上海市男男性行為者中感染HIV-1的CRF01_AE毒株傳播簇分析
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【摘要】:目的了解上海地區(qū)男男性行為者(MSM)中,感染艾滋病病毒1型(HIV-1)的CRF01_AE重組型的流行情況、成簇特性,為HIV防控工作提供科學(xué)數(shù)據(jù)。方法從2009-2013年每年新診斷的MSM HIV-1感染者血漿樣本中提取RNA,并對(duì)HIV-1 pol基因片段進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄和巢式PCR擴(kuò)增、DNA測(cè)序和亞型分析。對(duì)CRF01_AE重組型序列進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化學(xué)和社會(huì)人口學(xué)信息分析。結(jié)果 1262名MSM感染者中,CRF01_AE重組型感染782人(62.0%),其序列在系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)上形成6個(gè)流行簇。使用不同參數(shù)界定傳播簇并進(jìn)行比較,選擇以Bootstrap≥90%及基因距離≤0.03作為傳播簇的界定標(biāo)準(zhǔn),形成112個(gè)傳播簇,其中由10條及以上序列形成的傳播簇有5個(gè);年齡、文化程度、婚姻狀況、性病史和CD4+T淋巴細(xì)胞計(jì)數(shù)與樣本的成簇性有統(tǒng)計(jì)學(xué)關(guān)聯(lián)。結(jié)論 CRF01_AE重組型毒株是上海市MSM HIV-1感染者中的優(yōu)勢(shì)傳播株,具有較強(qiáng)的成簇性,并且與相關(guān)的社會(huì)人口學(xué)和流行病學(xué)背景相關(guān)。
【作者單位】: 上海市疾病預(yù)防控制中心;
【關(guān)鍵詞】: 艾滋病病毒型 男男性行為者 CRF_AE 傳播簇
【基金】:國(guó)家“十二五”傳染病科技重大專(zhuān)項(xiàng)(2012ZX10001-002) 病毒學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室開(kāi)放研究基金項(xiàng)目(2015IOV004)~~
【分類(lèi)號(hào)】:R512.91
【正文快照】: 男男性行為者(Men who have sex with men,MSM)是上海市艾滋病病毒(Human immune defi-ciency virus,HIV)感染者中比例最高的人群,且感染率持續(xù)緩慢上升[1],在上海市HIV傳播網(wǎng)絡(luò)的發(fā)展和擴(kuò)大中起重要作用。HIV-1CRF01_AE是上海市優(yōu)勢(shì)毒株,在MSM感染者中感染率最高[2]。為了解
【相似文獻(xiàn)】
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,本文編號(hào):679785
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