欽州市欽南區(qū)HIV-1流行亞型及基因變異特征研究
發(fā)布時間:2019-12-01 15:35
【摘要】:目的調(diào)查流行于欽南區(qū)的HIV-1亞型種類并分析其基因變異特征。方法抽取100例未抗病毒治療的HIV-1感染者,從血樣中提取病毒RNA或前病毒DNA,采用聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)擴增HIV-1gag基因和pol基因片段并測序,用系統(tǒng)進化樹分析其亞型,并計算gag和pol區(qū)的基因離散率。結(jié)果 97份血樣獲得gag基因序列或pol基因序列,4份血樣的gag與pol分型不一致,其他93份分型明確,其中CRF01_AE重組型、CRF07_BC重組型、CRF08_BC重組型及G亞型分別占76.34%(71/93)、9.68%(9/93)、12.90%(12/93)和1.07%(1/93)。CRF08_BC的gag基因離散率為0.059±0.005,高于CRF07_BC的0.053±0.005(P0.01)和CRF01_AE的0.049±0.004(P0.01)。CRF01_AE的pol基因離散率為0.044±0.003,高于CRF07_BC的0.035±0.004(P0.01)和CRF08_BC的0.033±0.003(P0.01)。結(jié)論欽南區(qū)HIV-1存在至少3種流行亞型,其中CRF01_AE是最主要的亞型,不同基因區(qū)的變異程度有所不同。
本文編號:2568420
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,本文編號:2568420
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