背景:自身免疫性疾病是臨床實(shí)踐中的嚴(yán)重挑戰(zhàn)之一。而這類人群較健康人群更易感染,但自身免疫浸潤導(dǎo)致的間質(zhì)性肺炎有時很難與自身免疫疾病合并重癥肺炎區(qū)分開來,并且在這類人群中,抗生素的使用相對較強(qiáng),可能導(dǎo)致病原菌的檢出率較低,這項(xiàng)回顧性研究旨在研究與傳統(tǒng)檢測方法相比,支氣管肺泡灌洗液(BALF)的宏基因組二代測序技術(shù)(mNGS)是否可用于鑒定自身免疫疾病合并重癥肺炎患者中的致病病原體。方法:本研究為單中心回顧性研究,納入對象為2017年4月至2019年2月浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第二醫(yī)院濱江院區(qū)綜合重癥監(jiān)護(hù)室住院的自身免疫病合并重癥肺炎的成人患者。并接受纖維支氣管鏡檢查獲得BALF樣本以幫助發(fā)現(xiàn)致病病原體。將BALF標(biāo)本分成兩個相等的部分,一份用于傳統(tǒng)檢測方法。另一份外送測序公司行mNGS測序。結(jié)果:共納入17名患者(7名男性;平均年齡55歲)的18份肺泡灌洗液樣本,共15份標(biāo)本(83.3%)為mNGS陽性。6個標(biāo)本(33.3%)是傳統(tǒng)檢測方法陽性。6個傳統(tǒng)檢測方法陽性樣本也是mNGS陽性,其中5個一致被mNGS鑒定為異常值,只有1例標(biāo)本的mNGS和傳統(tǒng)檢測方法結(jié)果矛盾。幾乎所有的病毒和肺孢子蟲都只在mNGS中獲得。使用傳統(tǒng)檢測方法中檢測到6種細(xì)菌,1種病毒和1種真菌,mNGS檢測到11種細(xì)菌,1種衣原體,4種真菌和6種病毒。與傳統(tǒng)檢測方法相比,mNGS在檢測病原體方面顯示出顯著更高的陽性率(33.3%對83.3%,p=0.006),其中mNGS在病毒和真菌的檢出方面陽性率顯著升高,病毒(5.6%vs 38.9%,p=0.041),真菌(11.1%vs 50.0%,p=0.027)。但在細(xì)菌的檢出方面則無顯著差異(27.8%vs50.0%,p=0.305)。結(jié)論:對于自身免疫性疾病合并重癥肺炎的患者來說,mNGS鑒定肺泡灌洗液中特殊病原體如衣原體以及真菌和病毒方面具有獨(dú)特的優(yōu)勢。
【學(xué)位單位】：浙江大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位年份】：2019
【中圖分類】：R593.2;R563.1
【部分圖文】：

法與ｍＮＧＳ結(jié)果矛盾，其中傳統(tǒng)檢測方法檢出金黃色葡萄球菌以及患者咽拭子的??甲型流感核酸陽性，而ｍＮＧＳ僅鑒定出金黃色葡萄球菌，而未能鑒定出甲型流感??病毒，可能與病毒的衣殼較難裂解相關(guān)（圖１）。??表２所有患者的ｍＮＧＳ和傳統(tǒng)檢測方法結(jié)果??ｉＳ？?傳統(tǒng)檢測方法?ｍＮＧＳ?序列數(shù)??華大－１?白色念珠菌?耶氏肺孢子蟲￣￣４?Ｓ??華大－２?陰性?肺炎克雷伯菌?５?低??華大－３?白色念珠菌?ＥＢ病毒?８７９?高??大腸埃希菌?巨細(xì)胞病毒?９?低??耶氏肺孢子蟲?１６３５?高??白色念珠菌?３２３?中??光滑念珠菌?１８?低??華大－４?陰性?流感嗜血桿菌?２９?低??ＥＢ病毒?８０?低??耶氏肺孢子蟲?９５?低??華大－５?肺炎克雷伯菌?肺炎克雷伯菌?１３?低??鮑曼不動桿菌?５７?低??銅綠假單胞菌?１３?低??ＨＳＶ１?１２３０６?高??華大－６?陰性?ＶＺＶ?１１０９２?高??８??
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本文編號：2865437