M受體阻滯劑治療大鼠膀胱出口梗阻后差異表達(dá)基因的篩選與分析
發(fā)布時(shí)間:2021-05-11 14:48
目的:研究M受體阻滯劑治療大鼠膀胱出口梗阻后,對(duì)膀胱功能調(diào)控的關(guān)鍵基因及信號(hào)通路。方法:構(gòu)建大鼠膀胱出口部分梗阻(pBOO)模型,采用全基因組mRNA測(cè)序,篩選差異表達(dá)的DEGs,使用R語言對(duì)DEGs進(jìn)行GO功能注釋和KEGG通路分析,采用String 數(shù)據(jù)庫構(gòu)建蛋白-蛋白互作網(wǎng)絡(luò),使用Cytoscape篩出Hub基因。結(jié)果:pBOO后共篩選出328個(gè)DEGs,該DEGs參與平滑肌、免疫、細(xì)胞外基質(zhì)相關(guān)功能調(diào)控。給予M受體阻滯劑后發(fā)現(xiàn)DEGs主要參與局部黏附,白細(xì)胞跨內(nèi)皮遷移,細(xì)胞外基質(zhì)受體相互作用等炎癥和細(xì)胞外基質(zhì)沉積的調(diào)節(jié)。MCC算法篩選出Cd34、Col4a1等Hub基因。結(jié)論:BOO后給予M受體阻滯劑能調(diào)控Cd34、Col4a1等炎癥及纖維化基因的表達(dá),同時(shí)能調(diào)控細(xì)胞黏附、炎癥、細(xì)胞外基質(zhì)沉積的相關(guān)通路。
【文章來源】:中國研究型醫(yī)院. 2020,7(03)
【文章頁數(shù)】:10 頁
【文章目錄】:
引言
1資料與方法
1.1大鼠pBOO模型的建立
1.2基因芯片檢測(cè)
1.3基因芯片數(shù)據(jù)分析及統(tǒng)計(jì)
2結(jié)果
2.1成功建立大鼠pBOO模型
2.2 pBOO后膀胱差異基因的篩選及功能變化
2.3 M受體治療后膀胱差異基因及功能的變化
2.4 M受體治療后膀胱差異基因的PPI蛋白調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和Hub基因篩選
3討論
本文編號(hào):3181595
【文章來源】:中國研究型醫(yī)院. 2020,7(03)
【文章頁數(shù)】:10 頁
【文章目錄】:
引言
1資料與方法
1.1大鼠pBOO模型的建立
1.2基因芯片檢測(cè)
1.3基因芯片數(shù)據(jù)分析及統(tǒng)計(jì)
2結(jié)果
2.1成功建立大鼠pBOO模型
2.2 pBOO后膀胱差異基因的篩選及功能變化
2.3 M受體治療后膀胱差異基因及功能的變化
2.4 M受體治療后膀胱差異基因的PPI蛋白調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和Hub基因篩選
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