【摘要】：目的:探索全基因組關(guān)聯(lián)研究中TLR1基因rs4833095,GSDMA基因rs7212938、rs3894194,GSDMB基因rs2305480,CDHR3基因rs6967330這5個陽性錯義突變位點與廣西壯族人群哮喘發(fā)病的關(guān)聯(lián)性,進一步研究廣西壯族人群的哮喘遺傳學(xué)機制。方法:采用病例-對照研究實驗設(shè)計,其中病例組為123例壯族哮喘患者,對照組為壯族健康者100例。采取外周血進行提取DNA,然后通過GWAS Catalog數(shù)據(jù)庫挑選rs4833095、rs7212938、rs3894194、rs2305480、rs6967330這5個位點,隨后結(jié)合NCBI的SNP數(shù)據(jù)庫和Primer 3 Online設(shè)計5個位點的引物,通過多重PCR-LDR酶切進行基因分型,將所得產(chǎn)物片段用測序儀進行鑒定,得出每例研究對象每個位點的基因型圖譜。使用SPSS22.0、SHEsis分析研究對象的基本特征、Hardy-Weinberg平衡檢驗、基因型頻率分布差異、等位基因型頻率分布差異以及各個位點的遺傳模型與哮喘之間的關(guān)系,使用Haploview 4.2進行其中位于同一條染色體17q21上的rs3894194、rs7212938以及rs2305480這三個位點的連鎖不平衡分析以及進行3個位點單倍體的構(gòu)建,分析各單倍體與哮喘之間的關(guān)聯(lián)性。結(jié)果:1.基本特征的統(tǒng)計結(jié)果:兩組之間的性別和體重差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.091);病例組和對照組平均年齡和身高差異顯示有統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.000)。2.5個位點的關(guān)聯(lián)分析結(jié)果:(1)對照組中的基因型以及等位基因型頻率分布符合Hardy-Weinberg平衡(P值0.05)。TLR1基因rs4833095,GSDMA基因rs7212938、rs3894194,GSDMB基因rs2305480,CDHR3基因rs6967330這5個位點在廣西壯族哮喘人群中存在多態(tài)性。(2)5個位點的基因型及等位基因型頻率在病例組和對照組中的分布無統(tǒng)計學(xué)差異。(3)應(yīng)用Logistic回歸分析在等位位點模型、純合子模型、雜合子模型、顯性模型、隱性模型狀態(tài)下5個位點與哮喘的關(guān)系均顯示無統(tǒng)計學(xué)意義;3.3個位點之間連鎖不平衡及單體型分析結(jié)果:位于17 q21上的rs3894194、rs7212938以及rs2305480之間均存在連鎖不平衡(D′0.8),其中rs2305480與rs3894194之間、rs3894194與rs7212938之間存在“強LD”(r~20.33)。通過Haploview 4.2在三個位點之間構(gòu)建的單體型:rs2305480與rs3894194位點之間為單體型塊1,rs2305480至rs7212938位點為單體型塊2,rs3894194與rs7212938位點間構(gòu)建單體型塊3,單體型塊1中由rs2305480與rs3894194兩個位點構(gòu)建的單體型中CC單體型在兩組間分布具有顯著差異,在病例組中分布較多(χ~2=5.17,P=0.02,OR=1.72,95%CI=1.07-2.79),其余單體型CT、TC、TT在兩組中的分布未見明顯異常(P0.05)。由rs2305480、rs3894194、rs7212938三個位點構(gòu)成的單體型CCT在病例組及對照組中的分布具有顯著差異,在病例組中分布較多(χ~2=4.45,P=0.03,OR=1.74,95%CI=1.04-2.92)。其余單體型CTG、TCT、CTT、CCG、TTG在病例對照組間分布未見明顯異常(P0.05)。單體型塊3中的各單倍體在病例及對照組中分布均未見明顯差異(P0.05)。結(jié)論:(1)TLR1基因rs4833095,GSDMA基因rs7212938、rs3894194,GSDMB基因rs2305480,CDHR3基因rs6967330這5個位點在廣西壯族哮喘人群中存在多態(tài)性。(2)廣西壯族正常健康人群與哮喘患者的5個位點單獨進行基因型、等位基因型分布、各遺傳模型分析均無差異。(3)廣西壯族人群中攜帶由rs2305480與rs3894194兩個位點構(gòu)建的單體型CC單體型以及由rs2305480、rs3894194、rs7212938三個位點構(gòu)成的單體型CCT的個體罹患哮喘的風(fēng)險可能增加。
【圖文】：

分組 病例（n=123） 對照（n=100） χ2/性 50（40.7%） 52（52.0％）2.8性 73（59.3％） 48（48.0％） 39.06±12.33 28.34±3.31 9.2 157.83±7.58 163.15±6.50 -5.2 54.98±10.31 55.48±10.00 -0.3位點在廣西壯族人群中的研究結(jié)果R 瓊脂糖電泳結(jié)果糖凝膠電泳檢測結(jié)果只能觀察 PCR 產(chǎn)物的效應(yīng)中加入的量。PCR 電泳圖：圖 2-1（實驗中于每個位點是否好無法通過電泳觀察）：

組關(guān)聯(lián)研究陽性錯義突變位點與廣西壯族哮喘的關(guān)聯(lián)研究 2016 級碩士研2 3730 電泳與 Genemapper 分析結(jié)果在哮喘組及對照組中 5 個位點均有 3 種基因型，，隨機截取各個位不同基因型的圖譜，具體如下：2.1 rs4833095 位點的基因型圖譜藍色單峰對應(yīng)純合子 CC、TT 基因型，藍色雙峰為雜合子 CT 基 2-2）。
【學(xué)位授予單位】：廣西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2019
【分類號】：R562.25

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1 王寧;王立軍;任筱

本文編號：2645942