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原發(fā)性肝癌合并糖尿病臨床病理特征及全基因組甲基化分析

發(fā)布時間:2020-08-14 07:27
【摘要】:目的:研究原發(fā)性肝癌合并糖尿病患者的臨床病理特征,并利用全基因組甲基化測序技術(shù),篩選原發(fā)性肝癌合并糖尿病患者與原發(fā)性肝癌非糖尿病患者差異甲基化區(qū)域(Differential Methylation Region,DMR),以期為闡明糖尿病作為風(fēng)險因素在肝癌發(fā)生發(fā)展過程中的作用,及原發(fā)性肝癌的早期診斷、預(yù)防和治療提供依據(jù)。方法:收集2016年11月-2018年8月,就診于泉州海峽醫(yī)院肝病患者的臨床信息,整理得到了40例原發(fā)性肝癌合并糖尿病患者與376例原發(fā)性肝癌非糖尿病患者的臨床資料,并對其進行回顧性分析。收集得到7例原發(fā)性肝癌合并糖尿病患者和15例原發(fā)性肝癌非糖尿病患者的血液樣本,提取全基因組DNA,通過全基因組甲基化測序分析,得到DMR,進行GO及KEGG富集分析,最后對富集結(jié)果分析并在公共數(shù)據(jù)庫中進行驗證。結(jié)果:1.分析原發(fā)性肝癌合并糖尿病組與原發(fā)性肝癌非糖尿病組臨床信息顯示年齡、BMI值、ALT水平均有統(tǒng)計學(xué)意義(P0.05),腫瘤標記物CA199有統(tǒng)計學(xué)意義(P0.05),且原發(fā)性肝癌合并糖尿病組均高于原發(fā)性肝癌非糖尿病組。2.全基因組甲基化測序結(jié)果發(fā)現(xiàn),發(fā)生甲基化的位點主要集中CG序列上,在基因功能區(qū)域,CG序列的甲基化處于高水平狀態(tài),CGI區(qū)域甲基化水平最低;基因上下游2Kbp區(qū)域甲基化水平做統(tǒng)計,gene body區(qū)域甲基化水平最高。分析DMR在基因功能區(qū)域中的分布發(fā)現(xiàn),DMR都主要集中在內(nèi)含子區(qū)域。DMR相關(guān)基因GO及KEGG富集分析發(fā)現(xiàn),主要涉及在細胞與神經(jīng)等生物學(xué)過程及嗎啡成癮通路。3.根據(jù)富集結(jié)果篩選得到差異基因ADCY1和GNAO1,經(jīng)驗證其在肝癌組織中顯著低表達,而在肝癌組織的啟動子區(qū)域呈高甲基化水平。結(jié)論:1.糖尿病是年齡相關(guān)的疾病,聯(lián)合檢測相關(guān)指標能提高對早期原發(fā)性肝癌檢出的準確率。2.構(gòu)建了原發(fā)性肝癌合并糖尿病與原發(fā)性肝癌非糖尿病的全基因組范圍內(nèi)單堿基分辨率的DNA甲基化圖譜,以嗎啡成癮通路為突破口,為原發(fā)性肝癌與糖尿病相互作用機制以及早期診斷與預(yù)防提供了思路。3.基因ADCY1和GNAO1為研究原發(fā)性肝癌與糖尿病的關(guān)系提供可能,同時為發(fā)現(xiàn)肝癌發(fā)生發(fā)展相關(guān)的生物標志物以及肝癌的治療提供新靶點。
【學(xué)位授予單位】:華僑大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:R735.7;R587.1
【圖文】:

原發(fā)性肝癌合并糖尿病臨床病理特征及全基因組甲基化分析


DNA文庫構(gòu)建流程圖

原發(fā)性肝癌合并糖尿病臨床病理特征及全基因組甲基化分析


測序過程圖

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甲基化測序分析流程圖

【參考文獻】

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本文編號:2792709

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