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橋本甲狀腺炎患者的組蛋白甲基化及與碘的機制研究

發(fā)布時間:2021-02-15 21:36
  背景:橋本甲狀腺炎(Hashimoto thyroiditis,HT),也被稱為自身免疫性甲狀腺炎(Autoimmune thyroiditis,AIT),是臨床常見的內(nèi)分泌系統(tǒng)疾病,其確切發(fā)病機制尚未完全明確,目前認為遺傳背景和環(huán)境因素的交互作用共同導(dǎo)致了疾病的發(fā)生發(fā)展,而碘是其中最重要的環(huán)境因素之一。表觀遺傳修飾可以通過改變?nèi)旧|(zhì)結(jié)構(gòu)、募集轉(zhuǎn)錄因子以及調(diào)控多種酶等來調(diào)節(jié)基因轉(zhuǎn)錄而不影響DNA堿基序列,是連接環(huán)境因素和遺傳背景的橋梁。組蛋白甲基化及其相關(guān)修飾酶作為表觀遺傳修飾的重要調(diào)節(jié)機制與很多自身免疫疾病相關(guān)。然而目前尚沒有探討組蛋白甲基化與HT的系統(tǒng)研究。本研究主要從全基因組和整體蛋白水平探討HT患者甲狀腺細胞以及甲狀腺組織組蛋白H3賴氨酸4三甲基化(H3K4me3)的變化,同時分析了高碘對甲狀腺細胞H3K4me3和組蛋白H3賴氨酸27三甲基化(H3K27me3)的影響及在HT中的可能機制探討。方法:1)HT患者甲狀腺細胞和組織H3K4me3變化:利用免疫共沉淀測序(Chromatin Immunoprecipitation and Deep Sequencing,chip-se... 

【文章來源】:中國醫(yī)科大學(xué)遼寧省

【文章頁數(shù)】:121 頁

【學(xué)位級別】:博士

【圖文】:

橋本甲狀腺炎患者的組蛋白甲基化及與碘的機制研究


甲狀腺細胞H3K4me3全基因組分布和差異位點富集分布

富集,啟動子區(qū),位點,轉(zhuǎn)錄起始位點


3.2 HT 相關(guān)分子轉(zhuǎn)錄起始位點 H3K4me3 富集情況和轉(zhuǎn)錄表達轉(zhuǎn)錄起始位點 H3K4me3 富集增加與基因轉(zhuǎn)錄活化相關(guān),為了探究與 HT 可能相關(guān)的基因轉(zhuǎn)錄起始位點 H3K4me3 的富集情況,基于 Mnorm 分析辦法,在已經(jīng)分析出的差異位點和相關(guān)基因中進行篩選,并將 track 導(dǎo)入基因可視化軟件 IGV 進一步分析,發(fā)現(xiàn) HT 患者甲狀腺細胞基因趨化因子 CXCL8, CCL2, CXCL10, IL18 黏附分子ICAM1, ITGA4,凋亡相關(guān)分子 FASLG和TRAIL 的啟動子區(qū)域H3K4me3顯著增加,如圖 3.21。另外 HT 患者甲狀腺細胞 TG 基因轉(zhuǎn)錄起始位點 H3K4me3 富集增加,平均約為對照組的 2.45 倍,如圖 3.22。為了探討轉(zhuǎn)錄起始位點 H3K4me3 的富集情況是否與轉(zhuǎn)錄調(diào)控相關(guān),進一步納入 8 個 HT 患者和 8 個年齡匹配的對照人群進行甲狀腺細胞原代培養(yǎng)并檢測 mRNA 水平。發(fā)現(xiàn) CCL2,CXCL8,ICAM1 在 HT患者原代培養(yǎng)細胞中轉(zhuǎn)錄表達增加,如圖 3.23。

啟動子區(qū),富集,可視化,情況


圖 3.22 TG 啟動子區(qū) H3K4me3 富集情況(IGV 可視化瀏覽)圖3.23 啟動子區(qū)H3K4me3富集增加的8個基因在HT患者甲狀腺細胞中的mRNA水平(n=16)。CCL2,CXCL8,ICAM1 在 HT 患者原代培養(yǎng)細胞中 mRNA 表達增加。HT:橋本甲狀腺炎患者;CON:對照人群。(* P<0.05,** P<0.01)

【參考文獻】:
期刊論文
[1]啟動子區(qū)H3K27me3修飾異常促使系統(tǒng)性紅斑狼瘡患者CD4+T細胞CREMα過表達[J]. 張慶,丁澍,張慧琳.  南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報. 2017(12)



本文編號:3035577

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