研究背景:近年來研究表明腸道微生物群在宿主穩(wěn)態(tài)及免疫應(yīng)答中起關(guān)鍵作用,銀屑病為免疫介導(dǎo)的多基因遺傳性皮膚病,越來越多的研究表明腸道微生物群可能在銀屑病的發(fā)病中致病作用,但目前銀屑病的腸道微生物組的成分仍然沒有達(dá)成共識(shí)。研究目的:為更好地了解銀屑病與腸道微生物之間的關(guān)系,我們通過16S測(cè)序觀察銀屑病患者與正常健康人群之間的菌群結(jié)構(gòu)及相互的差異性,為洞察銀屑病的發(fā)病機(jī)制及開發(fā)新型治療提供有利的依據(jù)。研究方法:選取20名慢性斑塊型銀屑病患者及相對(duì)應(yīng)的20名健康對(duì)照組,收集受試者的糞便樣本,進(jìn)行DNA提取、目的片段PCR擴(kuò)增、構(gòu)建文庫(kù)、上機(jī)測(cè)序、生物學(xué)信息分析等步驟。研究結(jié)果:1.平均每個(gè)樣品測(cè)得84746條reads,經(jīng)過質(zhì)控平均得到80155條有效數(shù)據(jù),質(zhì)控有效率達(dá)94.63%。以97%的一致性將序列聚類成為OTUs,共得到1362個(gè)OTU,我們發(fā)現(xiàn)在門水平上,其相對(duì)豐度排名靠前的物種包括:Firmicutes（厚壁菌門）、Bacteroidetes（擬桿菌門）、Proteobacteria（變形菌門）、Actinobacteria（放線菌門）、Tenericutes（軟壁菌門）、Verr... 

【文章來源】：安徽醫(yī)科大學(xué)安徽省

【文章頁(yè)數(shù)】：74 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

說明：圖中每個(gè)圈表示每個(gè)（組）樣本，圈和圈重疊部分的數(shù)字代表樣本（組）之間

28圖 3.說明：稀釋曲線中（左側(cè)），橫坐標(biāo)是從某個(gè)樣本中隨機(jī)抽取的測(cè)序樣品的數(shù)量，縱坐標(biāo)為基于該測(cè)序條數(shù)能構(gòu)建的 OTU 數(shù)量，用來反映測(cè)序深度情況，不同的樣本使用不同顏色的曲線表示；Rank Abundance 曲線中（右側(cè)），橫坐標(biāo)是按 OTUs 豐度排序的序列號(hào)，縱坐標(biāo)是相應(yīng)的 OTUs 的相對(duì)豐度，不同的樣本由不同的顏色的折線表示。4.2.3 Alpha 多樣性指數(shù)組間差異分析通過 Wilcoxon 秩和檢驗(yàn)，發(fā)現(xiàn)測(cè)得的 observed_species、Shannon、simpson、chao1、ACE、PD_whole_tree 指數(shù)在 PSO_Control 組間均不具有明顯的差異，顯著性 p 值分別為 0.6072、0.8831、0.7867、0.3273、0.4291、0.3720（見表 4）。即細(xì)

PSO 439 5.438 0.931 479.053 484.548p 值 0.6072 0.8831 0.7867 0.3273 0.42914.3 銀屑病患者及健康對(duì)照組的樣品比較分析Beta Diversity 是對(duì)不同樣品的微生物群落組成的比離(以物種間的遺傳序列信息為參考)和 Bray-Curtis 距離個(gè)方面)進(jìn)行降維分析。4.3.1 主坐標(biāo)分析（PCoA）PCoA 通過一系列特征值和特征向量排序從多維數(shù)結(jié)構(gòu)[62]。我們基于 Unweighted Unifrac 距離執(zhí)行 PCoA 率的主坐標(biāo)組合，如下圖所示。結(jié)果顯示銀屑病患者和有顯著的分離，使用 PC1 和 PC2 的前兩個(gè)主成分得分和 10.35%)。兩組之間的分離明顯，這表明兩組之間的

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]Dysbiosis of gut microbiota was closely associated with psoriasis[J]. Linsheng Huang,Renyuan Gao,Ning Yu,Yefei Zhu,Yangfeng Ding,Huanlong Qin.  Science China（Life Sciences）. 2019(06)
[2]不加權(quán)算術(shù)平均組對(duì)方法的改進(jìn)及應(yīng)用[J]. 李玉鑑,徐立業(yè).  北京工業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2007(12)



本文編號(hào)：3476112