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運(yùn)用高通量RNA測(cè)序探討陽(yáng)離子多肽對(duì)氣道上皮細(xì)胞的影響

發(fā)布時(shí)間:2023-04-16 22:27
  研究背景及目的:主要堿性蛋白(MBP)是哮喘過(guò)程中嗜酸性粒細(xì)胞釋放的主要毒性蛋白,對(duì)氣道上皮細(xì)胞產(chǎn)生一定的損傷,從而加重哮喘。但MBP對(duì)氣道上皮細(xì)胞損傷的具體分子機(jī)制仍然不是很清楚。MBP體外模擬劑陽(yáng)離子多肽多聚左旋精氨酸(PLA)被廣泛用來(lái)研究其對(duì)氣道上皮細(xì)胞的生物學(xué)效應(yīng)。本實(shí)驗(yàn)基于對(duì)PLA處理的氣道上皮細(xì)胞NCI-H292的全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析,探究陽(yáng)離子多肽對(duì)氣道上皮細(xì)胞基因表達(dá)的影響,通過(guò)分析差異基因表達(dá),初步探究陽(yáng)離子多肽對(duì)氣道上皮細(xì)胞的損傷機(jī)制。材料與方法:NCI-H292細(xì)胞分為對(duì)照組(C)和PLA(P)組,每組三個(gè)重復(fù)。應(yīng)用Illumina Hiseq 4000對(duì)樣品進(jìn)行測(cè)序,通過(guò)差異分析軟件,選取倍數(shù)改變(29)1.5,P?0.05的基因作為差異表達(dá)基因(DEGs)。對(duì)DEGs進(jìn)行基因體富集分析(gene ontology,GO)以及京都基因與基因組百科全書(shū)(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路數(shù)據(jù)庫(kù)分析以了解DEGs參與的相關(guān)功能和信號(hào)途徑;挑選差異表達(dá)基因,運(yùn)用qRT-PCR和Western Blot驗(yàn)證測(cè)序結(jié)...

【文章頁(yè)數(shù)】:57 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【文章目錄】:
中英文縮略詞表
中文摘要
英文摘要
1.前言
2.實(shí)驗(yàn)材料
3.實(shí)驗(yàn)方法
4.統(tǒng)計(jì)學(xué)處理
5.結(jié)果
6.討論
7.結(jié)論
8.參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
綜述
    參考文獻(xiàn)



本文編號(hào):3792004

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