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  本文關(guān)鍵詞：基于互信息分析系統(tǒng)性紅斑狼瘡與乳腺癌的發(fā)病機理

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【摘要】：系統(tǒng)性紅斑狼瘡(systemic lupus erythematosus,SLE)是一種免疫性性疾病。乳腺癌(breast cancer,BC)即乳腺惡性腫瘤,是女性常見的惡性腫瘤之一。乳腺癌患者體內(nèi)眾多免疫功能低下,其免疫系統(tǒng)無法識別并殺死癌細胞,然而,系統(tǒng)性紅斑狼瘡患者體內(nèi)免疫系統(tǒng)反應(yīng)過度強烈,產(chǎn)生大量抗體攻擊自身細胞,可見兩種疾病均與免疫系統(tǒng)息息相關(guān)但調(diào)控結(jié)果背道而馳,目前這一機制尚不明確�；诖�,本研究從基因之間的關(guān)聯(lián)性考慮,首先,利用互信息(mutual information,MI)方法篩選出1 250個SLE與BC共有顯著基因;第二,將這些基因利用David分析,得到37個轉(zhuǎn)錄因子及其調(diào)控的378個靶基因,最后,采用快速網(wǎng)絡(luò)成分分析算法(fast network component analysis,Fast NCA)分別預測SLE和BC發(fā)病過程中轉(zhuǎn)錄因子活性以及對靶基因調(diào)控強度的變化,并構(gòu)建調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。經(jīng)過兩種疾病調(diào)控網(wǎng)絡(luò)對比,發(fā)現(xiàn)AKT2、CCAR1、MTF2、RUFY2等基因在這兩種疾病中活性變化明顯相反,并且通過分子生物學分析,它們在有絲分裂,細胞凋亡,免疫反應(yīng)以及炎癥反應(yīng)過程中的變化對SLE與BC的致病具有重要作用。
【作者單位】： 上海海事大學信息工程學院;美國羅文大學生物化學系;
【基金】：國家自然科學基金項目(61271446) 上海市教委科研創(chuàng)新項目(15ZZ079)共同資助
【分類號】：R593.241;R737.9
【正文快照】： Analysis of Pathogenesis between Systemic Lupus Erythematosus andBreast Cancer Based on Mutual InformationZhu Mengxing1Kong Wei1*Mou Xiaoyang21 Information Engineering College,Shanghai Maritime University,Shanghai,201306;2 Department of Chemistry and Bio

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