【摘要】：研究背景:白癜風(fēng)(vitiligo)是一種免疫相關(guān)的原發(fā)性皮膚疾病,是最常見的色素脫失性疾病,主要累及人體的皮膚、毛發(fā)和黏膜等處,臨床上主要表現(xiàn)為邊界清楚的乳白色色素減退斑或脫失斑,其發(fā)病主要由于選擇性黑素細(xì)胞減少或功能障礙。白癜風(fēng)好發(fā)于青壯年,大部分在30歲之前發(fā)病,起病通常不伴有任何不適癥狀,其在全世界范圍內(nèi)的患病率約為0.5%~2%,在中國人群中的患病率約為0.56%。白癜風(fēng)為皮膚科的眾多頑疾之一,其病情遷延難治,目前尚無可根治的方法,由于其具有損容性,嚴(yán)重影響患者的心理健康,造成其生活質(zhì)量下降,也給家庭和社會帶來了一定的經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)。白癜風(fēng)屬于獲得性色素疾病,研究者發(fā)現(xiàn)嚴(yán)重的曬傷、外傷、妊娠、精神因素和有害化學(xué)物質(zhì)常會誘導(dǎo)其發(fā)生,而且白癜風(fēng)患者中其他自身免疫性疾病的發(fā)生率也較正常人高。關(guān)于白癜風(fēng)的發(fā)病機(jī)制,迄今尚未完全闡明,研究者先后提出了自身免疫、遺傳、神經(jīng)因子、氧化應(yīng)激等學(xué)說以解釋其發(fā)病,但每種學(xué)說都不足以完全闡明其發(fā)病機(jī)制,目前在這些學(xué)說中支持證據(jù)較多的有自身免疫學(xué)說、遺傳學(xué)說等,故有學(xué)者認(rèn)為白癜風(fēng)是由遺傳和環(huán)境風(fēng)險因素共同作用引起自身免疫系統(tǒng)攻擊皮膚黑素細(xì)胞所造成。人類白細(xì)胞抗原(Human leukocyte antigen,HLA)系統(tǒng)在人體免疫調(diào)節(jié)過程中發(fā)揮著重要作用,因此,在免疫相關(guān)疾病中,其一直是研究者關(guān)注的重點之一。20世紀(jì)后期,研究者開始對HLA與白癜風(fēng)的相關(guān)性進(jìn)行探索,研究人員在白癜風(fēng)病例和對照中先后采用血清學(xué)分型實驗和以聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)為基礎(chǔ)的DNA分型實驗進(jìn)行關(guān)聯(lián)研究;自2010年起,研究者開始采用以高密度基因分型芯片為主的全基因組關(guān)聯(lián)研究方法對主要組織相容性復(fù)合體(Major histocompatibility complex,MHC)區(qū)域與白癜風(fēng)的易感性在大樣本人群中進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析。盡管這些方法都取得了一定的成果,但是它們在直接研究MHC區(qū)域內(nèi)的HLA等位基因及其對應(yīng)的氨基酸功能位點上受到了研究費(fèi)用和技術(shù)上的限制。于是Jia等在2013年開發(fā)出了HLA基因型填補(bǔ)方法(SNP2HLA),該方法使得研究者能夠以高密度基因分型芯片數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),通過HLA基因型填補(bǔ)的方法對HLA等位基因以及其對應(yīng)的氨基酸位點與免疫相關(guān)疾病的關(guān)系進(jìn)行研究。通過這種基因型填補(bǔ)方法,研究者先后在銀屑病、系統(tǒng)性紅斑狼瘡、彌漫性毒性甲狀腺腫等免疫性疾病的研究中取得了一定成果,為理解MHC區(qū)域遺傳變異在疾病中的作用機(jī)制打下了基礎(chǔ)。目的:依靠中國漢族人特異性MHC區(qū)域參考數(shù)據(jù)集,利用HLA基因型填補(bǔ)方法對白癜風(fēng)患者與對照人群的MHC區(qū)域開展精細(xì)定位研究,進(jìn)而探索整個MHC區(qū)域遺傳變異在白癜風(fēng)發(fā)病中的作用。方法:先采用Illumina Human610-Quad Bead Chips芯片對中國漢族1,149例白癜風(fēng)患者和1,740例健康對照進(jìn)行全基因組基因分型,經(jīng)過質(zhì)控后提取擴(kuò)展的MHC區(qū)域單核苷酸多態(tài)性(Single-nucleotide polymorphism,SNP)位點分型數(shù)據(jù),利用SNP2HLA軟件,并依靠大樣本的漢族人MHC區(qū)域參考數(shù)據(jù)集,進(jìn)行MHC區(qū)域HLA基因型填補(bǔ),進(jìn)而研究SNPs、HLA等位基因和HLA基因?qū)?yīng)的氨基酸位點和與白癜風(fēng)的相關(guān)性,并通過逐步回歸分析進(jìn)一步確定MHC區(qū)域獨(dú)立的白癜風(fēng)易感位點,最后再進(jìn)行連鎖分析、單倍型分析、表達(dá)數(shù)量性狀基因座(Expression quantitative trait loci,e QTL)分析、遺傳貢獻(xiàn)度分析、基因交互作用分析、遺傳風(fēng)險分?jǐn)?shù)計算和基因型-表型分析等深入研究。結(jié)果:通過對填補(bǔ)后的數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)控和關(guān)聯(lián)分析,我們發(fā)現(xiàn)有994個SNPs、13個HLA等位基因和40個HLA氨基酸位點達(dá)到了本研究的顯著性水平(P2.32×10-6),與白癜風(fēng)發(fā)病相關(guān);其中,四位的HLA等位基因有7個,包括3個新發(fā)現(xiàn)的(HLA-DQB1*02:02、HLA-DQA1*02:01和HLA-DPB1*17:01)和4個既往報道過的(HLA-B*13:02、HLA-C*06:02、HLA-A*30:01和HLA-DRB1*07:01)。進(jìn)一步的逐步回歸分析在整個MHC區(qū)域發(fā)現(xiàn)4個獨(dú)立的白癜風(fēng)易感位點,包括HLA-DQβ1第135號氨基酸位點、HLA-B第45-46號氨基酸位點、rs892666和rs9268832。再進(jìn)一步的深入分析發(fā)現(xiàn),一個超長HLA基因單倍型HLA-A*30:01-C*06:02-B*13:02-DRB1*07:01-DQA1*02:01-DQB1*02:02-DPB1*17:01與白癜風(fēng)發(fā)病相關(guān);e QTL分析提示,HLA-G和HLA-DRA可能為白癜風(fēng)的易感基因;遺傳貢獻(xiàn)度分析表明,整個MHC區(qū)域能解釋的白癜風(fēng)遺傳度為6.2%;基因交互作用分析顯示,rs9268832可能與rs2051582和rs11593576分別存在交互作用,參與白癜風(fēng)發(fā)病;遺傳風(fēng)險分?jǐn)?shù)計算顯示,白癜風(fēng)患者風(fēng)險分?jǐn)?shù)整體比對照高;基因型-表型分析提示,HLA-DQβ1第135號氨基酸位點與早發(fā)型白癜風(fēng)相關(guān)。結(jié)論:本研究首次采用中國漢族人特異性大樣本MHC區(qū)域參考數(shù)據(jù)集對白癜風(fēng)MHC區(qū)域進(jìn)行精細(xì)定位研究,在整個MHC區(qū)域新發(fā)現(xiàn)了4個獨(dú)立的白癜風(fēng)易感位點,展示了白癜風(fēng)MHC區(qū)域遺傳結(jié)構(gòu)的復(fù)雜性,以及不同人群間白癜風(fēng)易感HLA基因的異同,為闡明MHC區(qū)域遺傳變異在中國漢族白癜風(fēng)人群中的作用機(jī)制奠定了初步的理論基礎(chǔ)。
【學(xué)位授予單位】：安徽醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2018
【分類號】：R758.41
【圖文】：

安徽醫(yī)科大學(xué)博士學(xué)位論文些細(xì)胞因子，參與人體的補(bǔ)體反應(yīng)和炎癥反應(yīng)，發(fā)揮免疫調(diào)節(jié)作用。其中，HLA基因具有豐富多態(tài)性，擁有眾多不同的等位基因，因此其命名也比較復(fù)雜，新的HLA 基因的命名由世界衛(wèi)生組織 HLA 系統(tǒng)命名委員會負(fù)責(zé)，并收錄在其官方網(wǎng)站。截止到 2017 年 12 月份，該網(wǎng)站收錄的 HLA I 類和 II 類等位基因共計 17,695 個。

安徽醫(yī)科大學(xué)博士學(xué)位論文相關(guān)的易感位點（包括 SNPs、經(jīng)典的 HLA 等位基因和 HLA 基態(tài)位點）；接著，通過逐步回歸分析鑒定出整個 MHC 區(qū)域與白立易感位點，并針對找到的獨(dú)立位點進(jìn)行連鎖分析、單倍型分基因座（Expression quantitative trait loci，eQTL）分析等；最后分析、基因交互作用分析、遺傳風(fēng)險分?jǐn)?shù)計算和基因型-表型分，本課題系統(tǒng)地對整個 MHC 區(qū)域（尤其是 HLA 基因）在白癜機(jī)制進(jìn)行了探索，將為日后開展白癜風(fēng)的精準(zhǔn)醫(yī)療奠定了理論技術(shù)路線圖如下（圖 2）。

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前1條

1 中國中西醫(yī)結(jié)合學(xué)會皮膚性病專業(yè)委員會色素病學(xué)組;白癜風(fēng)臨床分型及療效標(biāo)準(zhǔn)(2003年修定稿)[J];中國中西醫(yī)結(jié)合皮膚性病學(xué)雜志;2004年01期

本文編號：2716771