本文關(guān)鍵詞：大連地區(qū)HIV-1 CRF01_AE亞型株基因特征分析

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【摘要】：目的了解大連地區(qū)HIV-1 CRF 01_AE亞型株的基因特征及其可能傳播鏈。方法對2008—2012年新確認144份全血標本進行血漿分離和HIV RNA提取,巢式PCR擴增Env基因并進行序列測定,并對CRF 01_AE亞型毒株序列進行生物信息學(xué)分析。結(jié)果得到的HIV感染者有效基因序列中,CRF 01_AE亞型占62.14%(64/103),所有病例均為性接觸途徑傳播。系統(tǒng)進化樹分析大連CRF 01_AE存在2個簇,分別以男男同性傳播和異性傳播毒株為主,其中男男同性性接觸人群(MSM)簇組內(nèi)平均基因離散率小于異性性接觸者(Hetero)簇;與其他地區(qū)的CRF 01_AE亞型株構(gòu)建的系統(tǒng)進化樹顯示2簇內(nèi)均無其他國家序列,MSM簇與遼寧(除大連地區(qū),下同)、北京和吉林MSM人群的CRF 01_AE亞型株位于同一分支,Hetero簇毒株則與遼寧、北京的MSM流行株及東南沿海地區(qū)異性傳播CRF 01_AE亞型株遺傳距離相近。結(jié)論大連市HIV-1 CRF 01_AE株主要通過性接觸傳播,男男同性傳播毒株占主導(dǎo)優(yōu)勢,毒株傳入大連時間晚于異性性接觸者簇流行株;MSM存在2個以上傳播鏈,與北方部分地區(qū)MSM人群中CRF 01_AE亞型株存在多次傳播。
【作者單位】： 大連市疾病預(yù)防控制中心;
【分類號】：R512.91
【正文快照】： 人類免疫缺陷病毒(human immunodeficiencyvirus,HIV)是引起艾滋病(acquired immune defi-ciency syndrome,AIDS)的唯一病原[1-2],根據(jù)對病毒的全基因序列分析以及艾滋病病毒系統(tǒng)分類標準可以分為HIV-1和HIV-2型,目前流行全球的HIV-1分為M(main)、O(outlier)和N(non-M-non-O)3

【相似文獻】

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1 金奇;病毒的進化分析[J];中華實驗和臨床病毒學(xué)雜志;1997年02期

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本文編號：1170624