糖蛋白Ibα（GPIbα）是血小板黏附受體糖蛋白Ib-IX-V復(fù)合物的主要成員,介導(dǎo)血小板在高剪切率環(huán)境黏附到血管內(nèi)皮附著的血管性血友病因子（VWF）,引起血小板的分泌和聚集。抑制GPIbα的與VWF的結(jié)合,或抑制這種結(jié)合的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)可以阻止動(dòng)脈粥樣硬化引發(fā)的血栓形成,而不會(huì)干擾生理性的止血。因此,GPIbα是抗血栓藥物的理想靶點(diǎn),對(duì)這個(gè)分子與VWF、與細(xì)胞骨架的相互作用以及這些過(guò)程中的力-化學(xué)信號(hào)的傳導(dǎo)的清楚認(rèn)識(shí)是開(kāi)發(fā)這類抗血栓藥物的前提。本研究的第一部分根據(jù)流動(dòng)分子動(dòng)力學(xué)模擬中GPIbα的β開(kāi)關(guān)部位的構(gòu)象改變,討論了這種構(gòu)象改變對(duì)這個(gè)分子與VWF結(jié)合的調(diào)控;第二部分根據(jù)拉伸分子動(dòng)力學(xué)模擬中GPIbα的羧基端結(jié)構(gòu)域和細(xì)絲蛋白A的IgFLNa17結(jié)構(gòu)域間分子鍵受力斷裂的情況,討論了該分子鍵傳導(dǎo)力-化學(xué)信號(hào)的可能機(jī)制。本研究使用的分子動(dòng)力學(xué)模擬技術(shù)是計(jì)算生物學(xué)、結(jié)構(gòu)化學(xué)和藥物設(shè)計(jì)等領(lǐng)域重要的研究方法,該方法用計(jì)算機(jī)進(jìn)行數(shù)值模擬重現(xiàn)系統(tǒng)的物理行為,據(jù)此解析生物大分子的性質(zhì)。GPIbα細(xì)胞外的GPIbαN結(jié)構(gòu)域的β開(kāi)關(guān)部位直接與VWF結(jié)合。在復(fù)合物中,該部位的構(gòu)象是β發(fā)夾。血流可能促使β開(kāi)關(guān)部... 

【文章來(lái)源】：中山大學(xué)廣東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】：154 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
第1章 前言
    1.1 研究背景和意義
    1.2 研究現(xiàn)狀
    1.3 主要研究思路
第2章 分子動(dòng)力學(xué)模擬
    2.1 簡(jiǎn)介
    2.2 基本理論
    2.3 應(yīng)用軟件
第3章 GPIbα的β開(kāi)關(guān)的分子動(dòng)力學(xué)模擬
    3.1 引言
    3.2 材料與方法
    3.3 結(jié)果
    3.4 討論
    3.5 小結(jié)
第4章 GPIbα/IgFLNa17 的 分子動(dòng)力學(xué)模擬
    4.1 引言
    4.2 材料與方法
    4.3 結(jié)果
    4.4 討論
    4.5 小結(jié)
第5章 總結(jié)和展望
參考文獻(xiàn)
附錄A GPIbαN 結(jié)構(gòu)域自由分子動(dòng)力學(xué)模擬的配置
    A.1 第一個(gè)準(zhǔn)備階段
    A.2 第二個(gè)準(zhǔn)備階段
    A.3 生產(chǎn)性階段
附錄B GPIbα的β開(kāi)關(guān)分子動(dòng)力學(xué)模擬的配置
    B.1 自由分子動(dòng)力學(xué)
    B.2 流動(dòng)分子動(dòng)力學(xué)
附錄C GPIbα/IgFLNa17 的 SMD 模擬 的
    C.1 準(zhǔn)備階段
    C.2 生產(chǎn)性階段
附錄D GPIbα的β開(kāi)關(guān)構(gòu)象的原始數(shù)據(jù)
    D.1 主鏈氫鍵的形成
    D.2 β開(kāi)關(guān)殘基的旋轉(zhuǎn)
附錄E GPIbα/IgFLNa17 的 SMD 模擬 的
在學(xué)期間發(fā)表論文情況
致謝


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]出血與血栓性疾病的診斷和治療進(jìn)展[J]. 阮長(zhǎng)耿.  臨床血液學(xué)雜志. 2010(01)
[2]細(xì)胞-分子生物力學(xué)研究進(jìn)展[J]. 呂守芹,楊帆,龍勉.  醫(yī)用生物力學(xué). 2009(02)
[3]1959～2002年廣西城鄉(xiāng)居民膳食結(jié)構(gòu)的變遷[J]. 陳興樂(lè),唐振柱,陳正清,林霞,張惠君,韓彥彬,黃兆勇,楊娟,阮青,陳欽艷,方志峰,陳莉,黃江平,劉仲霞,李玉英,梁裕玉,尹進(jìn)祿.  廣西醫(yī)學(xué). 2008(01)



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