研究背景:近年來研究表明腸道微生物群在宿主穩(wěn)態(tài)及免疫應答中起關鍵作用,銀屑病為免疫介導的多基因遺傳性皮膚病,越來越多的研究表明腸道微生物群可能在銀屑病的發(fā)病中致病作用,但目前銀屑病的腸道微生物組的成分仍然沒有達成共識。研究目的:為更好地了解銀屑病與腸道微生物之間的關系,我們通過16S測序觀察銀屑病患者與正常健康人群之間的菌群結構及相互的差異性,為洞察銀屑病的發(fā)病機制及開發(fā)新型治療提供有利的依據(jù)。研究方法:選取20名慢性斑塊型銀屑病患者及相對應的20名健康對照組,收集受試者的糞便樣本,進行DNA提取、目的片段PCR擴增、構建文庫、上機測序、生物學信息分析等步驟。研究結果:1.平均每個樣品測得84746條reads,經(jīng)過質控平均得到80155條有效數(shù)據(jù),質控有效率達94.63%。以97%的一致性將序列聚類成為OTUs,共得到1362個OTU,我們發(fā)現(xiàn)在門水平上,其相對豐度排名靠前的物種包括:Firmicutes（厚壁菌門）、Bacteroidetes（擬桿菌門）、Proteobacteria（變形菌門）、Actinobacteria（放線菌門）、Tenericutes（軟壁菌門）、Verr... 

【文章來源】：安徽醫(yī)科大學安徽省

【文章頁數(shù)】：74 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

說明：圖中每個圈表示每個（組）樣本，圈和圈重疊部分的數(shù)字代表樣本（組）之間

28圖 3.說明：稀釋曲線中（左側），橫坐標是從某個樣本中隨機抽取的測序樣品的數(shù)量，縱坐標為基于該測序條數(shù)能構建的 OTU 數(shù)量，用來反映測序深度情況，不同的樣本使用不同顏色的曲線表示；Rank Abundance 曲線中（右側），橫坐標是按 OTUs 豐度排序的序列號，縱坐標是相應的 OTUs 的相對豐度，不同的樣本由不同的顏色的折線表示。4.2.3 Alpha 多樣性指數(shù)組間差異分析通過 Wilcoxon 秩和檢驗，發(fā)現(xiàn)測得的 observed_species、Shannon、simpson、chao1、ACE、PD_whole_tree 指數(shù)在 PSO_Control 組間均不具有明顯的差異，顯著性 p 值分別為 0.6072、0.8831、0.7867、0.3273、0.4291、0.3720（見表 4）。即細

PSO 439 5.438 0.931 479.053 484.548p 值 0.6072 0.8831 0.7867 0.3273 0.42914.3 銀屑病患者及健康對照組的樣品比較分析Beta Diversity 是對不同樣品的微生物群落組成的比離(以物種間的遺傳序列信息為參考)和 Bray-Curtis 距離個方面)進行降維分析。4.3.1 主坐標分析（PCoA）PCoA 通過一系列特征值和特征向量排序從多維數(shù)結構[62]。我們基于 Unweighted Unifrac 距離執(zhí)行 PCoA 率的主坐標組合，如下圖所示。結果顯示銀屑病患者和有顯著的分離，使用 PC1 和 PC2 的前兩個主成分得分和 10.35%)。兩組之間的分離明顯，這表明兩組之間的

【參考文獻】：
期刊論文
[1]Dysbiosis of gut microbiota was closely associated with psoriasis[J]. Linsheng Huang,Renyuan Gao,Ning Yu,Yefei Zhu,Yangfeng Ding,Huanlong Qin.  Science China（Life Sciences）. 2019(06)
[2]不加權算術平均組對方法的改進及應用[J]. 李玉鑑,徐立業(yè).  北京工業(yè)大學學報. 2007(12)



本文編號：3476112