【摘要】：背景微生物與人類的疾病和健康息息相關�！敖】等说哪蛞簾o菌”的傳統觀點隨著新技術的出現而被打破,有大量的研究結果表明尿液菌群的變化可能與下尿路癥狀(lower urinary tract symptoms,LUTS)有關。糖尿病性膀胱功能障礙(diabetic Bladder Dysfunction,DBD)是最常見的糖尿病相關的下尿路并發(fā)癥之一。目前DBD的發(fā)病原因仍未明確,總體治療效果不佳。本研究旨在挖掘DBD患者和正常人尿液菌群的差異,從中尋找DBD潛在的菌屬標志物,探討尿液菌群變化與DBD之間的聯系。方法1.研究對象2017年6月至2017年11月間在南方醫(yī)院內分泌代謝科診斷為2型糖尿病的中老年女性患者納入為DM組(32人),南方醫(yī)院體檢中心健康志愿者納入為對照組(26人)。2.數據采集收集所有參與者的人口學特征(年齡、體重等)、臨床特征(高血壓、糖尿病腎病等)和生化指標(糖化血紅蛋白、血肌酐等)。所有參與者均要求填寫國際前列腺癥狀評分(International Prostate Symptom Score,JIPSS)。3.尿液DNA提取、擴增及測序留取所有參與者清潔中段尿標本(約50ml),使用BiOstic Bacteremia DNA Isolation試劑盒提取DNA并針對細菌16S rRNA基因的V3-V4區(qū)進行擴增,最后基于Illumina MiSeq平臺進行測序。4.生物信息學分析測序數據導入QIIME并聚類成操作分類單位。基于操作分類單位的物種聚類結果,進行尿液菌群的α和β多樣性分析。利用Linear discriminant analysis effect size(LEfSe)在線工具鑒別在屬水平上顯著差異的細菌。5.統計學方法計量資料采用Mann-Whitney U檢驗或f檢驗進行比較,計數資料采用Pearson卡方檢驗或Fisher確切概率法進行比較,雙變量相關性分析使用Pearson相關性分析。P0.05認為差異有統計學意義。結果DM組的IPSS總得分、儲尿期癥狀得分、排尿期癥狀得分均顯著高于對照組(P均0.05)。DM組和對照組尿液菌群的α多樣性差異無統計學意義。主成分分析三維圖顯示,DM組和對照組樣本分別聚類成兩個不同區(qū)域,提示兩組間尿液菌群結構存在顯著性差異(β多樣性)。LEfSe分析提示,大腸埃希-志賀菌屬(Escherichia-Shiglla)和克雷伯菌屬(Kebbsiella)等10個菌屬的相對豐度在DM組中升高。不解糖嗜膝菌屬(Peptoniphilus)和Solitalea等7個菌屬在對照組中升高。除了糖化血紅蛋白(glycatedhemoglobin,GHb)外,中到重度LUTS組(HS組,總IPSS7)與輕度LUTS組(LS組,總IPSSS7)在人口學及臨床特征上差異無統計學意義。HS組尿液菌群的Observed Species、Chao 1指數和ACE指數均顯著低于對照組。主成分分析的三維圖顯示,HS組和LS組尿液菌群的β多樣性差異有統計學意義。LEfSe分析提示,屬水平上大腸埃希-志賀菌屬(Esrcherichia-Shigella)和彎曲桿菌屬(Campylobacter)等3 個菌屬在HS組中升高。普雷沃菌屬(Prevotella)和小桿菌屬(Dialister)等16個菌屬在LS組中顯著升高。由于LS組和HS組之間的GHb存在顯著差異,進一步將DM組中血糖控制良好的患者(LH組,GHb≤7%)與血糖控制欠佳的患者(HH組,GHb7)分成兩個亞組進行尿液菌群特征分析。HH組尿液菌群的香農指數顯著低于LH組,辛普森指數顯著高于LH組。主成分分析的三維圖顯示,HH組和LH組尿液菌群的β多樣性差異有統計學意義。LEfSe分析提示,屬水平上大腸埃希-志賀菌屬(Escherichia-Shigella)和乳酸桿菌屬(Lactobacillus)在HH組中升高。普雷沃菌屬(Prevotella)和彎曲桿菌屬(Campylobacter)等10個菌屬在LH組中顯著升高。另外,雙變量相關性分析發(fā)現GHb與IPSS總得分呈正相關。結論DM組與對照組、HS組與LS組以及HH組與LH組的尿液菌群結構存在明顯差異。某些菌群的變化可能與DBD發(fā)病有關。糖尿病患者LUTS的嚴重程度與血糖水平有關,尿液菌群的改變可能是高血糖推動DM患者LUTS的發(fā)展的原因之一。
【學位授予單位】：南方醫(yī)科大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2019
【分類號】：R587.2;R694.5
【圖文】：

３．２．２邋ａ多樣性逡逑各樣品的ａ多樣性指數詳見表３－２．ＤＭ組和對照組之間的ａ多樣性比較詳見逡逑表邋３－３邋和圖邋３－２．兩組的邋Ｏｂｓｅｒｖｅｄ邋Ｓｐｅｃｉｅｓ邋［８８邋（邋１１，邋２４５）邋ｖｓ．邋１３５邋（１５，邋２５８）邋？邋Ｐ邋＝逡逑０．１６６］；邋Ｃｈａｏ邋１邋指數［１０３．６０邋（１４．００，邋２７２．００）邋ｖｓ．邋１４９．５０邋（２９．００，邋３３９．００），Ｐ邋＝逡逑０．１０７］；邋ＡＣＥ邋指數［１０４．３０邋（１６．５０，４１６．７０）邋ｖｓ．邋１４６．１０邋（４０．７０，４２８．６０），尸＝０＿０７７］；逡逑香農指數［１．７０邋（０．０４，３．４８）邋ｖｓ．邋１．７８邋（０．０１，３．５４），尸＝邋０．５５２］和辛普森指數［０．３１逡逑（０．０６，０．９９）邋ｖｓ．邋０．３８邋（０．０７，１．００），尸＝邋０．３８１］差異無統計學意義，表明了與對逡逑２２逡逑

邐頌士學位論文邐逡逑表３－３．邋ＤＭ組和對照組尿液菌群的ａ多樣性指數比較逡逑Ｔａｂｌｅ邋３－３．邋Ｃｏｍｐａｒｉｓｏｎｓ邋ｏｆ邋Ａｌｐｈａ邋ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ邋ｐａｒａｍｅｔｅｒｓ邋ｏｆ邋ｕｒｉｎａｒｙ邋ｍｉｃｒｏｂｉｏｔａ邋ｉｎ邋ＤＭ邋ｇｒｏｕｐ邋ａｎｄ逡逑ｃｏｎｔｒｏｌ邋ｇｒｏｕｐ．逡逑Ｍ邐ＤＭ邋組（《邋＝邋３２）邐對照組（《邋＝邋２６）邐￣逡逑Ｏｂｓｅｒｖｅｄ邋ｓｐｅｃｉｅｓ邐８８（１１，２４５）邐１３５（１５，２５８）邐０．１６６逡逑Ｃｈａｏ邋１邋指數邐１０３．６０（１４．００，２７２．００）邐１４９．５０（２９．００，３３９．００）邐０．１０７逡逑ＡＣＥ邋指數邐１０４．３０（１６．５０，４１６＿７０）邐１４６．１０（４０．７０，４２８．６０）邐０．０７７逡逑香農指數邐１．７０（０．０４，３．４８）邐１．７８（０．０１，３．５４）邐０．５５２逡逑辛普森指數邐０．３１（０．０６，０．９９）邐０．３８（０．０７，邋１．００）邐０．３８１逡逑注：細菌ａ多樣性的參數以中位數（最小值，最大值）表示。逡逑Ｐａｒａｍｅｔｅｒｓ邋ｏｆ邋ｂａｃｔｅｒｉａｌ邋ａｌｐｈａ邋ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ邋ｗｅｒｅ邋ｒｅｐｏｒｔｅｄ邋ａｓ邋ｍｅｄｉａｎ邋（ｍｉｎｉｍｕｍ，邋ｍａｘｉｍｕｍ）．逡逑ａ邐Ｐ邋＝邋０．１６６邐ｂ邋３５0邐Ｐ＝邋０．１０７邐ｃ邐Ｐ＝邋０．０７７邐ｄ邐Ｐ＝邋０．５５２逡逑ｒ邋￣￣邐￣￣邐３５邋—■—邐—逡逑４００

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本文編號：2714467