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運用高通量RNA測序探討陽離子多肽對氣道上皮細胞的影響

發(fā)布時間:2023-04-16 22:27
  研究背景及目的:主要堿性蛋白(MBP)是哮喘過程中嗜酸性粒細胞釋放的主要毒性蛋白,對氣道上皮細胞產(chǎn)生一定的損傷,從而加重哮喘。但MBP對氣道上皮細胞損傷的具體分子機制仍然不是很清楚。MBP體外模擬劑陽離子多肽多聚左旋精氨酸(PLA)被廣泛用來研究其對氣道上皮細胞的生物學(xué)效應(yīng)。本實驗基于對PLA處理的氣道上皮細胞NCI-H292的全轉(zhuǎn)錄組測序分析,探究陽離子多肽對氣道上皮細胞基因表達的影響,通過分析差異基因表達,初步探究陽離子多肽對氣道上皮細胞的損傷機制。材料與方法:NCI-H292細胞分為對照組(C)和PLA(P)組,每組三個重復(fù)。應(yīng)用Illumina Hiseq 4000對樣品進行測序,通過差異分析軟件,選取倍數(shù)改變(29)1.5,P?0.05的基因作為差異表達基因(DEGs)。對DEGs進行基因體富集分析(gene ontology,GO)以及京都基因與基因組百科全書(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路數(shù)據(jù)庫分析以了解DEGs參與的相關(guān)功能和信號途徑;挑選差異表達基因,運用qRT-PCR和Western Blot驗證測序結(jié)...

【文章頁數(shù)】:57 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【文章目錄】:
中英文縮略詞表
中文摘要
英文摘要
1.前言
2.實驗材料
3.實驗方法
4.統(tǒng)計學(xué)處理
5.結(jié)果
6.討論
7.結(jié)論
8.參考文獻
附錄
致謝
綜述
    參考文獻



本文編號:3792004

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