發(fā)布時間：2020-11-10 22:56

　　 目的:本研究主要是探討維生素D受體(Vitamin D Receptor,VDR)基因單核苷酸多態(tài)性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)與中國漢族人群系統(tǒng)性硬皮病(Systemic Sclerosis,SSc)發(fā)病和臨床癥狀之間的關(guān)聯(lián)。方法:采用病例對照研究方法,收集2013年10月至2018年10月期間來自于安徽醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院和中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)第一附屬醫(yī)院(安徽省立醫(yī)院)風濕免疫科的門診和住院部新診斷的符合1980年美國風濕病學(xué)會SSc診斷標準的SSc患者。同時按照頻數(shù)匹配的原則,收集來自于安徽醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院健康體檢中心的100名無關(guān)聯(lián)的健康志愿者作為對照組;根據(jù)HapMap數(shù)據(jù)庫和NCBI基因數(shù)據(jù)庫選取了VDR基因的8個SNP位點rs731236[TaqI]、rs2228570[FokI]、rs7975232[ApaI]、rs1544410[BsmI]和rs11574010[Cdx2]、rs739837[BglI]、rs757343[Tru 9I]以及rs11168267,采用經(jīng)過改進的多重連接酶檢測技術(shù)(iMLDR)對這些位點進行基因分型;并分析各位點的基因型和等位基因頻率在病例組和對照組中的分布是否存在差異,同時構(gòu)建4種(包括顯性、隱性、超顯性和純合子模型)遺傳模型來對以上的SNP位點在病例與對照組之間的分布情況進行比較;另外,對這些位點也進行了連鎖不平衡(LD)檢測和單倍型分析;最后,分析它們與SSc患者臨床特征和實驗室指標之間的關(guān)系。結(jié)果:SSc患者的平均年齡48.63±12.55歲,病程為0.5~10年。其中男性12例,占12.0%,女性88例,占88.0%;納入100例健康對照者,平均年齡為47.47±10.41歲,其中男性19例,占91.0%,女性81例,占81.0%。兩組人群的年齡和性別之間差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(P均大于0.05)。在對照組中進行的HWE遺傳平衡檢驗結(jié)果顯示在以上8個位點中均符合遺傳平衡定律(P0.05)。對VDR基因進行的基因型分析結(jié)果顯示,ApaI(rs7975232)位點的CA基因型頻率和BglI(rs739837)位點的GT基因型頻率在實驗組和對照組中的分布均存在著統(tǒng)計學(xué)差異(前者為χ~2=6.624,P=0.010;后者為χ~2=5.132,P=0.023),但是經(jīng)Bonferroni法校正后兩者均不具有統(tǒng)計學(xué)意義(P0.00625)。但在其他位點上,卻未發(fā)現(xiàn)它們的基因型分布在病例組和對照組中存在差異(P均大于0.05)。遺傳模型分析結(jié)果顯示ApaI的顯性模型(χ2=4.191,P=0.041,OR[95%CI]=1.799[1.025,3.156])和超顯性模型(χ2=8.414,P=0.004,OR[95%CI]=2.339[1.317,4.154])以及BglI(rs739837)的顯性模型(χ~2=4.191,P=0.041,OR[95%CI]=0.556[0.317,0.975])在病例組與對照組之間均存在統(tǒng)計學(xué)差異,然而經(jīng)過Bonferroni法校正后,差異不再具有統(tǒng)計學(xué)意義(P均大于0.00625)。同樣,Tru9I的超顯性模型(χ~2=4.543,P=0.033,OR[95%CI]=0.523(0.288,0.949))在兩組人群中也存在著差異,但是經(jīng)過Bonferroni法校正后,差異也不再具有統(tǒng)計學(xué)意義(P大于0.00625)。而BglI的超顯性模型(χ~2=8.414,P=0.004,OR[95%CI]=0.427[0.241,0.759])在這兩組人群中卻存在著差異,并且經(jīng)過Bonferroni法校正后,兩者之間的差異仍然存在(P=0.0040.00625)。連鎖不平衡分析顯示rs739837和rs7975232(r~2=1.0,D'=1.0),rs757343和rs11168267(r~2=0.926,D'=0.969)之間存在高度LD,但是對它們構(gòu)建的幾種單倍型分析卻未發(fā)現(xiàn)存在統(tǒng)計學(xué)差異(P0.05)。臨床特征關(guān)聯(lián)分析顯示這8個位點的基因型頻率及等位基因頻率在SSc患者合并臨床特征組和SSc未合并臨床特征組間的分布均不存在統(tǒng)計學(xué)意義(P值均大于0.05)。結(jié)論:1、VDR基因的ApaI(rs7975232)和BglI(rs739837)位點的超顯性模型可能與SSc的易感性存在關(guān)聯(lián),而另外6個位點的基因多態(tài)性可能與中國漢族SSc的發(fā)病之間不存在統(tǒng)計學(xué)關(guān)聯(lián)。2、VDR基因的這8個位點多態(tài)性與SSc患者臨床表現(xiàn)之間可能并不存在關(guān)聯(lián)。
【學(xué)位單位】：安徽醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位年份】：2019
【中圖分類】：R593.25
【部分圖文】：

安徽醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文 基因分型.1實驗原理imLDR 技術(shù)是一種經(jīng)過改進的新型多重 SNP 分型技術(shù)，它是上海天昊生物在基于傳統(tǒng)的連接酶反應(yīng)基礎(chǔ)上，經(jīng)過完善和修飾后產(chǎn)生的一種具有較高準和分型率的一種實驗技術(shù)，目前已被廣泛應(yīng)用到很多種基因的分型中。如圖示。與傳統(tǒng)的 PCR 分型技術(shù)相比，該分型技術(shù)大大提高了基因分型的準確性型率，準確性已經(jīng)超過 98%，明顯提高了實驗的成功率。

HapMap 數(shù)據(jù)庫中的中國漢族北京人群的結(jié)果基本類似（如圖 2）；而且我們又隨機從病例組和對照組中各隨機抽取了一例標本進行了電泳，結(jié)果也顯示本次實驗的分型結(jié)果較可靠（如圖 3 和圖 4）。在對照組中進行的 HWE 遺傳平衡檢驗結(jié)果顯示在以上 8個位點中均符合遺傳平衡定律（P > 0.05）。

圖 3 病例 T14 電泳峰型圖Figure 3 The electrophoresis peak pattern of number T14 case圖 4 對照 C65 電泳峰型圖Figure 4 The electrophoresis peak pattern of number C65 conrol3.3 VDR 基因各位點多態(tài)性與 SSc 患者遺傳易感性分析
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