【摘要】：[目的]長(zhǎng)鏈非編碼RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)是一類位于細(xì)胞核和(或)細(xì)胞質(zhì)內(nèi)長(zhǎng)度超過200個(gè)核苷酸單位且缺乏編碼蛋白質(zhì)功能的功能性RNA分子。它可以在表觀遺傳水平、轉(zhuǎn)錄水平及轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)節(jié)基因的廣泛參與機(jī)體的生理、病理過程。lncRNA在細(xì)胞分化及機(jī)體的免疫反應(yīng)中表現(xiàn)出顯著的調(diào)節(jié)作用,隨著各種測(cè)序技術(shù)的發(fā)展顯著促進(jìn)了 lncRNA在人類疾病中的研究。在SLE患者中定義與疾病相關(guān)的lncRNA有助于建立新的生物標(biāo)志物和潛在的治療靶點(diǎn),同時(shí)為進(jìn)一步研究lncRNA與SLE之間的具體機(jī)制及尋找疾病易感基因奠定奠定一定的理論基礎(chǔ)。本課題將探索SLE患者外周血單個(gè)核細(xì)胞(Peripheral blood mononuclear cells,PBMC)中差異性表達(dá)的lncRNA并分析其與疾病之間的關(guān)系。[方法]本研究分兩個(gè)組,SLE組(SLE)和健康對(duì)照組(NC)。分別收集13例SLE患者和健康參與者空腹外周靜脈血20ml,提取兩組研究對(duì)象PBMC的總RNA后,結(jié)合前期高通量測(cè)序技術(shù)(RNA-seq)及HISAT、String Tie和Blotting分析后篩選出的在SLE患者中差異性表達(dá)的linc00861,進(jìn)一步進(jìn)行qRT-PCR對(duì)linc00861進(jìn)行進(jìn)一步驗(yàn)證,并分析其與SLE疾病臨床表現(xiàn)的相關(guān)性。[結(jié)果]1.RNA-seq共分析63677個(gè)ensembl gene ID的基因表達(dá)矩陣,最后得到11044個(gè)有g(shù)ene symbol的表達(dá)矩陣,lncRNA有1584個(gè),我們將該表達(dá)矩陣進(jìn)行對(duì)數(shù)轉(zhuǎn)化,最后篩選出在SLE患者中顯著性差異性表達(dá)的lncRMA主要為 linc00861;2.進(jìn)一步對(duì)linc00861進(jìn)行qRT-PCR驗(yàn)證,結(jié)果提示SLE患者(SLE組)較健康對(duì)照組(NC組)linc00861的表達(dá)水平顯著降低,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05);3.進(jìn)一步分析SLE患者PBMC中l(wèi)inc00861表達(dá)水平與其臨床表現(xiàn)的相關(guān)性,發(fā)現(xiàn)SLE患者PBMC中l(wèi)inc00861的表達(dá)水平與SLEDAI積分負(fù)相關(guān);尿蛋白陽性的SLE患者linc00861表達(dá)水平顯著低于尿蛋白陰性的SLE患者;SLE低補(bǔ)體患者linc00861表達(dá)水平低于SLE正常補(bǔ)體患者。[結(jié)論]SLE患者PBMC中l(wèi)inc00861表達(dá)水平顯著低于正常對(duì)照組,并與疾病活動(dòng)及腎臟受累程度相關(guān),提示linc00861可能參與SLE的發(fā)病,為SLE發(fā)病機(jī)制的研究提示新的方向,有助于建立新的生物標(biāo)記和提供潛在的治療靶點(diǎn)。
【圖文】：

ＩｎｃＲＮＡ是一類不編碼蛋白的ＲＮＡ分子，長(zhǎng)度在２００ｂｐ以上，無逡逑閱讀框架，通常呈現(xiàn)二級(jí)莖環(huán)樣結(jié)構(gòu)或是更多的二級(jí)結(jié)構(gòu)［１１］，起初被認(rèn)為是逡逑ＮＡ聚合酶ＩＩ轉(zhuǎn)錄的副產(chǎn)物，，不具有生物學(xué)功能；近期的研究表明ＩｎｃＲＮＡ具逡逑保守的二級(jí)結(jié)構(gòu)，可以與蛋白、ＤＮＡ和ＲＮＡ相互作用，參與多種生物學(xué)過程逡逑調(diào)控，尤其在各類腫瘤疾病中發(fā)揮了重要的調(diào)控角色，如染色質(zhì)修飾、轉(zhuǎn)錄激逡逑和抑制、轉(zhuǎn)錄后調(diào)解以及作為ｍｉＲＮＡ的誘導(dǎo)分子千擾基因的表達(dá)等多種重要逡逑調(diào)控過程，與人類疾病的發(fā)生、發(fā)展和防治都有著密切聯(lián)系［１２］。隨著高通量測(cè)逡逑技術(shù)的發(fā)展，越來越多的ＩｎｃＲＮＡ被注釋，但是絕大多數(shù)的ＩｎｃＲＮＡ的功能仍逡逑不清楚，因此ＩｎｃＲＮＡ的研究是一片非常廣闊的未知領(lǐng)域，具有極大的研究?jī)r(jià)逡逑和意義。根據(jù)染色體上與編碼基因的相對(duì)位置將ＩｎｃＲＮＡ分為反義型（ａｎｔｉｓｅｎｓｅ逡逑ｃＲＮＡｓ）、內(nèi)含子型（ｉｎｔｒｏｎｉｃｌｎｃＲＮＡｓ邋）、基因間型（ｉｎｔｅｒｇｅｎｉｃｌｎｃＲＮＡｓ）、反逡逑型（ｄｉｖｅｒｇｅｎｔ邋ＩｎｃＲＮＡｓ）、X椙孔有停ǎ澹睿瑁幔睿悖澹潁╁澹郟保�，１４Ｊnｅ義希粒睿椋睿睿錚

本文編號(hào)：2643099