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DMARDs治療類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎前后腸道菌群的變化

發(fā)布時(shí)間:2020-06-13 14:08
【摘要】:目的:探討改善病情抗風(fēng)濕藥(Disease modifying antirheumatic drugs,DMARDs)治療類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎(Rheumatoid arthritis,RA)患者前后,患者腸道菌群的變化情況。方法:2017年10月至2018年6月在遵義醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院腎病風(fēng)濕科門診及病房收集初次診斷為RA患者15例,在患者應(yīng)用DMARDs治療前和治療4周時(shí),收集其新鮮糞便標(biāo)本,將其分為治療前組(C組)及治療后組(S組)。在應(yīng)用DMARDs治療的15例初診RA患者中,8例患者接受甲氨蝶呤+羥氯喹+來氟米特治療,為MHF組,5例患者接受甲氨蝶呤+來氟米特治療,為MF組,其中2例患者羥氯喹或來氟米特,故未參與分組。糞便標(biāo)本統(tǒng)一進(jìn)行16S r DNA擴(kuò)增子測序,檢測RA患者治療前后腸道菌群的豐富度及相對(duì)百分比,結(jié)合生物信息學(xué)分析出RA患者治療前后腸道菌群變化情況。結(jié)果:α多樣性分析顯示RA患者經(jīng)DMARDs治療后腸道菌群物種多樣性及豐富度均較治療前降低。β多樣性分析示RA患者在治療后腸道菌群群落的主成分發(fā)生了一定變化,組內(nèi)樣本間菌群群落數(shù)量及結(jié)構(gòu)存發(fā)生了變化,但無明顯統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(R=0.066,P=0.058)。腸道菌群數(shù)量上的變化示:與RA治療前相比較,DMARDs治療后,RA患者腸道菌群中所占比例較高的厚壁菌門(Firmicutes)、擬桿菌門(Bacteroidetes)、變形菌門(Proteobacteria)、放線菌門(Actinobacteria)相對(duì)豐富度無明顯統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P0.05),所占比例稀少的酸桿菌門(Acidobacteria)、生氧光菌門(Oxyphotobacteria)、芽單胞菌門(Gemmatimonadetes)菌群相對(duì)豐富度明顯增加(p0.05)。在屬結(jié)構(gòu)水平,RA患者腸道中相對(duì)豐度低的菌屬如Coprobacter、蛙顫螺菌屬(Oscillospira)、Coprobacillus、Howardella、Lactonifactor、Candidatus_Stoquefichus、乳球菌屬(Lactococcus)、葡萄球菌屬(Staphylococcus)等菌屬明顯減少(P0.05)。排名前30的優(yōu)勢菌屬中鏈球菌屬(Streptococcus)相對(duì)豐富度明顯增加(P0.01),Holdemanella明顯下降(P0.05)。在種結(jié)構(gòu)水平,RA患者腸道微生物中Streptococcus_salivarius較前明顯上升(P0.05),Ruminococcus_bicirculans、Staphylococcus_equoru較前明顯下降(P0.05),而Lactobacillus_mucosae、Lactobacillus_sanfranciscensis、Prevotella_copri無明顯差異(P0.05)。而RA患者在不同的DMARDs治療4周后兩組間比較,腸道菌群也出現(xiàn)了差異。MHF組患者治療后擬桿菌屬及相應(yīng)菌種Bacteroides_plebeius明顯下降,而MF組患者擬桿菌屬及Bacteroides_plebeius上升,組間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05)。MHF組及MF組治療后鏈球菌屬均升高,MHF組患者鏈球菌屬升高較MF治療組明顯,但組間比較無明顯差異(P=0.079)。結(jié)論:RA患者經(jīng)DMARDs治療后腸道菌群數(shù)量及種類均發(fā)生了變化。而不同DMARDs聯(lián)合用藥組方案也可導(dǎo)致腸道菌群各分類水平數(shù)量的差異。
【圖文】:

曲線圖,曲線圖,指數(shù),α多樣性


圖 1 稀釋性曲線圖注: 不同顏色代表每個(gè)不同樣本,圖 1A 為多樣性指數(shù) Observed species 構(gòu)建;圖 1B 為多樣性指數(shù) Shannon 構(gòu)建。2.2.2 α多樣性指數(shù)分析根據(jù)α多樣性指數(shù)分析發(fā)現(xiàn),相比較于 RA 患者治療前,RA 患者經(jīng) DMARDs 治療后反應(yīng)物種豐富度指數(shù)的 Chao1 指數(shù)及 Observed species 指數(shù)明顯下降(P<0.050),而反應(yīng)物種多樣性指數(shù)的 Shannon 指數(shù)有下降趨勢,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(5.96vs5.30,P=0.061),Simpson 指數(shù)明顯下降(P<0.05),,提示 RA 患者經(jīng) DMARDs 治療后腸道菌群豐富度及多樣性下降,(見圖 2 及表 7)。

α多樣性,指數(shù),多樣性指數(shù),圖注


圖 2 α多樣性指數(shù)箱式圖注: *代表 P<0.05,與 C 組比較。表 7 RA 患者治療前后多樣性指數(shù)比較多樣性指數(shù) C 組 S 組 P 值Observed species 439(407~452) 389(351~403)* 0.020Chao1 461.06(431.57~493.39) 410(369.32~451.67)* 0.041Shannon 5.96(5.72~6.05) 5.30(5.22~5.87) 0.061Simpson 0.961(0.947~0.969) 0.938(0.906~0.959)* 0.027注:*代表 P<0.05,與 C 組比較 。
【學(xué)位授予單位】:遵義醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:R593.22

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本文編號(hào):2711292


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