橋本甲狀腺炎患者的組蛋白甲基化及與碘的機(jī)制研究
發(fā)布時(shí)間:2021-02-15 21:36
背景:橋本甲狀腺炎(Hashimoto thyroiditis,HT),也被稱為自身免疫性甲狀腺炎(Autoimmune thyroiditis,AIT),是臨床常見(jiàn)的內(nèi)分泌系統(tǒng)疾病,其確切發(fā)病機(jī)制尚未完全明確,目前認(rèn)為遺傳背景和環(huán)境因素的交互作用共同導(dǎo)致了疾病的發(fā)生發(fā)展,而碘是其中最重要的環(huán)境因素之一。表觀遺傳修飾可以通過(guò)改變?nèi)旧|(zhì)結(jié)構(gòu)、募集轉(zhuǎn)錄因子以及調(diào)控多種酶等來(lái)調(diào)節(jié)基因轉(zhuǎn)錄而不影響DNA堿基序列,是連接環(huán)境因素和遺傳背景的橋梁。組蛋白甲基化及其相關(guān)修飾酶作為表觀遺傳修飾的重要調(diào)節(jié)機(jī)制與很多自身免疫疾病相關(guān)。然而目前尚沒(méi)有探討組蛋白甲基化與HT的系統(tǒng)研究。本研究主要從全基因組和整體蛋白水平探討HT患者甲狀腺細(xì)胞以及甲狀腺組織組蛋白H3賴氨酸4三甲基化(H3K4me3)的變化,同時(shí)分析了高碘對(duì)甲狀腺細(xì)胞H3K4me3和組蛋白H3賴氨酸27三甲基化(H3K27me3)的影響及在HT中的可能機(jī)制探討。方法:1)HT患者甲狀腺細(xì)胞和組織H3K4me3變化:利用免疫共沉淀測(cè)序(Chromatin Immunoprecipitation and Deep Sequencing,chip-se...
【文章來(lái)源】:中國(guó)醫(yī)科大學(xué)遼寧省
【文章頁(yè)數(shù)】:121 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【圖文】:
甲狀腺細(xì)胞H3K4me3全基因組分布和差異位點(diǎn)富集分布
3.2 HT 相關(guān)分子轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn) H3K4me3 富集情況和轉(zhuǎn)錄表達(dá)轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn) H3K4me3 富集增加與基因轉(zhuǎn)錄活化相關(guān),為了探究與 HT 可能相關(guān)的基因轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn) H3K4me3 的富集情況,基于 Mnorm 分析辦法,在已經(jīng)分析出的差異位點(diǎn)和相關(guān)基因中進(jìn)行篩選,并將 track 導(dǎo)入基因可視化軟件 IGV 進(jìn)一步分析,發(fā)現(xiàn) HT 患者甲狀腺細(xì)胞基因趨化因子 CXCL8, CCL2, CXCL10, IL18 黏附分子ICAM1, ITGA4,凋亡相關(guān)分子 FASLG和TRAIL 的啟動(dòng)子區(qū)域H3K4me3顯著增加,如圖 3.21。另外 HT 患者甲狀腺細(xì)胞 TG 基因轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn) H3K4me3 富集增加,平均約為對(duì)照組的 2.45 倍,如圖 3.22。為了探討轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn) H3K4me3 的富集情況是否與轉(zhuǎn)錄調(diào)控相關(guān),進(jìn)一步納入 8 個(gè) HT 患者和 8 個(gè)年齡匹配的對(duì)照人群進(jìn)行甲狀腺細(xì)胞原代培養(yǎng)并檢測(cè) mRNA 水平。發(fā)現(xiàn) CCL2,CXCL8,ICAM1 在 HT患者原代培養(yǎng)細(xì)胞中轉(zhuǎn)錄表達(dá)增加,如圖 3.23。
圖 3.22 TG 啟動(dòng)子區(qū) H3K4me3 富集情況(IGV 可視化瀏覽)圖3.23 啟動(dòng)子區(qū)H3K4me3富集增加的8個(gè)基因在HT患者甲狀腺細(xì)胞中的mRNA水平(n=16)。CCL2,CXCL8,ICAM1 在 HT 患者原代培養(yǎng)細(xì)胞中 mRNA 表達(dá)增加。HT:橋本甲狀腺炎患者;CON:對(duì)照人群。(* P<0.05,** P<0.01)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]啟動(dòng)子區(qū)H3K27me3修飾異常促使系統(tǒng)性紅斑狼瘡患者CD4+T細(xì)胞CREMα過(guò)表達(dá)[J]. 張慶,丁澍,張慧琳. 南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2017(12)
本文編號(hào):3035577
【文章來(lái)源】:中國(guó)醫(yī)科大學(xué)遼寧省
【文章頁(yè)數(shù)】:121 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【圖文】:
甲狀腺細(xì)胞H3K4me3全基因組分布和差異位點(diǎn)富集分布
3.2 HT 相關(guān)分子轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn) H3K4me3 富集情況和轉(zhuǎn)錄表達(dá)轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn) H3K4me3 富集增加與基因轉(zhuǎn)錄活化相關(guān),為了探究與 HT 可能相關(guān)的基因轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn) H3K4me3 的富集情況,基于 Mnorm 分析辦法,在已經(jīng)分析出的差異位點(diǎn)和相關(guān)基因中進(jìn)行篩選,并將 track 導(dǎo)入基因可視化軟件 IGV 進(jìn)一步分析,發(fā)現(xiàn) HT 患者甲狀腺細(xì)胞基因趨化因子 CXCL8, CCL2, CXCL10, IL18 黏附分子ICAM1, ITGA4,凋亡相關(guān)分子 FASLG和TRAIL 的啟動(dòng)子區(qū)域H3K4me3顯著增加,如圖 3.21。另外 HT 患者甲狀腺細(xì)胞 TG 基因轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn) H3K4me3 富集增加,平均約為對(duì)照組的 2.45 倍,如圖 3.22。為了探討轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn) H3K4me3 的富集情況是否與轉(zhuǎn)錄調(diào)控相關(guān),進(jìn)一步納入 8 個(gè) HT 患者和 8 個(gè)年齡匹配的對(duì)照人群進(jìn)行甲狀腺細(xì)胞原代培養(yǎng)并檢測(cè) mRNA 水平。發(fā)現(xiàn) CCL2,CXCL8,ICAM1 在 HT患者原代培養(yǎng)細(xì)胞中轉(zhuǎn)錄表達(dá)增加,如圖 3.23。
圖 3.22 TG 啟動(dòng)子區(qū) H3K4me3 富集情況(IGV 可視化瀏覽)圖3.23 啟動(dòng)子區(qū)H3K4me3富集增加的8個(gè)基因在HT患者甲狀腺細(xì)胞中的mRNA水平(n=16)。CCL2,CXCL8,ICAM1 在 HT 患者原代培養(yǎng)細(xì)胞中 mRNA 表達(dá)增加。HT:橋本甲狀腺炎患者;CON:對(duì)照人群。(* P<0.05,** P<0.01)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]啟動(dòng)子區(qū)H3K27me3修飾異常促使系統(tǒng)性紅斑狼瘡患者CD4+T細(xì)胞CREMα過(guò)表達(dá)[J]. 張慶,丁澍,張慧琳. 南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2017(12)
本文編號(hào):3035577
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