目的:觀察自身免疫性甲狀腺疾病患者甲狀腺組織組蛋白甲基化的修飾水平。方法:選擇橋本甲狀腺炎患者4例,健康對照者4例,提取甲狀腺組織,分別加入特異性酶抗體,形成蛋白質-DNA免疫復合物,并通過染色質免疫沉淀測序(ChIP-Seq法)檢測甲狀腺組織中組蛋白甲基化的表達水平,比較病例及對照組之間組蛋白的甲基化的水平的高低。結果:(1)分析甲狀腺組織中的組蛋白的甲基化水平,發(fā)現(xiàn)病例組組蛋白甲基化水平低于對照組。(2)HT組和正常對照組相比,組蛋白的甲基化有差異,HT組甲基化的水平與對照組相比是低的。(3)對于組蛋白位點在基因組上的分布,進行功能富集分析后發(fā)現(xiàn),參與分子功能的主要是在組蛋白表達上有差異的甲基化基因,并富集在核糖體信號通路上。結論:通過對自身免疫性甲狀腺疾病患者甲狀腺組織的組蛋白的甲基化的組學的分析可知:HT組和健康對照組相比存在組蛋白的甲基化的差異,當進行功能富集分析后可以看到,在分子功能上主要還是有差異的甲基化的基因,它們主要是在核糖體的信號通路上。這項研究表明,表觀遺傳學機制可能與自身免疫性甲狀腺疾病的發(fā)展有關系。
【學位單位】：新疆醫(yī)科大學
【學位級別】：碩士
【學位年份】：2019
【中圖分類】：R581
【部分圖文】：

TT07- k4 10344329 29635 2 22172 251 330745 9961524 10292269 99.50%TT08-In 10624985 32555 0 45000 518 315066 10231846 10546912 99.27%TT08- k4 10241908 21967 65 111989 918 411267 9695702 10106969 98.68%TT09-In 11485040 20593 103 103584 901 403273 10956586 11359859 98.91%TT09- k4 10934975 17704 321 23788 683 370544 10521935 10892479 99.61%TT12-In 14161014 28083 0 55401 699 484628 13592203 14076831 99.41%TT12- k4TT13-InTT13- k4TT14-InTT14- k4TT15-InTT15- k41651403415889277151752721475386113506511164023191279536628111 561 52422 464 58353327314 520 26537 94 52535229187 483 27424 142 52477828910 507 20449 105 47813333551 453 57224 512 49586036122 549 50940 418 57033427810 449 34027 265 43043415848943 16432476 99.66%15309460 15834812 99.66%14593258 15118036 99.62%14225757 14703890 99.66%12918911 13414771 99.32%15743956 16314290 99.46%12302381 12732815 99.51%

圖 2 比對質量分布圖Fig.2 Compare the mass distribution注：橫坐標是 MAPQ（reads 和參考序列之間比對結果的質量值），縱坐標是 reads 數(shù)。2.2.3 reads 在基因組上的分布統(tǒng)計對各組樣本比對到基因組上各個染色體的密度進行統(tǒng)計，發(fā)現(xiàn)所有樣本在 22 對常染色體和 1 對性染色體上均有分布，在 X 染色體上亦表現(xiàn)出較高的密度分布，這也從一方面說明了橋本甲狀腺炎患者多數(shù)為女性的原因。

圖 2 比對質量分布圖Fig.2 Compare the mass distribution注：橫坐標是 MAPQ（reads 和參考序列之間比對結果的質量值），縱坐標是 reads 數(shù)。2.2.3 reads 在基因組上的分布統(tǒng)計對各組樣本比對到基因組上各個染色體的密度進行統(tǒng)計，發(fā)現(xiàn)所有樣本在 22 對常染色體和 1 對性染色體上均有分布，在 X 染色體上亦表現(xiàn)出較高的密度分布，這也從一方面說明了橋本甲狀腺炎患者多數(shù)為女性的原因。
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本文編號：2851230