LC-MALD1-TOF/TOF MS方法鑒定分析類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎患者滑膜液瓜氨酸化蛋白研究
發(fā)布時間:2021-09-30 00:03
背景類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎(rheumatoid arthritis, RA)是一種常見的、以關(guān)節(jié)組織炎癥、損傷以及滑膜血管翳形成為特征的自身免疫性疾病,最終可導(dǎo)致關(guān)節(jié)畸形和機(jī)體各系統(tǒng)并發(fā)癥。盡管RA的發(fā)病機(jī)制尚不完全清楚,但研究證明某些主要組織相容性復(fù)合體(MHC)亞型以及抗瓜氨酸化蛋白抗體(anti-citrullinated protein antibodies, ACPAs)與RA自身免疫性病理損傷的發(fā)生發(fā)展相關(guān)。ACPAs在RA患者血清中具有相對特異性,甚至在RA的臨床前期也可以被檢測到。另外,ACPAs在炎性滑膜中和瓜氨酸化的自身抗原相結(jié)合形成免疫復(fù)合物(immune complexes, ICs),促進(jìn)炎癥的發(fā)生與發(fā)展。因此,準(zhǔn)確鑒定分析RA患者滑膜液中的瓜氨酸化抗原并探討其致病作用將對深入研究RA的發(fā)病機(jī)制具有重要意義。蛋白質(zhì)瓜氨酸化是一種由肽酰基精氨酸脫亞胺酶(peptidylarginine deiminases, PADIs)催化的精氨酸殘基向非編碼瓜氨酸殘基轉(zhuǎn)變的翻譯后修飾(post-translational modification, PTM)過程,該過程導(dǎo)致了一個正...
【文章來源】:南京大學(xué)江蘇省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:71 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
前言
參考文獻(xiàn)
第一部分 液相色譜聯(lián)合基質(zhì)輔助激光解吸/電離串聯(lián)飛行時間質(zhì)譜對RA患者滑膜液瓜氨酸化肽的鑒定分析
1. 實(shí)驗(yàn)材料
1.1 標(biāo)本來源
1.2 排除標(biāo)準(zhǔn)
1.3 實(shí)驗(yàn)試劑
1.4 實(shí)驗(yàn)儀器
2. 實(shí)驗(yàn)方法
2.1 滑膜液白蛋白和IgG去除
2.2 免疫沉淀
2.3 BCA蛋白定量
2.4 Western blotting
2.5 瓜氨酸化蛋白的降解、烷化及酶解
2.6 nano2D-HPLC
2.7 MALDI-TOF/TOF MS分析
2.8 生物信息學(xué)分析
3. 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.1 免疫沉淀結(jié)果
3.2 質(zhì)譜鑒定結(jié)果
3.4 生物信息學(xué)分析
4. 討論
5. 小結(jié)
參考文獻(xiàn)
第二部分 瓜氨酸化抗原的驗(yàn)證
1. 實(shí)驗(yàn)材料
1.1 標(biāo)本來源
1.2 排除標(biāo)準(zhǔn)
1.3 實(shí)驗(yàn)試劑
1.4 實(shí)驗(yàn)儀器
2. 實(shí)驗(yàn)方法
2.1 SFs白蛋白和IgG去除
2.2 BCA蛋白定量
2.3 十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)
2.4 考馬斯亮藍(lán)染色
2.5 MALDI-TOF/TOF MS分析
2.6 Western blotting
3. 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.1 考馬斯亮藍(lán)染色結(jié)果
3.2 Western blotting結(jié)果(一抗為兔抗人瓜氨酸化蛋白抗體)
3.3 質(zhì)譜分析結(jié)果
3.4 Western blotting結(jié)果(一抗為兔抗LRG1抗體、兔抗macroH2A.1抗體、兔抗KNG抗體)
4. 討論
5. 小結(jié)
參考文獻(xiàn)
全文總結(jié)
綜述
參考文獻(xiàn)
附錄A 縮略詞表
附錄B 攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表論文
致謝
本文編號:3414715
【文章來源】:南京大學(xué)江蘇省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:71 頁
【學(xué)位級別】:碩士
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摘要
Abstract
前言
參考文獻(xiàn)
第一部分 液相色譜聯(lián)合基質(zhì)輔助激光解吸/電離串聯(lián)飛行時間質(zhì)譜對RA患者滑膜液瓜氨酸化肽的鑒定分析
1. 實(shí)驗(yàn)材料
1.1 標(biāo)本來源
1.2 排除標(biāo)準(zhǔn)
1.3 實(shí)驗(yàn)試劑
1.4 實(shí)驗(yàn)儀器
2. 實(shí)驗(yàn)方法
2.1 滑膜液白蛋白和IgG去除
2.2 免疫沉淀
2.3 BCA蛋白定量
2.4 Western blotting
2.5 瓜氨酸化蛋白的降解、烷化及酶解
2.6 nano2D-HPLC
2.7 MALDI-TOF/TOF MS分析
2.8 生物信息學(xué)分析
3. 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.1 免疫沉淀結(jié)果
3.2 質(zhì)譜鑒定結(jié)果
3.4 生物信息學(xué)分析
4. 討論
5. 小結(jié)
參考文獻(xiàn)
第二部分 瓜氨酸化抗原的驗(yàn)證
1. 實(shí)驗(yàn)材料
1.1 標(biāo)本來源
1.2 排除標(biāo)準(zhǔn)
1.3 實(shí)驗(yàn)試劑
1.4 實(shí)驗(yàn)儀器
2. 實(shí)驗(yàn)方法
2.1 SFs白蛋白和IgG去除
2.2 BCA蛋白定量
2.3 十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)
2.4 考馬斯亮藍(lán)染色
2.5 MALDI-TOF/TOF MS分析
2.6 Western blotting
3. 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.1 考馬斯亮藍(lán)染色結(jié)果
3.2 Western blotting結(jié)果(一抗為兔抗人瓜氨酸化蛋白抗體)
3.3 質(zhì)譜分析結(jié)果
3.4 Western blotting結(jié)果(一抗為兔抗LRG1抗體、兔抗macroH2A.1抗體、兔抗KNG抗體)
4. 討論
5. 小結(jié)
參考文獻(xiàn)
全文總結(jié)
綜述
參考文獻(xiàn)
附錄A 縮略詞表
附錄B 攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表論文
致謝
本文編號:3414715
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