癢疹樣營養(yǎng)不良型大皰性表皮松解癥兩家系基因突變分析
【圖文】:
DNA 原液濃度配成濃度為 100ng/μl 的模板 DNA。.5.4 COL7A1 基因引物合成、稀釋和保存.5.4.1 基因的序列獲取在NCBI的網(wǎng)頁(http://www.ncbi.nlm.nih.gov)輸入COL7A1基因的名稱,可該基因的mRNA序列。.5.4.2 基因的Human BLAT Search在UCSC 的數(shù)據(jù)庫(www.genome.ucsc.edu)中,將基因的mRNA的編碼序列行human BLAT 搜尋,從而得到COL7A1基因的基因組序列(圖1)。
始及中止位置限定設(shè)計(jì)條件,從輸出結(jié)果中挑選合適的引物?紤]到測序結(jié)準(zhǔn)確性和測序儀機(jī)器的誤差,以及外顯子/內(nèi)含子交界 50 個堿基以內(nèi)序列可響 mRNA 剪切,一般要超出目標(biāo)序列邊界 50~100bp 左右。引物設(shè)計(jì)主要是針對基因的編碼區(qū)進(jìn)行的,引物設(shè)計(jì)參照以下原則:1) 引物的長度控制在16~24 bp。2) GC含量控制在40%~60%之間。3) 引物自身不能有連續(xù)4個堿基的互補(bǔ),引物間不能有連續(xù)4個堿基的互補(bǔ)4) 引物二聚體及發(fā)夾結(jié)構(gòu)的能值不能過高(通常不超過4.5kcal/mol),,二聚及發(fā)夾結(jié)構(gòu)的能值過高易導(dǎo)致產(chǎn)生引物二聚體帶,并且將降低引物有效度而使PCR反應(yīng)不能正常進(jìn)行。5) 對于某些相鄰的片段較短的外顯子且兩外顯子間的內(nèi)含子亦較短的片段可合并設(shè)計(jì)成一對引物(如外顯子3、4設(shè)計(jì)成一對引物等)。
【學(xué)位授予單位】:安徽醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2007
【分類號】:R758.5
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本文編號:2654436
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