本文關(guān)鍵詞：關(guān)聯(lián)規(guī)則挖掘結(jié)合PSO的基因-疾病關(guān)系自動(dòng)提取方法

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【摘要】：針對(duì)生物醫(yī)學(xué)可用數(shù)據(jù)越來(lái)越龐大而導(dǎo)致管理人員很難從非結(jié)構(gòu)化文件中整理出有用信息的問(wèn)題,提出了一種基因-疾病關(guān)聯(lián)規(guī)則提取方法 .首先從MEDLINE和OMIM準(zhǔn)備實(shí)驗(yàn)語(yǔ)料庫(kù),應(yīng)用解析器產(chǎn)生一些語(yǔ)法信息;然后學(xué)習(xí)所有可能的規(guī)則,利用粒子群優(yōu)化進(jìn)行優(yōu)化學(xué)習(xí),從不相關(guān)句子中區(qū)分相關(guān)的;最后,計(jì)算學(xué)習(xí)規(guī)則的分?jǐn)?shù),選擇感興趣的規(guī)則,并生成一組有用的關(guān)聯(lián)規(guī)則.以精度、召回率和F-分?jǐn)?shù)為評(píng)價(jià)指標(biāo)的實(shí)驗(yàn)證明了提出方法的有效性.實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,提出的方法最大精度、召回率和F-分?jǐn)?shù)可分別高達(dá)79.2%、65.1%、68.5%,相比手動(dòng)規(guī)則集,提出的方法更加完整.
【作者單位】： 南通大學(xué)附屬醫(yī)院信息中心;
【關(guān)鍵詞】： 關(guān)聯(lián)規(guī)則 基因-疾病關(guān)系 粒子群優(yōu)化 生物醫(yī)學(xué) 自動(dòng)提取 淺解析器
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(61171146)
【分類號(hào)】：R318
【正文快照】： 過(guò)去幾年中隨著醫(yī)學(xué)生物學(xué)知識(shí)的指數(shù)增長(zhǎng),提供給研究者和臨床醫(yī)生可用的生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)也因此急劇增加[1].基因與疾病關(guān)系是一個(gè)重要的研究領(lǐng)域[2],是理解疾病屬性和開(kāi)發(fā)預(yù)防診斷治療新技術(shù)等人類健康應(yīng)用程序的一個(gè)基本挑戰(zhàn)[3].已經(jīng)有許多可探索基因與疾病之間關(guān)系的方法,部分，

本文編號(hào)：1002796