基于相對和絕對定量同位素標(biāo)記技術(shù)對肥胖大鼠海馬區(qū)差異蛋白組學(xué)的研究
發(fā)布時間:2023-11-02 18:00
目的篩選及鑒定肥胖大鼠海馬區(qū)的差異蛋白表達。方法將24只SD大鼠隨機分為單純肥胖組(Ob,n=14)及正常對照組(NC,n=10)。予高脂高糖飲食制備單純肥胖大鼠模型,采用相對和絕對定量同位素標(biāo)記技術(shù)(iTRAQ)聯(lián)合二維液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜(2D-LC-MS/MS)法鑒定肥胖大鼠海馬區(qū)差異蛋白表達,對所獲蛋白行生物信息學(xué)分析,Western blot法對篩選的部分差異蛋白進行驗證。結(jié)果成功建立單純肥胖大鼠模型,共鑒定出310種差異蛋白表達。于KEGG數(shù)據(jù)庫檢索篩選出26個差異蛋白顯著富集的代謝通路。選取位于蛋白功能相互作用網(wǎng)絡(luò)交叉點的4種差異蛋白行Western blot驗證,發(fā)現(xiàn)蛋白表達水平與質(zhì)譜結(jié)果一致。結(jié)論采用iTRAQ結(jié)合2D-LC-MS/MS技術(shù),能有效篩選肥胖大鼠海馬區(qū)差異蛋白表達,為研究肥胖對中樞神經(jīng)系統(tǒng)損傷機制提供依據(jù)。
【文章頁數(shù)】:7 頁
【文章目錄】:
材料與方法
一、實驗材料
二、實驗方法
1. 分組及模型建立:
2. 樣品制備:
3. 蛋白提取及定量:
4. iTRAQ試劑標(biāo)記及檢測:
5. SCX分離:
6. 基于Triple TOF 5600的LC-MS/MS分析:
7. 生物信息學(xué)分析:
8. Western blot驗證篩選的蛋白表達水平:
三、統(tǒng)計學(xué)處理
結(jié)果
一、蛋白鑒定及篩選的差異蛋白
二、pathway代謝通路注釋
三、蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)分析
四、各組差異蛋白的Western blot驗證
討論
本文編號:3859482
【文章頁數(shù)】:7 頁
【文章目錄】:
材料與方法
一、實驗材料
二、實驗方法
1. 分組及模型建立:
2. 樣品制備:
3. 蛋白提取及定量:
4. iTRAQ試劑標(biāo)記及檢測:
5. SCX分離:
6. 基于Triple TOF 5600的LC-MS/MS分析:
7. 生物信息學(xué)分析:
8. Western blot驗證篩選的蛋白表達水平:
三、統(tǒng)計學(xué)處理
結(jié)果
一、蛋白鑒定及篩選的差異蛋白
二、pathway代謝通路注釋
三、蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)分析
四、各組差異蛋白的Western blot驗證
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本文編號:3859482
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