2020-06-11 07:36
【摘要】:目的利用全基因組外顯子測序技術(shù)篩查家系A(chǔ)IS的致病基因,并在其它家系A(chǔ)IS及散發(fā)AIS人群中靶向測序驗證,比較AIS病例組與正常對照組致病基因表達(dá)水平的差異,初步探索其可能的致病機(jī)制。方法1)收集南華大學(xué)附屬第一醫(yī)院脊柱外科在2016年6月至2018年1月收治住院或復(fù)查的AIS病人及因外傷收治入院而無其它已知骨科疾病的病人的外周血DNA,收集AIS家系成員及正常對照的外周血淋巴細(xì)胞;2)采用全基因組外顯子測序技術(shù)篩查家系I中的AIS致病基因,測序?qū)ο鬄棰?5(正常),Ⅲ:6(AIS患者)及Ⅲ:7(AIS患者),結(jié)合相關(guān)研究報道的致病基因篩選方法,篩選Ⅲ:6及Ⅲ:7中共有的突變,并從中剔除掉與Ⅲ:5相同的突變,對剩余的候選致病基因進(jìn)行家系共分離,對最終篩選出來的致病基因進(jìn)行軟件信息學(xué)的預(yù)測分析及物種保守性分析;采用靶向測序技術(shù)篩查家系II中的AIS患者及散發(fā)AIS患者的致病基因;3)采用EB病毒轉(zhuǎn)染人外周血B淋巴細(xì)胞,使之成為永生化的B淋巴細(xì)胞,提取總RNA,利用RT-PCR評價致病基因在AIS病例組與正常對照組之間表達(dá)水平的差異。結(jié)果在復(fù)合雜合遺傳模式下,Ⅲ:6及Ⅲ:7(除去Ⅲ:5)共有3個基因7個位點(diǎn)的突變,但這些變異位點(diǎn)均未能實現(xiàn)復(fù)合雜合遺傳模式下的家系I成員的疾病共分離,因此予以剔除;在純合遺傳模式下,Ⅲ:6及Ⅲ:7(除去Ⅲ:5)有12個共有的突變基因,通過家系共分離成功篩查到致病基因突變位點(diǎn):ADAMTS9 c.625CT(純合),且軟件信息學(xué)預(yù)測提示該位點(diǎn)突變有害,物種保守性分析提示該位點(diǎn)高度保守;靶向測序家系II中AIS成員中的ADAMTS9基因,成功篩查到復(fù)合雜合突變ADAMTS9 c.625CT(雜合)+ADAMTS9 c.4811GA(雜合),并實現(xiàn)了復(fù)合雜合模式下家系II成員的疾病共分離;在35例散發(fā)病人中發(fā)現(xiàn)一例AIS病人C5存在ADAMTS9的復(fù)合雜合突變ADAMTS9 c.625CT+ADAMTS9 c.4811GA,94例正常對照中沒有發(fā)現(xiàn)ADAMTS9 c.625CT(純合)及ADAMTS9 c.4811GA(雜合),但在1例正常對照中發(fā)現(xiàn)了ADAMTS9 c.625CT(雜合),經(jīng)統(tǒng)計學(xué)分析,我們發(fā)現(xiàn)AIS組ADAMTS9的驗證率顯著高于正常對照組(p0.05),sanger測序未篩查到POC5、AKAP2及MAPK7的突變,RT-PCR結(jié)果顯示兩例家系中的AIS成員的ADAMTS9的表達(dá)水平均高于正常對照,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(p0.01)。結(jié)論1.ADAMTS9基因是AIS的可疑致病基因;2.ADAMTS9基因的過表達(dá)可能參與AIS的致病機(jī)制。
【圖文】:

患者,脊柱側(cè)凸,特發(fā)性脊柱側(cè)凸


脊柱側(cè)凸是一種三維脊柱畸形,這種三維畸形表現(xiàn)為一段或多段脊柱側(cè)向彎曲并伴有椎體旋轉(zhuǎn)。在影像學(xué)上,使用 Cobb's 方法測量脊柱的側(cè)向彎曲,如果Cobb’s 角度大于 10°即可定義為脊柱側(cè)凸(圖 1d),Cobb's 角度較小的脊柱側(cè)凸在外表上往往沒有明顯的陽性體征,嚴(yán)重的脊柱側(cè)凸可表現(xiàn)為外觀畸形(圖 1a),雙肩失衡及剃刀背畸形(圖 1b),甚至伴有心肺功能障礙的體征表現(xiàn)。根據(jù)病因可分為特發(fā)性脊柱側(cè)凸,先天性脊柱側(cè)凸,神經(jīng)肌肉型脊柱側(cè)凸,神經(jīng)纖維瘤病合并脊柱側(cè)凸,間充質(zhì)病變合并脊柱側(cè)凸,骨軟骨營養(yǎng)不良合并脊柱側(cè)凸及代謝性障礙合并脊柱側(cè)凸等[1]。其中特發(fā)性脊柱側(cè)凸是以上幾種側(cè)凸種類中最為常見的,特發(fā)性脊柱側(cè)凸的診斷除滿足側(cè)凸的基本要求外,還需滿足影像學(xué)上無脊柱結(jié)構(gòu)畸形(圖 1c),并排除掉其他可能的致病病因,根據(jù)發(fā)病年齡的不同,又可細(xì)分為幼兒型脊柱側(cè)凸,少兒型脊柱側(cè)凸及青少年特發(fā)性脊柱側(cè)凸,,其中青少年特發(fā)性脊柱側(cè)凸(adolescent idiopathic scoliosis,AIS)的發(fā)病率最高[2]。

譜圖,家系,譜圖,脊柱側(cè)凸


2 實驗材料與方法2.1 研究對象2.1.1 全基因組外顯子測序研究對象2.1.1.1 研究家系一般情況在湖南省衡陽縣收集了一個 AIS 家系(家系 I),家系中的兩名 AIS 患者經(jīng)過脊柱外科醫(yī)生的確診,符合該病的診斷標(biāo)準(zhǔn)。詳細(xì)資料如下:先證者家族 3 代共 20 人,我們共采集到 14 例,其中男 7 例,女 7 例,患者2 例(圖 2)。先證者 III:6,女,17 歲,14 歲發(fā)現(xiàn)脊柱側(cè)凸,于脊柱外科行矯形手術(shù)治療(圖 3);患者 III:7,男,14 歲,14 歲診斷為 AIS,于脊柱外科行手術(shù)治療(圖 4);余家系成員經(jīng)詳細(xì)的病史詢問及體格檢查,對于懷疑側(cè)彎者,行胸腰椎正側(cè)位 X 片檢查,均無脊柱側(cè)凸。
【學(xué)位授予單位】:南華大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:R726.8

【參考文獻(xiàn)】

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8 王斌;孫強(qiáng);邱勇;劉臻;邱旭升;馬兆龍;孫旭;夏才偉;;青少年特發(fā)性脊柱側(cè)凸青春期生長發(fā)育形態(tài)學(xué)特征[J];中華骨科雜志;2006年09期



本文編號:2707588

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