大連地區(qū)HIV-1 CRF01_AE亞型株基因特征分析
發(fā)布時(shí)間:2017-11-11 08:32
本文關(guān)鍵詞:大連地區(qū)HIV-1 CRF01_AE亞型株基因特征分析
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【摘要】:目的了解大連地區(qū)HIV-1 CRF 01_AE亞型株的基因特征及其可能傳播鏈。方法對(duì)2008—2012年新確認(rèn)144份全血標(biāo)本進(jìn)行血漿分離和HIV RNA提取,巢式PCR擴(kuò)增Env基因并進(jìn)行序列測(cè)定,并對(duì)CRF 01_AE亞型毒株序列進(jìn)行生物信息學(xué)分析。結(jié)果得到的HIV感染者有效基因序列中,CRF 01_AE亞型占62.14%(64/103),所有病例均為性接觸途徑傳播。系統(tǒng)進(jìn)化樹分析大連CRF 01_AE存在2個(gè)簇,分別以男男同性傳播和異性傳播毒株為主,其中男男同性性接觸人群(MSM)簇組內(nèi)平均基因離散率小于異性性接觸者(Hetero)簇;與其他地區(qū)的CRF 01_AE亞型株構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹顯示2簇內(nèi)均無(wú)其他國(guó)家序列,MSM簇與遼寧(除大連地區(qū),下同)、北京和吉林MSM人群的CRF 01_AE亞型株位于同一分支,Hetero簇毒株則與遼寧、北京的MSM流行株及東南沿海地區(qū)異性傳播CRF 01_AE亞型株遺傳距離相近。結(jié)論大連市HIV-1 CRF 01_AE株主要通過(guò)性接觸傳播,男男同性傳播毒株占主導(dǎo)優(yōu)勢(shì),毒株傳入大連時(shí)間晚于異性性接觸者簇流行株;MSM存在2個(gè)以上傳播鏈,與北方部分地區(qū)MSM人群中CRF 01_AE亞型株存在多次傳播。
【作者單位】: 大連市疾病預(yù)防控制中心;
【分類號(hào)】:R512.91
【正文快照】: 人類免疫缺陷病毒(human immunodeficiencyvirus,HIV)是引起艾滋病(acquired immune defi-ciency syndrome,AIDS)的唯一病原[1-2],根據(jù)對(duì)病毒的全基因序列分析以及艾滋病病毒系統(tǒng)分類標(biāo)準(zhǔn)可以分為HIV-1和HIV-2型,目前流行全球的HIV-1分為M(main)、O(outlier)和N(non-M-non-O)3
【相似文獻(xiàn)】
中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條
1 金奇;病毒的進(jìn)化分析[J];中華實(shí)驗(yàn)和臨床病毒學(xué)雜志;1997年02期
,本文編號(hào):1170624
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