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TRAF2和TRAF5基因單核苷酸多態(tài)性與強直性脊柱炎遺傳易感性的關(guān)聯(lián)研究

發(fā)布時間:2020-05-07 20:47
【摘要】:目的:探討TRAF2與TRAF5基因的八個位點多態(tài)性在強直性脊柱炎易感性及疾病活動度中的作用。方法:本次研究共納入1360例調(diào)查對象,其中患者為673例,均來自于安徽醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院風(fēng)濕免疫科門診;對照組根據(jù)患者的性別、年齡進行頻數(shù)匹配,分別來自于安徽醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院體檢中心和合肥市中心血站的健康人群,共687名對照。研究共納入了TRAF2和TRAF5基因的8個SNP位點(rs3750511,rs10781522,rs17250673,rs59471504,rs6540679,rs12569232,rs4951523,rs7514863),并采用改進的SNPscan方法進行基因型分型。分析比較各位點在病例組和對照組之間基因型及等位基因頻率的分布情況,分析不同性別SNP基因型的分布情況。不同疾病功能指數(shù)以及不同疾病活動度指數(shù),不同HLA-B27狀態(tài)AS患者與TRAF2和TRAF5基因的基因型等位基因頻率之間的關(guān)聯(lián)。分析基因與基因之間、基因與環(huán)境因素之間是否存在交互作用。采用SPSS 16.0軟件進行統(tǒng)計分析,定性資料使用頻數(shù)(%)來表示,組間分析采用?~2檢驗。正態(tài)分布定量資料使用Mean士SD表示,兩組間比較采用t檢驗;而非正態(tài)分布定量資料則采用Median(IQR)表示,組間比較采用Mann-Whitney U檢驗。檢驗水準(zhǔn)設(shè)定為雙側(cè)0.05,多重比較采用Bonferroni法進行校正。結(jié)果:本研究總共包括1360例AS病例和健康對照,其中對照組有687例,平均年齡(28.62±7.76)歲,男女性別比為4.41:1;病例組為673例,平均年齡為(28.58±9.31)歲,男女性別比為4.38:1;經(jīng)過t檢驗和卡方檢驗兩組在性別構(gòu)成(?~2=0.002,P=0.967)和年齡分布(t=0.087,P=0.931)差異無統(tǒng)計學(xué)意義。病例組的HLA-B27為陽性的比例達到61.9%,BASDAI,BASFI和ASDAS-CRP分別為2(0.6,3.8),0.9(0,2.6)和3.28(2.58,4)。對照組中SNP位點均符合哈迪-溫伯格遺傳平衡。病例組與對照組之間等位基因頻率和基因型的分布差異無統(tǒng)計學(xué)意義,P均0.05。根據(jù)性別進行分層分析,結(jié)果顯示:在女性人群中,rs3750511:基因型的頻率在對照組和病例組之間分布差異有統(tǒng)計學(xué)意義(?~2=5.907,P=0.033),但是經(jīng)過Bonferroni校正后差異沒有統(tǒng)計學(xué)意義(校正后的?=0.05/2=0.025)。根據(jù)臨床特征和HLA-B27分析發(fā)現(xiàn):rs10781522:等位基因頻率在BASDAI4分和BASDAI≥4的病例之間分布差異有統(tǒng)計學(xué)意義(?~2=4.434,P=0.035),但是經(jīng)過Bonferroni校正后差異沒有統(tǒng)計學(xué)意義。rs3750511:等位基因頻率的分布在BASDAI4分和BASDAI≥4的病例之間差異有統(tǒng)計學(xué)意義(?~2=10.962,P=0.004),經(jīng)過Bonferroni校正后差異仍然有統(tǒng)計學(xué)意義。采用MDR分析得到一個三位點模型TRAF2(rs10781522,rs17250673)和TRAF5(rs12569232),經(jīng)置換試驗確定后,在檢驗水準(zhǔn)P=0.001下,最大測試準(zhǔn)確度為52.67%,最大交叉驗證一致性為10/10。然后采用多因素Logistic回歸分析,發(fā)現(xiàn)rs3750511位點的顯性模型與睡眠質(zhì)量之間可能存在關(guān)聯(lián)性,其他位點或基因模型中未發(fā)現(xiàn)有統(tǒng)計學(xué)意義的差異。結(jié)論:綜上所述,我們的研究結(jié)果表明,TRAF2與TRAF5中的單一多態(tài)性并不表明與漢族人群中強直性脊柱炎的發(fā)展相關(guān),但是根據(jù)性別分層之后,rs3750511位點的基因型頻率顯示與強直性脊柱炎有關(guān)。在對基因多態(tài)性和疾病活動度進行分析時我們發(fā)現(xiàn)有兩個位點rs10781522和rs375051的基因型頻率分布或等位基因頻率分布有關(guān)。并且我們的研究結(jié)果表明,基因-基因相互作用模型為三個位點模型TRAF2(rs10781522,rs17250673)和TRAF5(rs4951523)與強直性脊柱炎之間關(guān)聯(lián)性有統(tǒng)計學(xué)意義。
【圖文】:

原理圖,分型,原理圖


SNPscanTMSNP分型原理圖

最佳模型,低風(fēng)險,中高,風(fēng)險


36圖 3 三位點最佳模型中高風(fēng)險和低風(fēng)險基因型的分布Figure3 Distribution of high-risk and low-risk genotypes in the best three-locus model.
【學(xué)位授予單位】:安徽醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:R593.23

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本文編號:2653525

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