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microRNA調(diào)節(jié)TGF-β信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的數(shù)學(xué)模型及對(duì)前列腺癌的影響

發(fā)布時(shí)間:2017-06-05 11:17

  本文關(guān)鍵詞:microRNA調(diào)節(jié)TGF-β信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的數(shù)學(xué)模型及對(duì)前列腺癌的影響,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:TGF-β是一種多功能的細(xì)胞因子,在腫瘤的早期可抑制細(xì)胞增殖、啟動(dòng)細(xì)胞分化、誘導(dǎo)凋亡,但在腫瘤的進(jìn)展期促進(jìn)腫瘤的侵襲和轉(zhuǎn)移。Micro RNA(mi RNA)的異常表達(dá)與腫瘤的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān),它還可以通過抑制TGF-β信號(hào)導(dǎo)致前列腺癌的發(fā)生。在前列腺癌中,通過文獻(xiàn)收集可知約100個(gè)mi RNA具有異常表達(dá)現(xiàn)象。通過通路富集分析,我們得到6個(gè)調(diào)節(jié)TGF-β信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的mi RNA,它們是mi R-21、mi R-106b、mi R-20a、mi R-155、mi R-26a和mi R-92a。與原發(fā)性前列腺癌相比,轉(zhuǎn)移性前列腺癌中mi R-21、mi R-106b和mi R-20a的表達(dá)量隨著前列腺癌的進(jìn)展不同程度地增加。通過分析和文獻(xiàn)查閱可知,mi RNA在TGF-β信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路中的靶點(diǎn)主要是細(xì)胞膜的受體和細(xì)胞質(zhì)內(nèi)的Smad蛋白。據(jù)此,我們從系統(tǒng)生物學(xué)角度出發(fā),在整體水平上探究TGF-β信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的性質(zhì)。我們構(gòu)建了mi RNA調(diào)節(jié)TGF-β信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的數(shù)學(xué)模型,重點(diǎn)考慮了mi RNA對(duì)通路的影響。結(jié)果顯示,與正常情況相比,前列腺癌對(duì)應(yīng)細(xì)胞核內(nèi)p S2S4復(fù)合物動(dòng)力學(xué)曲線在強(qiáng)度和持續(xù)時(shí)間上在很大程度上有所減弱。模型敏感性分析表明與配體受體復(fù)合物、細(xì)胞核內(nèi)復(fù)合物以及轉(zhuǎn)移相關(guān)的過程對(duì)調(diào)節(jié)TGF-β相關(guān)反應(yīng)具有重要作用并且兩個(gè)與mi RNA相關(guān)的動(dòng)力學(xué)參數(shù)具有高敏感性。另外,對(duì)模型的隨機(jī)分析可知,細(xì)胞核內(nèi)p S2S4復(fù)合物對(duì)mi R-21和mi R-106b的擾動(dòng)具有一定的穩(wěn)定性,而對(duì)mi R-155和mi R-20a的擾動(dòng)穩(wěn)定性很強(qiáng)。本課題從動(dòng)力學(xué)角度揭示了mi RNA調(diào)節(jié)TGF-β信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路對(duì)于前列腺癌發(fā)生發(fā)展的影響,對(duì)于前列腺癌的深層次研究具有重要理論意義。
【關(guān)鍵詞】:microRNA TGF-β信號(hào)通路 數(shù)學(xué)模型 動(dòng)力學(xué) 前列腺癌
【學(xué)位授予單位】:蘇州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R737.25
【目錄】:
  • 中文摘要4-5
  • Abstract5-8
  • 第一章 序言8-13
  • 1.1 課題背景和意義8-10
  • 1.1.1 miRNA對(duì)前列腺癌發(fā)生發(fā)展的影響8
  • 1.1.2 TGF-β 信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路簡(jiǎn)介8-9
  • 1.1.3 數(shù)學(xué)模型的研究背景和意義9-10
  • 1.2 mi RNA調(diào)節(jié)TGF-β 信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路數(shù)學(xué)模型的研究現(xiàn)狀10-11
  • 1.2.1 TGF-β 信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路模型的研究現(xiàn)狀10
  • 1.2.2 miRNA介導(dǎo)的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路模型研究現(xiàn)狀10-11
  • 1.2.3 小結(jié)11
  • 1.3 miRNA 調(diào)節(jié)TGF-β信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路數(shù)學(xué)模型的研究?jī)?nèi)容及目的11-13
  • 第二章 前列腺癌異常表達(dá)microRNA的收集與分析13-22
  • 2.1 數(shù)據(jù)收集13
  • 2.2 生物信息學(xué)分析工具13
  • 2.3 mi RNA對(duì)TGF-β 信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路靶點(diǎn)的預(yù)測(cè)及分析13-15
  • 2.4 mi RNA在前列腺癌不同階段的異常表達(dá)情況15-18
  • 2.4.1 第一類miRNA在前列腺癌中的表達(dá)情況15-17
  • 2.4.2 第二類miRNA在前列腺癌中的表達(dá)情況17
  • 2.4.3 miRNA表達(dá)數(shù)量化處理17-18
  • 2.5 mi RNA在前列腺癌中的功能18-22
  • 第三章 前列腺癌中miRNA調(diào)節(jié)TGF-β 信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路數(shù)學(xué)模型的構(gòu)建22-32
  • 3.1 TGF-β 信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路模塊介紹22-24
  • 3.1.1 受體轉(zhuǎn)運(yùn)和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)23
  • 3.1.2 Smad蛋白核質(zhì)穿梭和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)23-24
  • 3.1.3 miRNA調(diào)節(jié)蛋白表達(dá)和信號(hào)調(diào)節(jié)24
  • 3.2 模型的構(gòu)建及表示-常微分方程組24-25
  • 3.3 模型初始值及估計(jì)方法25-27
  • 3.4 模型參數(shù)及估計(jì)方法27-31
  • 3.5 模型驗(yàn)證31-32
  • 第四章 miRNA調(diào)節(jié)TGF-β 信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路數(shù)學(xué)模型動(dòng)力學(xué)仿真及分析32-43
  • 4.1 mi RNA調(diào)控RII受體的動(dòng)力學(xué)模型及分析32-34
  • 4.2 mi RNA調(diào)控RI受體的動(dòng)力學(xué)模型及分析34-36
  • 4.3 mi RNA調(diào)控SMAD2 蛋白的動(dòng)力學(xué)模型及分析36-39
  • 4.4 mi RNA調(diào)控SMAD4 蛋白的動(dòng)力學(xué)模型及分析39-41
  • 4.5 小結(jié)41-43
  • 第五章 miRNA調(diào)節(jié)TGF-β 信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的數(shù)學(xué)模型性質(zhì)分析43-50
  • 5.1 模型參數(shù)的敏感性分析43-45
  • 5.2 重要成分的隨機(jī)性分析45-50
  • 5.2.1 隨機(jī)性分析簡(jiǎn)介45-46
  • 5.2.2 miRNA的隨機(jī)性分析46-48
  • 5.2.3 小結(jié)48-50
  • 第六章 結(jié)論與展望50-52
  • 參考文獻(xiàn)52-57
  • 附錄一57-58
  • 附錄二58-59
  • 附錄三59-60
  • 附錄四60-61
  • 附錄五61-62
  • 附錄六62-63
  • 致謝63-64

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本文編號(hào):423615

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