12ql3.2區(qū)域SNP rsl0876864與漢族人白癜風臨床表型相關性研究
發(fā)布時間:2017-10-12 20:13
本文關鍵詞:12ql3.2區(qū)域SNP rsl0876864與漢族人白癜風臨床表型相關性研究
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【摘要】:研究背景白癜風(OMIM,#193200)是一種普遍可見的后天色素脫失性皮膚黏膜性疾病,主要是由于表皮黑色素細胞的損失引起的,臨床上的皮損表現(xiàn)為一片或幾片色素減退斑表現(xiàn)為進展性、不完整、多病灶,后期由境界不清的色素減退斑,慢慢的擴大為境界清楚的色素減退斑,皮損顏色呈乳白色,皮損白斑中會出現(xiàn)一些散在的毛孔周圍島狀色素區(qū),白斑覆蓋頭發(fā)時的毛發(fā)可為正常黑色或白色,當皮損位于頭部的發(fā)病患者可見僅有白發(fā)但不伴發(fā)白斑。在世界范圍內(nèi)對于白癜風的病因和發(fā)病機制目前尚不完全清楚,有許多不同的病因?qū)W相關理論,如自身免疫疾病學說、黑素細胞自毀學說、神經(jīng)化學因子學說、遺傳學說等。在世界范圍內(nèi)的發(fā)病率為0.1%~0.2%左右。白癜風通常發(fā)病于兒童或成年早期,以青壯年多見,一般患者會在20歲之前獲得疾病,疾病的發(fā)病率會隨著年齡的增長而下降。有報道指出白癜風患者及其家屬患其它免疫性疾病的概率較高。部分患者有家族聚集現(xiàn)象,臨床流行病學研究調(diào)查表明白癜風可能屬于一種多基因疾病范疇,在遺傳和環(huán)境因素共同作用下發(fā)病。全基因組關聯(lián)性分析研究(Genome Wide Association Stud y,GWAS)是目前世界上尋找復雜性遺傳病的一個有效的研究方法,在對復雜性因素作用的皮膚疾病如銀屑病、白癜風、系統(tǒng)性紅斑狼瘡的研究已出現(xiàn)顯著的成果。本課題組通過漢族人白癜風全基因組關聯(lián)分析研究(GWAS)中發(fā)現(xiàn)位于12q13.2區(qū)域單核苷酸多態(tài)性(SNP)rs10876864位點(Pcombined=8.07×10-12,OR=1.18)與中國漢族人群白癜風有著高強度的相關性。本著對白癜風病因的更深入的研究,我們對該位點進行了基因型表型分析研究。研究目的本研究旨在通過對前期中國漢族人群白癜風GWAS實驗中的6,857病例和12,025對照的研究,從而來調(diào)查白癜風各類表型與單核苷酸多態(tài)性rs10876864位點基因型之間是否具有相關性。實驗材料與方法本研究共選取了之前白癜風GWAS數(shù)據(jù)中的6857例病例與12025對照。然后采用Illumina Human610芯片和5’核酸酶等位基因分型實驗(Taq-Man Assay)對rs10876864進行基因分型,在后期采用了卡方檢驗、logistic分析等分析方法和PLINK1.06、SPSS10.0軟件對rs10876864位點的與不同分型下的白癜風患者的表型進行了結(jié)果分析。結(jié)果通過實驗研究發(fā)現(xiàn)單核苷酸多態(tài)性rs10876864的基因型分布頻率在早發(fā)型(≤20)白癜風患者中明顯高于晚發(fā)型(≥20)白癜風患者(Pgenotype=5.10×10-5,Pcombi ned=5.00×10-3,OR=1.15,95%CI:1.04-1.27)兩者間具有明顯的統(tǒng)計學差異。r s10876864的基因型分布與不同亞型白癜風患者同樣具有明顯的相關性(Pgenotype=5.00×10-3,Pcombined=3.00×10-2).同時,在白癜風患者伴隨其他免疫性疾病與白癜風患者不伴發(fā)其他免疫性疾病的患者之間rs10876864也具有顯著的統(tǒng)計學差異性(Pgenotype=1.38×10-3,Pcombined=4.50×10-2,OR=1.23,95%CI:1.00-1.51).結(jié)論通過研究表明單核苷酸多態(tài)性rs10876864基因型與白癜風患者的發(fā)病年齡、不同臨床亞型和是否伴發(fā)免疫性疾病具有顯著的相關性。
【關鍵詞】:單核苷酸多態(tài)性 臨床表型 白癜風 中國漢族人群 全基因組關聯(lián)性分析研究
【學位授予單位】:安徽醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2016
【分類號】:R758.41
【目錄】:
- 英文縮略詞表6-7
- 中文摘要7-10
- Abstract10-13
- 1 引言13-16
- 2 材料與方法16-27
- 2.1 研究對象16-17
- 2.2 臨床資料收錄17-19
- 2.3 實驗試劑19-20
- 2.4 實驗儀器20-22
- 2.5 實驗方法及步驟22-26
- 2.6 統(tǒng)計學分析26-27
- 3 結(jié)果27-33
- 3.1 研究對象的特征27-28
- 3.2 病例和對照的rs10876864的基因型及遺傳模式分析28-29
- 3.3 亞分組中各基因型分布和GG+GA基因型的頻率與臨床表型之間的分層分析29-33
- 4 討論33-36
- 5 結(jié)論36
- 6 參考文獻36-42
- 附錄42-44
- 致謝44-45
- 課題綜述45-56
- 參考文獻51-56
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1 陳夢云;12ql3.2區(qū)域SNP rsl0876864與漢族人白癜風臨床表型相關性研究[D];安徽醫(yī)科大學;2016年
,本文編號:1020679
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