本文關(guān)鍵詞：漢族人群銀屑病和強(qiáng)直性脊柱炎易感位點(diǎn)的相關(guān)性研究

  更多相關(guān)文章： 銀屑病 強(qiáng)直性脊柱炎 全基因組關(guān)聯(lián)分析 單核苷酸多態(tài)性

【摘要】：研究背景： 銀屑�。╬soriasis, OMIM㥮177900）是一種常見的慢性炎癥性皮膚病，以紅斑、鱗屑為主要臨床特征，具有明顯的復(fù)發(fā)特性。據(jù)流行病統(tǒng)計(jì)結(jié)果發(fā)現(xiàn)，該病可發(fā)生于各人種，但是不同種族發(fā)生率有明顯的差異。遺傳因素和免疫介導(dǎo)在本病發(fā)生過程中扮演了重要角色，而且多種免疫調(diào)節(jié)劑對(duì)此病療效顯著，因此銀屑病也被認(rèn)為是一種自身免疫性疾病。13個(gè)銀屑病易感位點(diǎn)已被OMIM收錄，為：PSORS1，PSORS2，PSORS3，PSORS4，PSORS5，PSORS6，PSORS7，PSORS8，PSORS9，PSORS10，PSORS11，，PSORS12和PSORS13，分別位于6p21.3、17q25、4q、1q21、3q21、19p13、1p、16q、4q31、18p11、5q31.1、20q13和6p21。一些發(fā)現(xiàn)也證明銀屑病和其他疾病如自身免疫系統(tǒng)疾病，如強(qiáng)直性脊柱炎（Ankylosingspondylitis, AS）、克羅恩腸�。–rohn’s Disease, CD）等，有著共同的易感基因。HLA-DR7在英國(guó)與幼年型AS有關(guān)，而其同時(shí)也與Ⅰ型銀屑病相關(guān)�；騃L23R和ERAP1也已被證明同時(shí)與銀屑病和AS相關(guān)，而且臨床上10%的AS患者同時(shí)患有銀屑病。病因上，二者也有一致性。AS是一種慢性進(jìn)行性炎癥性以脊柱關(guān)節(jié)受累為主的免疫性疾病，大量研究顯示AS是一種遺傳病。遺傳因素在其發(fā)病過程中起主導(dǎo)作用,相關(guān)基因除HLA-B27外,尚有HLA區(qū)域內(nèi)及HLA區(qū)域外的其他基因參與，已發(fā)現(xiàn)的基因和位點(diǎn)IL23R、ERAP1、rs4672495（2p15）、rs4333130（4q21）、rs2242944(21q22)、rs4552569（5q14.3）和非同義核苷酸多態(tài)性（non-synonymoussingle nucleotide polymorphism, nsSNP) rs4077515（9q34.3）和位于KIF21B的rs2297909（1q32）。國(guó)際單體圖型計(jì)劃（Human Haplotype Map, HapMap）的完成和廉價(jià)高效的高通量基因分型技術(shù)的出現(xiàn)，為全基因組水平搜尋復(fù)雜疾病易感基因的方法即全基因組關(guān)聯(lián)研究（Genome-wide association study, GWAS）提供了支撐，全基因組關(guān)聯(lián)研究（GWAS）在常見復(fù)雜疾病的遺傳學(xué)研究中有更高的效力。為了更好地揭示銀屑病和AS之間的關(guān)系，也為了更好地揭示銀屑病的遺傳學(xué)依據(jù)，本研究以歐美人群AS患者全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS）數(shù)據(jù)為基礎(chǔ)，在中國(guó)漢族銀屑病患者中（2208病例和2208對(duì)照）進(jìn)行驗(yàn)證。 目的：研究歐美人群強(qiáng)直性脊柱炎易感位點(diǎn)在中國(guó)漢族人群銀屑病中的作用，搜尋兩種疾病之間的遺傳共性和異質(zhì)性。 方法：從歐美人群強(qiáng)直性脊柱炎患者的全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS）發(fā)現(xiàn)的易感位點(diǎn)中選擇8個(gè)SNP位點(diǎn)，利用Sequenom Massarray驗(yàn)證平臺(tái)在中國(guó)漢族人群2208例銀屑病病例和2208例正常對(duì)照中進(jìn)行驗(yàn)證，用Plink1.07軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。 結(jié)果：1.8個(gè)SNP位點(diǎn)等位基因的頻率分布在病例組與對(duì)照組間的差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（P0.05）。2.將病例按照臨床表型分組后進(jìn)行分層比較，rs2297909等位基因頻率分布在對(duì)照組和銀屑病伴家族史病例組之間的差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（P=0.01），有無家族史組間的差異也有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（P=0.01）；在對(duì)照組和發(fā)病年齡40歲組間的差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（P=0.03），在發(fā)病年齡≤40歲和發(fā)病年齡40歲組間的差異也有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（P=0.0016）。3.rs6854711等位基因的頻率分布在對(duì)照組與發(fā)病年齡40歲間的差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（P=0.049）。4.其余6個(gè)位點(diǎn)等位基因的頻率分布在分層比較中的差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（P0.05）。 結(jié)論：本研究在中國(guó)漢族人群銀屑病病例和對(duì)照中對(duì)歐美人群報(bào)道的AS易感位點(diǎn)進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析。首次發(fā)現(xiàn)rs2297909（1q32）與銀屑病家族史和發(fā)病年齡均相關(guān)，rs6854711（4q21）與銀屑病發(fā)病年齡相關(guān)。在其余6個(gè)位點(diǎn)中未發(fā)現(xiàn)與中國(guó)漢族人群銀屑病相關(guān)，提示在這兩種疾病不同人群之間可能存在遺傳異質(zhì)性。
【關(guān)鍵詞】：銀屑病 強(qiáng)直性脊柱炎 全基因組關(guān)聯(lián)分析 單核苷酸多態(tài)性
【學(xué)位授予單位】：安徽醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2013
【分類號(hào)】：R758.63;R593.23
【目錄】：

• 目錄4-6
• 英文縮略詞表6-7
• 中文摘要7-9
• Abstract9-11
• 1．引言11-17
• 2．材料和方法17-39
• 2.1 研究對(duì)象17-18
• 2.2 研究方法18-19
• 2.3 實(shí)驗(yàn)試劑19-20
• 2.3.1 DNA 提取試劑19
• 2.3.2 電泳用試劑19
• 2.3.3 標(biāo)準(zhǔn)化 DNA 用試劑19-20
• 2.3.4 基因分型用試劑20
• 2.4 實(shí)驗(yàn)儀器20-22
• 2.4.1 DNA 提取器材20-21
• 2.4.2 電泳的儀器21
• 2.4.3 DNA 標(biāo)準(zhǔn)化儀器21-22
• 2.5 分析軟件和電子數(shù)據(jù)庫(kù)查詢信息22-23
• 2.6 實(shí)驗(yàn)方法和步驟23-39
• 2.6.1 全血標(biāo)本采集23-24
• 2.6.2 基因組 DNA 提取及注意事項(xiàng)24-25
• 2.6.3 基因組 DNA 電泳25-26
• 2.6.4 DNA 濃度標(biāo)準(zhǔn)化26-27
• 2.6.5 Sequenom MassArray 系統(tǒng)基因分型27-39
• 2.6.5.1 SNP 點(diǎn)的選擇27
• 2.6.5.2 引物設(shè)計(jì)及合成27-30
• 2.6.5.3 Sequenom 實(shí)驗(yàn)日程安排30-37
• 2.6.5.4 Plink1.03 軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析37-39
• 3．結(jié)果39-44
• 4．討論44-46
• 5．結(jié)論46-47
• 6．參考文獻(xiàn)47-50
• 附錄50-52
• 致謝52-54
• 課題綜述54-60
• 參考文獻(xiàn)57-60

【共引文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前8條

1 常樹霞;陳永鋒;;Th17細(xì)胞與銀屑病[J];皮膚性病診療學(xué)雜志;2010年01期

2 吳歆;徐滬濟(jì);吳寧;;IL-23R的研究現(xiàn)狀[J];中國(guó)熱帶醫(yī)學(xué);2008年01期

3 李洪武;;地蒽酚蠟棒短程接觸療法聯(lián)合窄譜中波紫外線治療尋常型斑塊狀銀屑病[J];實(shí)用皮膚病學(xué)雜志;2010年04期

4 李敏;唐先發(fā);朱誠(chéng)W

本文編號(hào)：943712