基于MCCA的痤瘡宏基因組數(shù)據(jù)輔助分析
發(fā)布時(shí)間:2024-11-20 22:27
痤瘡作為常見皮膚病之一,發(fā)病機(jī)制復(fù)雜,其中微生物定植在痤瘡發(fā)病中的作用是一個(gè)熱點(diǎn)研究問題。本文從宏基因組學(xué)的角度,利用機(jī)器學(xué)習(xí)方法分析痤瘡宏基因組數(shù)據(jù),包括痤瘡患者的患病皮膚(diseased skin, DS)樣本集和健康皮膚(healthy skin, HS)樣本集,以及正常對(duì)照組(normal control, NC)樣本集。為了同時(shí)分析3組樣本集以獲得可以區(qū)分不同樣本集的脂質(zhì),使用多重集典型相關(guān)分析(multi-set canonical correlation analysis, MCCA)方法進(jìn)行研究。實(shí)驗(yàn)結(jié)果可得到僅對(duì)某一樣本集有顯著影響的脂質(zhì),以及同時(shí)對(duì)3個(gè)樣本集影響程度不同的脂質(zhì),這些脂質(zhì)可以作為判別皮膚狀態(tài)的指標(biāo),用于輔助指導(dǎo)皮膚痤瘡疾病的診斷、預(yù)后和治療。
【文章頁數(shù)】:6 頁
本文編號(hào):4012447
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