人類精漿糖基化蛋白質(zhì)組學(xué)研究
【學(xué)位授予單位】:南京醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R698.2
【圖文】:
20圖 1:人類精漿 N 聯(lián)糖基化蛋白質(zhì)組學(xué)的特征,及與其他已知糖蛋白的對(duì)比。(A)五次生物學(xué)重復(fù)鑒定的 N 聯(lián)糖基化蛋白質(zhì)覆蓋率;(B)五次生物學(xué)重復(fù)鑒定的 N 聯(lián)糖基化位點(diǎn)覆蓋率;(C)用 MotifX. WebLogo 3 衍生的 N 聯(lián)糖基化相對(duì)頻率圖及共有序列;(D)精漿糖基化蛋白質(zhì)譜中蛋白質(zhì)上分布的 N 聯(lián)糖基化位點(diǎn)數(shù)目。Rolland 等總結(jié)了既往的蛋白質(zhì)譜數(shù)據(jù)庫,總結(jié) 2545 種不同的人類精漿蛋白質(zhì)[40]。在這些蛋白質(zhì)中,我們的研究表明其中 263 個(gè)為糖基化蛋白質(zhì)(圖2A)。在我們的糖基化蛋白質(zhì)譜系,109 個(gè)糖基化蛋白質(zhì)是第一次被鑒定到,在以往的精漿蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)庫中沒有提及。糖基化位點(diǎn)的周圍序列(二端各6 個(gè)氨基酸)是糖基化修飾的調(diào)控序列,在 dbPTM 數(shù)據(jù)庫中,通常用這些調(diào)
我們的研究表明其中 263 個(gè)為糖基化蛋白質(zhì)(圖2A)。在我們的糖基化蛋白質(zhì)譜系,109 個(gè)糖基化蛋白質(zhì)是第一次被鑒定到,在以往的精漿蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)庫中沒有提及。糖基化位點(diǎn)的周圍序列(二端各6 個(gè)氨基酸)是糖基化修飾的調(diào)控序列,在 dbPTM 數(shù)據(jù)庫中,通常用這些調(diào)
釗湎嗷プ饔霉叵怠?6 個(gè)基因通過 147 個(gè)相互作用關(guān)聯(lián)(圖3A)。關(guān)聯(lián)最多的基因是 FN1(22 個(gè)相互關(guān)聯(lián)基因),其次是 TGFB1(19 個(gè)相互關(guān)聯(lián)基因),其他還有比如 CLU,SERPINA1,TIMP1 也都與其他糖基化蛋白質(zhì)有廣泛的相互作用關(guān)系。
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