高加索人群銀屑病易感位點與中國漢族人尋常型銀屑病相關(guān)性研究
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《安徽醫(yī)科大學(xué)》 2013年
高加索人群銀屑病易感位點與中國漢族人尋常型銀屑病相關(guān)性研究
潘倩
【摘要】:研究背景銀屑。╬soriasis, OMIM#177900)是一種常見的慢性復(fù)發(fā)性炎癥性皮膚病,影響了全球1%~3%的人口,具有明顯的遺傳異質(zhì)性和種族差異性。在漢族人群中銀屑病的發(fā)病率約為0.123%,且以尋常型最多見(占患者總數(shù)的90%以上)。銀屑病的發(fā)病機制尚未完全明確,目前多認為該病由遺傳、環(huán)境及自身免疫性因素共同作用致病。近年來,隨著全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)的開展,人們對銀屑病易感基因的探索也不斷深入,發(fā)現(xiàn)了很多與銀屑病發(fā)病相關(guān)的易感位點,包括MHC區(qū)域, IL12B, IL23A, IL23R, TNFAIP3, IL-13/IL-4, TNIP1, LCE基因簇,TRAF3IP2, ERAP1, PTTG1, CSMD1, GJB2, SERP1NB8, ZNF816A, NOS2, FBXL19,NFKBIA, IL28RA, REL, IFIH1和TYK2等。最近歐洲人群的幾項GWAS研究發(fā)現(xiàn),STAT2, TYK2, YDJC, REL, ZMIZ1和PRDX5基因與銀屑病發(fā)病具有相關(guān)性,但其與漢族人群銀屑病的相關(guān)性研究目前國內(nèi)外尚未見報道。 目的1.通過對歐洲人群銀屑病易感基因在中國漢族人群中進行基因分型,探尋報道的歐洲人群6個銀屑病易感基因:REL, STAT2, TYK2, YTJC, ZMIZ1和PRDX5與中國漢族人群尋常型銀屑病易感性的關(guān)聯(lián)結(jié)果;2.依據(jù)獲得的基因分型數(shù)據(jù),運用基因型-表型分析法,尋找基因型與銀屑病臨床亞型之間的關(guān)聯(lián)性。 方法選擇2208例漢族人銀屑病病例和2208例種族、地域、性別、年齡等基本匹配的正常對照,應(yīng)用Sequenom MassArrayTM質(zhì)譜陣列技術(shù)對歐洲人群報道的銀屑病易感SNP進行基因分型,運用PLINK1.07統(tǒng)計軟件對每一個SNP在病例和對照中的等位基因及基因型的分型結(jié)果進行統(tǒng)計學(xué)分析,并針對漢族人銀屑病的臨床亞型(以發(fā)病年齡、有無家族史和是否伴發(fā)心血管疾病分類),對其易感的SNP關(guān)聯(lián)結(jié)果進行分層分析。 結(jié)果1.在選擇的6個SNP中,有兩個SNPs:rs1250544(ZMIZ1)和rs694739(PRDX5)未達到Hardy–Weinberg平衡(P值分別為,P-hwe=4.14×10-17和P-hwe=8.87×10-4)。 2.等位基因分析: ⑴病例組與對照組相比,SNP rs2066808(P等位基因=2.23×10-4)和SNP rs280519(P等位基因=0.017)等位基因分布頻率有統(tǒng)計學(xué)差異,而SNPs rs181359(P等位基因=0.075)和rs702873(P等位基因=0.633)等位基因頻率二組間差異無統(tǒng)計學(xué)意義。 ⑵以發(fā)病年齡分層:Ⅰ型銀屑病組和II型銀屑病組分別與對照組相比較,rs2066808等位基因分布頻率均顯示統(tǒng)計學(xué)差異(前者P等位基因=4.59×10-3,后者P等位基因=1.39×10-3);rs280519等位基因分布頻率僅在I型銀屑病組與對照組間存在統(tǒng)計學(xué)差異(P等位基因=6.05×10-3),而II型銀屑病組與對照組間無統(tǒng)計學(xué)差異(P等位基因=0.605)。 ⑶以家族史分層:無家族史患者組與對照組相比,rs2066808(P等位基因=5.36×10-4)和rs280519(P等位基因=0.021)等位基因分布頻率在兩組間均有統(tǒng)計學(xué)差異;而有家族史患者組與對照組比較,此二個SNP病例與對照組間均無統(tǒng)計學(xué)差異(前者P等位基因=0.06,后者P等位基因=0.26) ⑷以伴發(fā)疾病分層:無伴發(fā)疾病組與對照組相比,rs2066808(P等位基因=6.30×10-5)和rs280519(P等位基因=0.015)等位基因分布頻率在兩組間均有統(tǒng)計學(xué)差異;而伴發(fā)心血管疾病組與對照組相比,此二個SNP病例與對照組間均無統(tǒng)計學(xué)差異(前者P等位基因=0.728;后者P等位基因=0.636)。 3.基因型分析: ⑴SNP rs2066808(P3基因型=1.0×10-)和SNP rs280519(P基因型=0.012)基因型分布頻率在病例組與對照組之間均有統(tǒng)計學(xué)差異。 ⑵以發(fā)病年齡分層:rs2066808基因型分布頻率在Ⅰ型銀屑病組(P基因型=0.016)和II型銀屑病組(P基因型=6.0×10-3)與對照組之間均顯示統(tǒng)計學(xué)差異;rs280519基因型分布頻率僅在I型銀屑病組與對照組間存在統(tǒng)計學(xué)差異(P基因型=3.0×10-3),而II型銀屑病組與對照組間無統(tǒng)計學(xué)差異(P基因型=0.834)。 ⑶以家族史分層:無家族史患者組與對照組相比,rs2066808(P基因型=2.0×10-3)和rs280519(P基因型=0.032)基因型分布頻率在兩組間均有統(tǒng)計學(xué)差異;而有家族史患者組與對照組比較,結(jié)果無統(tǒng)計學(xué)差異(前者P基因型=0.213,后者P基因型=0.059)。 ⑷以伴發(fā)疾病分層:無伴發(fā)疾病組與對照組相比,,rs2066808和rs280519基因型分布頻率在兩組間均有統(tǒng)計學(xué)差異(前者P基因型=2.0×10-4;后者P基因型=0.023);而伴發(fā)心血管疾病組與對照組相比,此二個SNP病例與對照組間均無統(tǒng)計學(xué)差異(前者P基因型=1.00;后者P基因型=0.659)。 結(jié)論1. STAT2基因上的SNP rs2066808和TYK2基因上的SNP rs280519與漢族人尋常型銀屑病具有相關(guān)性,而REL基因上的SNP rs702873和YTJC基因上的SNPrs181359與漢族人尋常型銀屑病無顯著相關(guān)性。2. TYK2與I型銀屑病發(fā)病相關(guān)而與II型銀屑病發(fā)病無顯著相關(guān)性,并且STAT2和TYK2與有家族史和伴發(fā)心血管疾病患者均無顯著相關(guān)性。
【關(guān)鍵詞】:
【學(xué)位授予單位】:安徽醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2013
【分類號】:R758.63
【目錄】:
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【共引文獻】
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本文編號:162614
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