尿液代謝組個(gè)體差異的影響因素研究及其在膀胱癌代謝標(biāo)志物篩選中的應(yīng)用
【圖文】:
前需要對(duì)QC樣本重復(fù)進(jìn)樣3-4次,以穩(wěn)定系統(tǒng)。隨后在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中固定頻次進(jìn)逡逑樣QC樣本,共注入32次QC樣本。PCA得分圖顯示前6次QC樣本的差異較大,逡逑隨后系統(tǒng)趨于穩(wěn)定(<t2SD),如圖2a,聚類分析結(jié)果(圖2b)進(jìn)一步證明了QC逡逑數(shù)據(jù)的穩(wěn)定性。以上結(jié)果說(shuō)明質(zhì)譜分析平臺(tái)在樣品分析過(guò)程中具有良好的穩(wěn)定逡逑性和重復(fù)性。逡逑10逡逑
異趨勢(shì)與上訴所有變量的差異趨勢(shì)相似。逡逑2、性別差異逡逑首先應(yīng)用非監(jiān)督聚類的PCA模型初步探索了代謝組的性別差異,見圖3a,,逡逑結(jié)果提示代謝譜可以根據(jù)性別的不同而相對(duì)聚集,即便有部分重合,但是性別逡逑差異依然較為明顯。隨后應(yīng)用監(jiān)督聚類的OPLS-DA模型將性別差異進(jìn)一步區(qū)分逡逑(圖3b)并根據(jù)分類貢獻(xiàn)度篩選出若干性別相關(guān)的差異代謝物(詳見附表1),逡逑其中大約1/3的代謝產(chǎn)物在女性樣本中高表達(dá),包括3-羥基氨基苯甲酸,N-乙酰逡逑氨酸和尿酸,通路分析提示色氨酸代謝,檸檬酸循環(huán),泛酸和輔酶A的生物合逡逑成都與性別相關(guān)(圖3c),而在男性中,類固醇激素的合成通路被激活,但是逡逑差異并不顯著。逡逑為檢測(cè)這些代謝物對(duì)性別的區(qū)分效能,我們采用多參數(shù)ROC曲線進(jìn)行分析逡逑(http://www.metaboanalyst.ca/faces/Secure/upload/RocUploadView.xhtml)。分析發(fā)逡逑現(xiàn)由泛酸,5-羥基吲哚乙酸,3-羥基氨基苯甲酸,酮戊二酸和3-磺基脫氧膽酸組成逡逑的預(yù)測(cè)模型具有較好的預(yù)測(cè)能力
【學(xué)位授予單位】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:R737.14
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本文編號(hào):2660956
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