HPV高低危基因型感染宮頸組織的比較蛋白質組學分析及其差異
發(fā)布時間:2020-06-09 17:40
【摘要】: 目的研究HPV感染宮頸組織后蛋白質組表達情況,初步探討高、低;蛐透腥緦m頸組織后表達的差異,并對差異的蛋白點通過質譜分析其意義。 方法首先采用測序法及l(fā)uminex法對42例臨床HPV感染的標本進行高、低;蚍中,分成HPV高危基因型感染宮頸組織的CIN組,低;蛐透腥緦m頸組織的CA組,每組篩選出3例標本,打成混合池,與正常對照3例標本混合池進行雙向凝膠電泳,比較之間的差異,選取差異大的蛋白點,進行MALDI-TOF質譜分析。 結果 1.對HPV感染陽性的31例女性泌尿生殖道尖銳濕疣和11例宮頸CIN組織標本,通過測序法和luminex法分型的結果為:(1)尖銳濕疣標本(無論長在什么部位)或CINⅠ標本,其HPV感染的基因型均為6、11等低危型,測序表現(xiàn)出的是單一峰型,而宮頸CINⅡ~Ⅲ,其HPV感染的基因型均為16、18、33、58等高危型或高危型的混合感染,測序表現(xiàn)出的是單峰或雜峰;(2)外陰和宮頸同時患有尖銳濕疣的標本,其HPV感染的基因型是一致的。 2.我們將每組篩選的3例標本打成混合池,并對宮頸尖銳濕疣、宮頸CIN及對照宮頸上皮組織蛋白質組圖譜進行兩兩比較,HPV低;蛐透腥镜膶m頸尖銳濕疣組織標本與正常宮頸組織標本相比有63個蛋白質點有顯著差異,其差異倍數(shù)最大的為20.2939,宮頸尖銳濕疣組表達上調的蛋白點有51個,下調的有12個蛋白點;HPV高;蛐透腥镜膶m頸CIN組織標本與正常宮頸組織標本相比有47個蛋白質點有顯著差異,,宮頸CIN表達上調的蛋白點有21個,下調的有26個蛋白點,上調倍數(shù)最大的為11.2506倍,下調倍數(shù)最大的為9.00021倍。HPV高;蛐透腥镜膶m頸CIN組織標本與低;蛐透腥镜膶m頸尖銳濕疣組織標本相比有39個蛋白質點有顯著差異,宮頸CIN組較宮頸濕疣組表達上調的蛋白點有15個,下調的有24個蛋白點,上調倍數(shù)最大的為4.24857倍,下調倍數(shù)最大的為3.37334倍。 3.我們對3組26個差異蛋白質點進行分析,獲得了22張肽質量指紋圖,軟件識別其有效肽片段峰后查詢數(shù)據(jù)庫,搜索后得到匹配的有18個蛋白質點,并通過查詢NCBInr數(shù)據(jù)庫,獲得初步鑒定的18個蛋白質的功能信息。它們主要與細胞代謝、信號傳導、細胞分泌、細胞骨架構建及細胞增值、分化與凋亡等相關。 結論本實驗采用雙向凝膠電泳技術得到了HPV高、低;蛐透腥緦m頸組織和正常宮頸上皮組織的蛋白組表達圖譜,并找到兩者之間的差異蛋白點。通過質譜分析及生物信息學技術鑒定了部分差異蛋白,其中一些可能與宮頸腫瘤發(fā)生發(fā)展密切相關。為HPV感染宮頸組織的蛋白質數(shù)據(jù)庫的建立提供了有意義的資料。這些蛋白點能否作為診斷的標記物和治療的靶標,值得進一步研究。
【圖文】:
HPV高;蛐透腥镜膶m頸CIN組織標本與正常宮頸組織標本差異蛋白質組學圖譜的比較
圖12兩組差異蛋白質組學柱狀圖(部分)4.HPV高;蛐透腥镜膶m頸CIN組織標本與低;蛐透腥镜膶m頸尖銳濕慶組織標本的雙向凝膠電泳圖譜的比較(圖13~15)經兩組比較,我們發(fā)現(xiàn)有39個蛋白質點有顯著差異(見表3),宮頸CIN組較宮頸濕洗組表達上調的蛋白點有巧個,下調的有24個蛋白點,上調倍數(shù)最大的為4.24857倍,下調倍數(shù)最大的為3.37334倍。我們共選了5個蛋白點做質譜分析,其ID號分別是:2119、2112、1907、2128、2022、NZ。表3HPV高;蛐透腥镜膶m頸CIN組織標本與低;蛐透腥镜膶m頸CA組織標本蛋白點差異變化GrouPIDMaxe1assAe!assB
【學位授予單位】:中國協(xié)和醫(yī)科大學
【學位級別】:博士
【學位授予年份】:2007
【分類號】:R752.53
本文編號:2705028
【圖文】:
HPV高;蛐透腥镜膶m頸CIN組織標本與正常宮頸組織標本差異蛋白質組學圖譜的比較
圖12兩組差異蛋白質組學柱狀圖(部分)4.HPV高;蛐透腥镜膶m頸CIN組織標本與低;蛐透腥镜膶m頸尖銳濕慶組織標本的雙向凝膠電泳圖譜的比較(圖13~15)經兩組比較,我們發(fā)現(xiàn)有39個蛋白質點有顯著差異(見表3),宮頸CIN組較宮頸濕洗組表達上調的蛋白點有巧個,下調的有24個蛋白點,上調倍數(shù)最大的為4.24857倍,下調倍數(shù)最大的為3.37334倍。我們共選了5個蛋白點做質譜分析,其ID號分別是:2119、2112、1907、2128、2022、NZ。表3HPV高;蛐透腥镜膶m頸CIN組織標本與低;蛐透腥镜膶m頸CA組織標本蛋白點差異變化GrouPIDMaxe1assAe!assB
【學位授予單位】:中國協(xié)和醫(yī)科大學
【學位級別】:博士
【學位授予年份】:2007
【分類號】:R752.53
【引證文獻】
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1 朱寧;Acidiphilium DX1-1細胞膜蛋白質表達譜構建[D];中南大學;2010年
本文編號:2705028
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